277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2041 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2041  transglutaminase domain protein  100 
 
 		 336 aa  691    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2177  transglutaminase domain protein  94.35 
 
 		 336 aa  628  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2537  transglutaminase domain-containing protein  73.02 
 
 		 337 aa  498  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.243337  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1086  transglutaminase-like  67.36 
 
 		 338 aa  489  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506332  hitchhiker  0.0000050405 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04340  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  46.25 
 
 		 392 aa  275  8e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550212 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2128  transglutaminase domain protein  43.07 
 
 		 362 aa  242  5e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1405  transglutaminase family protein  38.99 
 
 		 379 aa  216  4e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2969  transglutaminase domain-containing protein  38.56 
 
 		 379 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0119  hypothetical protein  36.47 
 
 		 361 aa  212  9e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2790  twin-arginine translocation pathway signal  38.68 
 
 		 379 aa  211  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2873  twin-arginine translocation pathway signal  38.24 
 
 		 379 aa  211  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3060  transglutaminase domain-containing protein  35.93 
 
 		 380 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2064  DNA-binding response regulator  37.78 
 
 		 359 aa  209  7e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0699486  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3074  transglutaminase domain-containing protein  34.42 
 
 		 380 aa  209  7e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.926673  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1303  transglutaminase domain protein  34.72 
 
 		 380 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.403098  normal  0.79746 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3217  transglutaminase domain-containing protein  37.11 
 
 		 380 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.177861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2413  transglutaminase-like  37.81 
 
 		 369 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329453  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2861  transglutaminase domain-containing protein  35.67 
 
 		 366 aa  182  8.000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.816183  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1343  transglutaminase domain-containing protein  33.24 
 
 		 369 aa  164  3e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2396  transglutaminase-like  32.72 
 
 		 328 aa  159  5e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0665  transglutaminase domain-containing protein  38.06 
 
 		 371 aa  156  5.0000000000000005e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.713396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0642  transglutaminase domain protein  33.45 
 
 		 383 aa  152  8e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2938  transglutaminase domain-containing protein  30.82 
 
 		 373 aa  147  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.135746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3586  transglutaminase domain-containing protein  30.65 
 
 		 363 aa  135  9e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1221  transglutaminase-like  28.74 
 
 		 432 aa  134  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.416266 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0138  transglutaminase domain protein  26.71 
 
 		 320 aa  119  7.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.792413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2907  hypothetical protein  26.57 
 
 		 301 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.850064  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0089  transglutaminase-like domain-containing protein  25.94 
 
 		 559 aa  90.5  4e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.890892  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0260  transglutaminase domain-containing protein  26.59 
 
 		 350 aa  88.2  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.20446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11690  hypothetical protein  24.23 
 
 		 310 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.556512  normal  0.379907 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1555  transglutaminase-like  30.81 
 
 		 500 aa  80.9  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.047572  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1902  transglutaminase domain protein  28.78 
 
 		 631 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.37601  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1168  transglutaminase domain-containing protein  34.07 
 
 		 634 aa  67.8  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  31.58 
 
 		 1305 aa  65.9  0.0000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3234  transglutaminase domain-containing protein  27.73 
 
 		 818 aa  65.9  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00597045 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4917  transglutaminase domain-containing protein  28.99 
 
 		 794 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.428939  normal  0.508817 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0587  transglutaminase domain-containing protein  25.09 
 
 		 571 aa  64.3  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0110498  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3274  transglutaminase domain protein  28.02 
 
 		 792 aa  63.5  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2203  membrane-bound protease, putative  27.73 
 
 		 742 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1117  transglutaminase domain protein  33.57 
 
 		 720 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1137  transglutaminase domain-containing protein  29.91 
 
 		 507 aa  61.2  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2132  putative membrane-bound protease  24.77 
 
 		 742 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3460  transglutaminase domain-containing protein  31.97 
 
 		 822 aa  60.8  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0458672 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2272  putative membrane-bound protease  26.48 
 
 		 635 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1972  membrane-bound protease  26.36 
 
 		 742 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.608731  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1951  transglutaminase superfamily protease  26.36 
 
 		 742 aa  60.5  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2155  putative membrane-bound protease  26.36 
 
 		 742 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2120  membrane-bound protease  26.36 
 
 		 742 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.901767  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3183  putative membrane-bound protease  24.3 
 
 		 742 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1927  transglutaminase superfamily protease  26.36 
 
 		 742 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0890481  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2417  hypothetical protein  32.47 
 
 		 269 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1711  transglutaminase domain protein  31.75 
 
 		 806 aa  59.3  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0236  transglutaminase domain protein  32.33 
 
 		 728 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0998  transglutaminase domain-containing protein  30 
 
 		 762 aa  58.2  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.2813 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1966  transglutaminase domain-containing protein  26.36 
 
 		 742 aa  58.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.524806  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2177  transglutaminase domain-containing protein  35 
 
 		 391 aa  57  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1078  transglutaminase domain protein  31.2 
 
 		 862 aa  56.6  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2903  transglutaminase domain protein  38.24 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0573508  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1888  transglutaminase domain-containing protein  34.17 
 
 		 391 aa  56.2  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  29.86 
 
 		 681 aa  56.2  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2238  transglutaminase-like  26.58 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.912675  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4224  transglutaminase domain protein  27.48 
 
 		 515 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.849724  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0009  transglutaminase domain-containing protein  27.83 
 
 		 467 aa  55.5  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.906543  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0165  transglutaminase domain protein  30.09 
 
 		 436 aa  55.5  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.665704  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  32.84 
 
 		 730 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0562  transglutaminase domain protein  34.96 
 
 		 398 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.567565  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2938  transglutaminase domain protein  25 
 
 		 810 aa  54.3  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00806271  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3168  transglutaminase domain protein  35.29 
 
 		 274 aa  54.3  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.837048 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3273  transglutaminase domain-containing protein  37.5 
 
 		 316 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0832457  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1080  transglutaminase domain-containing protein  33.9 
 
 		 269 aa  54.3  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3218  transglutaminase-like  23.67 
 
 		 274 aa  53.9  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2773  transglutaminase-like protein  38.1 
 
 		 749 aa  53.9  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.663199  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6765  transglutaminase domain-containing protein  26.34 
 
 		 278 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.935495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0245  transglutaminase domain-containing protein  31.37 
 
 		 826 aa  53.5  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.894287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1056  transglutaminase-like protein  32.52 
 
 		 890 aa  53.1  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  28.37 
 
 		 280 aa  53.1  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0930  transglutaminase domain-containing protein  31.09 
 
 		 730 aa  53.1  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3240  transglutaminase domain-containing protein  33.93 
 
 		 492 aa  53.1  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4178  transglutaminase domain-containing protein  28.83 
 
 		 485 aa  52.8  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00683366  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1208  transglutaminase domain-containing protein  24.79 
 
 		 831 aa  52.8  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2254  transglutaminase domain protein  37.33 
 
 		 308 aa  52.8  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000580193 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4199  transglutaminase domain protein  26.15 
 
 		 515 aa  52.8  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.148466  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1321  transglutaminase domain protein  43.24 
 
 		 632 aa  52.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0315  transglutaminase domain-containing protein  30.87 
 
 		 815 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072892  normal  0.0490481 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02438  hypothetical protein  40 
 
 		 635 aa  51.2  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2266  transglutaminase-like  38.46 
 
 		 300 aa  51.2  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  34.72 
 
 		 311 aa  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  28.99 
 
 		 744 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1649  transglutaminase domain protein  27.87 
 
 		 914 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.987605 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0582  transglutaminase domain-containing protein  42.37 
 
 		 275 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2469  transglutaminase domain protein  42.62 
 
 		 275 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340077  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  34.12 
 
 		 285 aa  50.8  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2638  transglutaminase-like  38.46 
 
 		 299 aa  51.2  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.947389  normal  0.655724 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3159  transglutaminase-like  26.14 
 
 		 279 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3474  transglutaminase domain-containing protein  32.06 
 
 		 528 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.934792  normal  0.0999002 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5778  transglutaminase domain protein  23.63 
 
 		 815 aa  50.4  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131125  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2962  transglutaminase domain protein  41.89 
 
 		 632 aa  50.4  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0859741 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4075  transglutaminase domain-containing protein  32.89 
 
 		 287 aa  50.4  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.399957 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  45.59 
 
 		 943 aa  50.4  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1674  transglutaminase-like superfamily protein  31.31 
 
 		 767 aa  50.1  0.00005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>