45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3526 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3526  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 459 aa  952    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3392  putative transcriptional regulator  59.35 
 
 		 460 aa  541  1e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0538  putative transcriptional regulator  41.58 
 
 		 622 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.141611  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0490  putative transcriptional regulator  40.89 
 
 		 504 aa  174  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0362004 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5660  putative transcriptional regulator  37.68 
 
 		 643 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0904  divergent AAA domain protein  37.05 
 
 		 543 aa  166  9e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0052  putative transcriptional regulator  37.67 
 
 		 656 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0048  putative transcriptional regulator  37.22 
 
 		 656 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4173  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 663 aa  149  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.219897  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1961  putative transcriptional regulator  37.05 
 
 		 515 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2458  putative transcriptional regulator  23.47 
 
 		 619 aa  81.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0168743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0482  divergent AAA ATP  26.82 
 
 		 475 aa  73.6  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0182  putative transcriptional regulator  21.26 
 
 		 606 aa  70.1  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  30.94 
 
 		 455 aa  58.9  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  30.06 
 
 		 386 aa  57.4  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  30.64 
 
 		 396 aa  56.6  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1518  putative transcriptional regulator  21.43 
 
 		 498 aa  56.2  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  28.25 
 
 		 433 aa  55.5  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3608  putative transcriptional regulator  35.53 
 
 		 628 aa  53.9  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.78709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0507  divergent AAA ATPase  21.7 
 
 		 483 aa  52.8  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2890  putative transcriptional regulator  25.74 
 
 		 389 aa  52.8  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3153  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 		 611 aa  53.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880898  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0085  putative transcriptional regulator  35 
 
 		 641 aa  53.1  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  35.24 
 
 		 545 aa  51.6  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  34.07 
 
 		 448 aa  50.8  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1448  putative transcriptional regulator  23.93 
 
 		 499 aa  50.4  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0799  putative transcriptional regulator  26.58 
 
 		 374 aa  50.4  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0081  putative transcriptional regulator  22.18 
 
 		 485 aa  50.1  0.00009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  32.97 
 
 		 448 aa  49.7  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  21.03 
 
 		 687 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  25.98 
 
 		 561 aa  47.8  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0004  putative transcriptional regulator  34.83 
 
 		 568 aa  48.1  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2681  transcriptional regulator  38.57 
 
 		 634 aa  48.1  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2841  putative transcriptional regulator  18.89 
 
 		 458 aa  47.8  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  32.38 
 
 		 456 aa  47  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  36.59 
 
 		 480 aa  46.2  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0343  AAA-4 family protein  31.43 
 
 		 548 aa  46.2  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3556  putative transcriptional regulator  23.25 
 
 		 620 aa  45.8  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1179  putative transcriptional regulator  23.25 
 
 		 620 aa  45.8  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0499  hypothetical protein  24.1 
 
 		 314 aa  45.4  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.12041 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  36.59 
 
 		 480 aa  45.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0734  hypothetical protein  24.1 
 
 		 322 aa  44.7  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313074 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4927  ATP-dependent DNA helicase recG  32 
 
 		 198 aa  44.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 502 aa  43.5  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  29.89 
 
 		 471 aa  43.1  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>