208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0566 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0566  glutaredoxin family protein  100 
 
 		 83 aa  174  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.113719  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2959  glutaredoxin-like protein, YruB  75.61 
 
 		 168 aa  142  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3366  glutaredoxin  60.76 
 
 		 191 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  50 
 
 		 116 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3678  hypothetical protein  49.3 
 
 		 127 aa  80.5  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1264  glutaredoxin NrdH  50.77 
 
 		 70 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0898475  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1082  glutaredoxin  50.75 
 
 		 116 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.976199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3551  glutaredoxin  44.29 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.292963  normal  0.115871 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1155  glutaredoxin family protein  37.66 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.698901  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4099  glutaredoxin  35.06 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  36.49 
 
 		 82 aa  59.3  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2413  glutaredoxin-like protein, YruB  33.73 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000497868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  36 
 
 		 81 aa  56.2  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1969  hypothetical protein  41.67 
 
 		 58 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  40 
 
 		 384 aa  54.7  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0505  glutaredoxin-like protein, YruB-family  36 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  37.5 
 
 		 80 aa  54.3  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0552  YruB family glutaredoxin-like protein  35.62 
 
 		 80 aa  54.3  0.0000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2340  glutaredoxin  38.36 
 
 		 78 aa  53.9  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  36.11 
 
 		 80 aa  53.5  0.0000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1508  glutaredoxin  32.39 
 
 		 76 aa  53.5  0.0000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114631  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0120  glutaredoxin  40.91 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3793  glutaredoxin-like protein GlrX  41.82 
 
 		 79 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565911  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2632  glutaredoxin 3  40.62 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2358  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  36.23 
 
 		 81 aa  51.2  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.543231  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2960  YruB family glutaredoxin-like protein  35 
 
 		 125 aa  51.2  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000757136  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4233  glutaredoxin-like protein  35.71 
 
 		 87 aa  50.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2470  glutaredoxin-like protein  42.11 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0277033  hitchhiker  0.00220666 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2119  glutaredoxin-like protein NrdH  36.23 
 
 		 81 aa  50.4  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000183339 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0521  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  32.35 
 
 		 73 aa  50.4  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.317341  normal  0.144081 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10470  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  33.82 
 
 		 81 aa  50.1  0.000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00700177  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0235  YruB family glutaredoxin-like protein  35.14 
 
 		 76 aa  50.4  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003681  glutaredoxin  37.5 
 
 		 76 aa  50.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1194  glutaredoxin  39.06 
 
 		 85 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0934  glutaredoxin-like protein  43.64 
 
 		 79 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764967  normal  0.602871 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2855  glutaredoxin 3  39.06 
 
 		 85 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.995757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1408  glutaredoxin-like protein GlrX  38.18 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611823  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2898  glutaredoxin-like protein  36.21 
 
 		 86 aa  48.9  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0792197  normal  0.021739 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1426  glutaredoxin-like protein  38.18 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1462  glutaredoxin-like protein  38.18 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2050  glutaredoxin-like protein  34.48 
 
 		 85 aa  49.7  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5740  glutaredoxin  30.16 
 
 		 81 aa  48.9  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.574566  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2903  glutaredoxin GrxC  40 
 
 		 85 aa  48.5  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.844851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2749  YruB family glutaredoxin-like protein  31.58 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2435  YruB family glutaredoxin-like protein  31.58 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1777  YruB family glutaredoxin-like protein  31.94 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.110535  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2967  glutaredoxin-like protein  31.94 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1323  YruB family glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0672581  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1344  YruB family glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 		 84 aa  48.1  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2509  glutaredoxin 3  36.92 
 
 		 85 aa  48.9  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281464  normal  0.240151 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0829  glutaredoxin  34.38 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1719  YruB family glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0803  glutaredoxin-like protein NrdH  36.23 
 
 		 79 aa  48.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.815074 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0640  putative glutaredoxin  31.51 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189959  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2324  glutaredoxin-like protein  32.76 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.365889  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4375  glutaredoxin-like protein NrdH  32.35 
 
 		 73 aa  47.8  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0354  glutaredoxin-like protein NrdH  38.24 
 
 		 74 aa  47.8  0.00005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0034  glutaredoxin-like protein, YruB-family  33.33 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0292  glutaredoxin  33.33 
 
 		 75 aa  47.4  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2952  glutaredoxin-like protein NrdH  33.82 
 
 		 73 aa  47.4  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.794387  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  40 
 
 		 383 aa  47.4  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0785  glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 		 81 aa  47.4  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.315342  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4661  glutaredoxin-like protein  41.03 
 
 		 83 aa  47  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.319136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0529  glutaredoxin-like protein GlrX  36.36 
 
 		 86 aa  47  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  42.42 
 
 		 85 aa  47  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1065  glutaredoxin-related protein NrdH  31.51 
 
 		 78 aa  47  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0223724  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  31.58 
 
 		 391 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02143  glutaredoxin  33.77 
 
 		 75 aa  46.2  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3540  glutaredoxin-related protein NrdH  31.51 
 
 		 78 aa  47  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00255736  hitchhiker  0.0090017 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  43.08 
 
 		 85 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3376  glutaredoxin  33.82 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2665  glutaredoxin  32.81 
 
 		 84 aa  47  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1119  glutaredoxin-like protein NrdH  31.51 
 
 		 78 aa  47  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.556674  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0290  glutaredoxin-like protein nrdH  33.33 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0883091  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5216  glutaredoxin 3  38.1 
 
 		 85 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.112627  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1547  glutaredoxin, GrxC  35.94 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0884  glutaredoxin  35.29 
 
 		 121 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1772  glutaredoxin-like protein  35.71 
 
 		 89 aa  46.2  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.16885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02541  glutaredoxin  35.94 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2439  glutaredoxin-like protein NrdH  32.35 
 
 		 79 aa  45.4  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.354839  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1427  YruB family glutaredoxin-like protein  31.94 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00494984  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3541  glutaredoxin 3  36.23 
 
 		 110 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00379467 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0314  glutaredoxin-like protein nrdH  32.35 
 
 		 73 aa  45.4  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.24062  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2899  glutaredoxin-like protein, YruB-family  30.88 
 
 		 81 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5953  glutaredoxin 3  39.68 
 
 		 85 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694003  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  39.68 
 
 		 85 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1178  glutaredoxin-like protein  31.75 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.975615  normal  0.0647331 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  35.94 
 
 		 86 aa  45.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1584  glutaredoxin  31.17 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0205634  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3613  glutaredoxin 3  34.92 
 
 		 85 aa  45.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842003  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3209  glutaredoxin 3  31.58 
 
 		 83 aa  45.4  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.28852 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1223  putative glutaredoxin  37.31 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0071  glutaredoxin  33.9 
 
 		 86 aa  45.1  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00875586 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10180  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  31.88 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.521827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  34.92 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3985  glutaredoxin  35.14 
 
 		 266 aa  44.7  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28691  normal  0.032093 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1148  glutaredoxin-like protein NrdH  28.36 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1496  glutaredoxin 3  35.94 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1835  glutaredoxin GrxC  32.84 
 
 		 86 aa  44.3  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0496  glutaredoxin  35.48 
 
 		 84 aa  44.7  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.460095  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>