More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2047 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  55.62 
 
 		 882 aa  711    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0225  translation initiation factor IF-2  56.13 
 
 		 887 aa  644    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  61.58 
 
 		 888 aa  728    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  55.8 
 
 		 883 aa  716    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0570  translation initiation factor IF-2  58.93 
 
 		 928 aa  646    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  56.57 
 
 		 896 aa  660    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  62.03 
 
 		 720 aa  914    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2990  translation initiation factor IF-2  54.96 
 
 		 953 aa  653    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.292743  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  55.56 
 
 		 964 aa  655    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  69.96 
 
 		 686 aa  979    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1208  translation initiation factor IF-2  54.98 
 
 		 658 aa  635    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000392009  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  60.33 
 
 		 985 aa  769    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0381  translation initiation factor IF-2  63.71 
 
 		 927 aa  774    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3035  translation initiation factor IF-2  51.93 
 
 		 884 aa  640    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.19789  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1012  translation initiation factor IF-2  56.67 
 
 		 854 aa  654    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000897592  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  69.28 
 
 		 686 aa  973    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  69.69 
 
 		 686 aa  976    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl295  translation initiation factor IF-2  56.7 
 
 		 629 aa  640    Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000364465  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  69.69 
 
 		 686 aa  976    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  56.1 
 
 		 975 aa  660    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3751  translation initiation factor IF-2  55.06 
 
 		 729 aa  647    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00372327  unclonable  0.0000243777 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  71.55 
 
 		 705 aa  858    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  55.93 
 
 		 975 aa  659    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  50 
 
 		 904 aa  637    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  53.65 
 
 		 986 aa  713    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2028  translation initiation factor IF-2  56.05 
 
 		 966 aa  648    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  52.92 
 
 		 922 aa  671    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1867  translation initiation factor IF-2  56.48 
 
 		 1038 aa  640    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  55.93 
 
 		 975 aa  658    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  55.54 
 
 		 964 aa  659    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2710  translation initiation factor IF-2  57.07 
 
 		 992 aa  635    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  58.4 
 
 		 947 aa  706    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  54.66 
 
 		 972 aa  641    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1779  translation initiation factor IF-2  54.7 
 
 		 915 aa  636    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0123912  normal  0.0703365 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  70.54 
 
 		 689 aa  986    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1462  translation initiation factor IF-2  55.48 
 
 		 1022 aa  639    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.887341  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0699  translation initiation factor IF-2  55.97 
 
 		 752 aa  830    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000680705  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  58.29 
 
 		 884 aa  707    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  56.1 
 
 		 984 aa  687    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  69.28 
 
 		 686 aa  973    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  69.96 
 
 		 686 aa  979    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2020  translation initiation factor IF-2  53.71 
 
 		 1030 aa  647    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.340482 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1864  translation initiation factor IF-2  53.96 
 
 		 876 aa  635    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  60.69 
 
 		 1131 aa  698    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3781  translation initiation factor IF-2  47.27 
 
 		 873 aa  639    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322768  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  56.59 
 
 		 903 aa  786    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  55.93 
 
 		 976 aa  655    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  55.93 
 
 		 975 aa  658    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1921  translation initiation factor IF-2  55.73 
 
 		 948 aa  646    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0602032 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2513  translation initiation factor IF-2  59.53 
 
 		 1079 aa  677    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2749  translation initiation factor IF-2  54.53 
 
 		 990 aa  635    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.867679  normal  0.130193 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  56.87 
 
 		 907 aa  675    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2426  translation initiation factor IF-2  52.7 
 
 		 968 aa  636    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0271781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  55.52 
 
 		 989 aa  654    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1632  translation initiation factor IF-2  55.93 
 
 		 986 aa  656    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141337 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1132  translation initiation factor IF-2  55.3 
 
 		 738 aa  645    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00703147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  49.04 
 
 		 895 aa  636    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  56.1 
 
 		 975 aa  660    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  54.91 
 
 		 979 aa  662    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  56.1 
 
 		 975 aa  660    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0599  translation initiation factor IF-2  56.42 
 
 		 1042 aa  639    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  54.15 
 
 		 971 aa  647    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  54.15 
 
 		 971 aa  646    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1411  translation initiation factor 2  58.76 
 
 		 689 aa  648    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  56.1 
 
 		 975 aa  660    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  71.55 
 
 		 705 aa  858    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  78.12 
 
 		 688 aa  918    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  62.2 
 
 		 679 aa  739    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  62.2 
 
 		 679 aa  739    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  64.05 
 
 		 692 aa  756    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3976  translation initiation factor 2  55.94 
 
 		 1059 aa  648    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0300  translation initiation factor IF-2  54.78 
 
 		 952 aa  641    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0137727  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  57.74 
 
 		 949 aa  685    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1948  translation initiation factor IF-2  50.31 
 
 		 883 aa  641    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0536071 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1444  translation initiation factor 2 (bIF-2)  50.34 
 
 		 673 aa  715    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000295252  normal  0.305972 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  57.77 
 
 		 882 aa  739    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  54.8 
 
 		 971 aa  650    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0817  translation initiation factor IF-2  61.23 
 
 		 950 aa  742    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0433  translation initiation factor IF-2  58.74 
 
 		 829 aa  724    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0814  translation initiation factor IF-2  62.86 
 
 		 882 aa  786    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0318288 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1355  translation initiation factor IF-2  55.37 
 
 		 834 aa  750    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.723459  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0383  translation initiation factor IF-2  65.2 
 
 		 943 aa  783    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0555  translation initiation factor IF-2  51.21 
 
 		 875 aa  641    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.218131  normal  0.382755 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  54.15 
 
 		 971 aa  646    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  53.58 
 
 		 962 aa  657    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  53.65 
 
 		 949 aa  685    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0402  translation initiation factor IF-2  55 
 
 		 911 aa  635    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000176778  normal  0.341297 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1701  translation initiation factor IF-2  55.13 
 
 		 991 aa  637    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192656 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0391  translation initiation factor IF-2  51.21 
 
 		 875 aa  641    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  56.86 
 
 		 921 aa  694    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1692  translation initiation factor IF-2  49.57 
 
 		 968 aa  648    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  54.77 
 
 		 969 aa  652    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  54.9 
 
 		 972 aa  648    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  69.69 
 
 		 686 aa  975    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  55.37 
 
 		 965 aa  653    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0991  translation initiation factor 2  64.85 
 
 		 1035 aa  714    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0315386  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  59.49 
 
 		 1079 aa  696    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3383  translation initiation factor IF-2  54.88 
 
 		 943 aa  643    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  51.9 
 
 		 992 aa  644    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2561  translation initiation factor IF-2  55.75 
 
 		 943 aa  656    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334789  normal  0.0201615 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>