More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0356 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0356  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  100 
 
 		 603 aa  1221    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0349  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  47.07 
 
 		 599 aa  482  1e-135  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4102  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  28.48 
 
 		 761 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0474  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.46 
 
 		 1469 aa  68.6  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.872336  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2914  ATP-dependent DNA helicase RecQ  25.53 
 
 		 1473 aa  67.4  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0422166 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0351  hypothetical protein  27.59 
 
 		 388 aa  62  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0328547  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28810  putative DNA helicase  28.47 
 
 		 1707 aa  61.2  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0849671  decreased coverage  0.0000000181114 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0621  DNA helicase  28.03 
 
 		 1715 aa  60.8  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_51012  protein required for proper timing of committment to meiotic recombination and the transition from Meiosis I to Meiosis II  33.65 
 
 		 908 aa  60.5  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.875639  normal  0.91244 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2402  UvrD/REP helicase  27.63 
 
 		 1027 aa  59.3  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1037  DNA-dependent helicase II  38.21 
 
 		 726 aa  58.5  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4243  UvrD/REP helicase  28.99 
 
 		 1120 aa  58.5  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3748  UvrD/REP helicase  33.33 
 
 		 1144 aa  57.4  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.355168 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3681  helicase, putative  27.27 
 
 		 552 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.791234  normal  0.0479294 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1422  UvrD/REP helicase  36.57 
 
 		 1089 aa  55.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2878  DNA and RNA helicase  24.36 
 
 		 1050 aa  56.2  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.015904  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07530  DNA/RNA helicase, superfamily I  40.48 
 
 		 694 aa  55.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.565866 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3764  DNA-dependent helicase II  45.59 
 
 		 724 aa  55.5  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0348  DNA helicase  30.16 
 
 		 698 aa  55.1  0.000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00900686  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0080  DNA-dependent helicase II  37.36 
 
 		 724 aa  54.3  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3271  ATP-dependent DNA helicase UvrD  40.66 
 
 		 739 aa  53.9  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1007  UvrD/REP helicase  33 
 
 		 738 aa  53.9  0.000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1890  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36 
 
 		 540 aa  54.3  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4539  UvrD/REP helicase  30.2 
 
 		 1067 aa  54.3  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0898  ATP-dependent helicase PcrA  39.58 
 
 		 634 aa  53.9  0.000009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1415  DNA helicase II  42.03 
 
 		 743 aa  53.9  0.000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1196  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33 
 
 		 738 aa  53.1  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5049  UvrD/REP helicase  31.43 
 
 		 1062 aa  53.5  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0107382 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.96 
 
 		 741 aa  53.5  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1806  DNA-dependent helicase II  43.28 
 
 		 721 aa  52.8  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1807  DNA-dependent helicase II  43.28 
 
 		 721 aa  52.8  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2254  UvrD/REP helicase  35.56 
 
 		 685 aa  52.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.816502  normal  0.58095 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27560  DNA/RNA helicase, superfamily I  38.95 
 
 		 699 aa  52.8  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2224  UvrD/REP helicase  38.54 
 
 		 659 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0167  UvrD/REP helicase  34.43 
 
 		 1161 aa  52.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2424  UvrD/REP helicase  35.71 
 
 		 725 aa  52.8  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0928  UvrD/REP helicase  39.29 
 
 		 876 aa  52.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00200  DNA helicase II  38.04 
 
 		 723 aa  52  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105669  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_979  UvrD/REP helicase  32 
 
 		 738 aa  51.6  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4130  UvrD/REP helicase  32.14 
 
 		 1162 aa  51.6  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.88214 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.33 
 
 		 694 aa  52  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  36.26 
 
 		 724 aa  51.6  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2473  UvrD/REP helicase  35 
 
 		 1162 aa  51.6  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.131096  hitchhiker  0.00644747 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2219  UvrD/REP helicase  42.03 
 
 		 739 aa  51.6  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1585  UvrD/REP helicase  38.1 
 
 		 685 aa  51.6  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.204099  normal  0.422089 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1516  UvrD/REP helicase  41.67 
 
 		 688 aa  51.2  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.200062  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  42.65 
 
 		 678 aa  51.2  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  39.36 
 
 		 707 aa  50.8  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3376  UvrD/REP helicase  37.5 
 
 		 659 aa  50.8  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11370  DNA/RNA helicase, superfamily I  44.44 
 
 		 1094 aa  50.8  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.976622  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3516  hypothetical protein  26.18 
 
 		 768 aa  50.4  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4079  DNA helicase II  35.87 
 
 		 724 aa  50.8  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4147  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.46 
 
 		 670 aa  50.4  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0515139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0461  UvrD/REP helicase  41.18 
 
 		 726 aa  50.4  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1682  UvrD/REP helicase  37.68 
 
 		 743 aa  49.7  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4015  DNA-dependent helicase II  32.52 
 
 		 722 aa  50.4  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3818  DNA-dependent helicase II  32.52 
 
 		 722 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0317  UvrD/REP helicase  35.79 
 
 		 1032 aa  49.7  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.907606  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1719  UvrD/REP helicase  36.08 
 
 		 646 aa  49.7  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.571128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2560  UvrD/REP helicase  27.42 
 
 		 553 aa  50.1  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.232934 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0621  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40 
 
 		 659 aa  50.1  0.0001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.12705  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3373  DNA-dependent helicase II  32.52 
 
 		 722 aa  50.1  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0047  ATP-dependent DNA helicase Rep  32.29 
 
 		 849 aa  50.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.760315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0473  DNA-dependent helicase II  32.52 
 
 		 722 aa  50.1  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  44.23 
 
 		 807 aa  50.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0469  DNA-dependent helicase II  32.52 
 
 		 722 aa  50.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.154526  normal  0.949387 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.54 
 
 		 763 aa  49.7  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3892  DNA-dependent helicase II  32.52 
 
 		 722 aa  50.4  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0441  DNA-dependent helicase II  32.52 
 
 		 722 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419194  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4162  DNA-dependent helicase II  42.65 
 
 		 720 aa  50.1  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0353617  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0305  ATP-dependent DNA helicase Rep  28 
 
 		 670 aa  50.1  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4665  UvrD/REP helicase  45.21 
 
 		 1091 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.6139  normal  0.718694 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3971  DNA-dependent helicase II  42.65 
 
 		 720 aa  48.9  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0467  DNA-dependent helicase II  36.26 
 
 		 722 aa  48.9  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0064  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  36.36 
 
 		 689 aa  49.3  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0780  UvrD/REP helicase  38.64 
 
 		 1192 aa  49.3  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.15427  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2868  ATP-dependent DNA helicase Rep  40.62 
 
 		 665 aa  49.3  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2731  ATP-dependent DNA helicase Rep  40.62 
 
 		 665 aa  49.3  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1347  rep helicase, single-stranded DNA-dependent ATPase protein  39.13 
 
 		 154 aa  49.7  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4498  DNA-dependent helicase II  36.26 
 
 		 721 aa  48.9  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0025295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf847  ATP-dependent DNA helicase  42.42 
 
 		 726 aa  49.7  0.0002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.710587  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  38.14 
 
 		 746 aa  49.3  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3558  DNA-dependent helicase II  32.79 
 
 		 722 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.231339  normal  0.569551 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0537  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.78 
 
 		 711 aa  49.3  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0674  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.62 
 
 		 734 aa  49.3  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000320  DNA helicase IV  38.82 
 
 		 689 aa  49.3  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1508  UvrD/REP helicase  39.13 
 
 		 1060 aa  49.3  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0419  DNA-dependent helicase II  36.26 
 
 		 721 aa  49.7  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.590239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0008  UvrD/REP helicase  35.87 
 
 		 723 aa  49.3  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.680024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3362  UvrD family helicase  32.98 
 
 		 630 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.753608  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0186  DNA-dependent helicase II  42.65 
 
 		 723 aa  48.9  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00520  DNA-dependent helicase II  42.65 
 
 		 726 aa  48.9  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.851543  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0043  DNA-dependent helicase II  38.95 
 
 		 723 aa  48.5  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.779926  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3792  UvrD/REP helicase  33.7 
 
 		 736 aa  48.5  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.976756  normal  0.84533 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0860  UvrD/Rep family helicase  25.68 
 
 		 639 aa  48.5  0.0003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1202  ATP-dependent DNA helicase Rep  38.27 
 
 		 690 aa  48.5  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15090  DNA/RNA helicase, superfamily I  28.96 
 
 		 1176 aa  48.5  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  32.5 
 
 		 625 aa  48.9  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1033  DNA helicase IV  38.3 
 
 		 684 aa  48.9  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0811314  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3385  DNA-dependent helicase II  36.26 
 
 		 726 aa  48.9  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>