More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5736 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5736  NLP/P60 protein  100 
 
 		 326 aa  640    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  59.46 
 
 		 366 aa  301  9e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  54.97 
 
 		 347 aa  298  1e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5739  NLP/P60 protein  52.97 
 
 		 367 aa  211  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  54.68 
 
 		 392 aa  207  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  51.36 
 
 		 368 aa  205  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1612  NLP/P60  81.69 
 
 		 200 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.676409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11930  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  43.45 
 
 		 176 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4554  NLP/P60 protein  44.74 
 
 		 286 aa  116  6e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3552  NLP/P60 protein  46.09 
 
 		 297 aa  108  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.01109  normal  0.684862 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  46.72 
 
 		 340 aa  106  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  44.55 
 
 		 417 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  48.62 
 
 		 374 aa  103  4e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  50 
 
 		 306 aa  102  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  49.06 
 
 		 438 aa  102  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  43.9 
 
 		 332 aa  102  7e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  49 
 
 		 452 aa  102  8e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  43.64 
 
 		 459 aa  98.2  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  41.21 
 
 		 333 aa  97.4  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  44.64 
 
 		 432 aa  96.3  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  46.08 
 
 		 337 aa  95.1  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  44.09 
 
 		 398 aa  94.4  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  48.39 
 
 		 366 aa  93.2  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  44.86 
 
 		 453 aa  92.8  8e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  50 
 
 		 345 aa  92  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  38.46 
 
 		 321 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  47.73 
 
 		 337 aa  91.7  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  39.13 
 
 		 236 aa  91.3  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  46.15 
 
 		 370 aa  91.7  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  37.01 
 
 		 388 aa  90.5  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1243  NLP/P60 protein  39.02 
 
 		 169 aa  90.5  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.215255  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8103  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  45.87 
 
 		 393 aa  90.5  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2844  NLP/P60 protein  42.62 
 
 		 259 aa  90.1  5e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  40.8 
 
 		 342 aa  89.4  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0773  NLP/P60 protein  41.59 
 
 		 256 aa  89  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2096  NLP/P60 protein  45.83 
 
 		 375 aa  88.6  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.685486  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  39.84 
 
 		 391 aa  89  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 350 aa  87.8  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4506  NLP/P60 protein  44.07 
 
 		 501 aa  88.2  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.918319  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  49.44 
 
 		 293 aa  88.2  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4086  NLP/P60 protein  41.94 
 
 		 517 aa  87.4  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.296945 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  41.27 
 
 		 217 aa  87  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  44.95 
 
 		 325 aa  87  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  40 
 
 		 388 aa  86.3  7e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  37.27 
 
 		 1048 aa  85.9  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 308 aa  85.5  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  46.07 
 
 		 373 aa  85.1  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0926  Tn916, NLP/P60 family protein  53.57 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  41.82 
 
 		 162 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  43.43 
 
 		 211 aa  85.5  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  42.98 
 
 		 302 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 327 aa  84.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0570  NLP/P60 protein  48.62 
 
 		 160 aa  84.7  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0888  NLP/P60 protein  42.62 
 
 		 363 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  37.7 
 
 		 394 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  37.93 
 
 		 374 aa  84  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  36.5 
 
 		 278 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1561  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  42.5 
 
 		 337 aa  84  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  36.67 
 
 		 368 aa  83.6  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30760  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  44.68 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.787895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  43.56 
 
 		 390 aa  83.2  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  44.68 
 
 		 432 aa  83.2  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  45.83 
 
 		 424 aa  83.2  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  38.81 
 
 		 370 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  45.88 
 
 		 333 aa  82.8  0.000000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  44.68 
 
 		 432 aa  82.8  0.000000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  39.69 
 
 		 181 aa  82.4  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  36.43 
 
 		 317 aa  81.6  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0045  NlpC/P60 family domain protein  46.36 
 
 		 174 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000018046  normal  0.424193 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  40.65 
 
 		 291 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  36.84 
 
 		 329 aa  82.4  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  35.71 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  34.81 
 
 		 267 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  36.29 
 
 		 531 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3076  NLP/P60 protein  44.34 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3074  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 116 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  37.38 
 
 		 180 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  41.94 
 
 		 400 aa  81.6  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1987  NLP/P60 protein  39.82 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  28.65 
 
 		 269 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  40 
 
 		 475 aa  81.3  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  42.42 
 
 		 202 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  45.28 
 
 		 319 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  39.29 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  42.55 
 
 		 335 aa  80.9  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  47.95 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  41.76 
 
 		 347 aa  80.5  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15430  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  39.42 
 
 		 146 aa  80.5  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0612383  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  37.74 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  39.67 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 327 aa  80.5  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2747  NLP/P60 protein  45.71 
 
 		 327 aa  80.1  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4570  NLP/P60 protein  42.55 
 
 		 363 aa  80.1  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5385  NLP/P60 protein  40.18 
 
 		 363 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2429  NLP/P60 protein  34.07 
 
 		 278 aa  79.7  0.00000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.328079 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  37.19 
 
 		 331 aa  79.3  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5661  NLP/P60 protein  38.76 
 
 		 348 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  38.6 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  41.51 
 
 		 476 aa  79.3  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2555  NLP/P60 protein  41.32 
 
 		 199 aa  79.3  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.916687 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>