More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4172 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4172  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 147 aa  296  6e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000168558  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2274  AsnC family transcriptional regulator  83.09 
 
 		 136 aa  231  3e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321724  hitchhiker  0.000620833 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  74.83 
 
 		 143 aa  221  3e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  73.29 
 
 		 158 aa  218  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1813  AsnC family transcriptional regulator  71.92 
 
 		 182 aa  216  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2660  AsnC family transcriptional regulator  66.9 
 
 		 150 aa  199  9e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0584883  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2259  transcriptional regulator, AsnC family  66.67 
 
 		 149 aa  192  9e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000534286  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2378  AsnC family transcriptional regulator  65.75 
 
 		 168 aa  192  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258345  hitchhiker  0.0022466 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2259  AsnC/Lrp family regulatory protein  65.07 
 
 		 165 aa  189  9e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.25142  normal  0.0557918 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2941  transcriptional regulator, AsnC family  63.89 
 
 		 158 aa  187  5e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000077861  hitchhiker  0.000100592 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  62.68 
 
 		 149 aa  186  8e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21870  transcriptional regulator, AsnC family  65.07 
 
 		 151 aa  185  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16811  normal  0.0441488 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3176  transcriptional regulator, AsnC family  60.96 
 
 		 156 aa  179  9.000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000237369  hitchhiker  0.000000000657439 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2696  transcriptional regulator, AsnC family  62.68 
 
 		 161 aa  166  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.201688  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13320  AsnC family transcriptional regulator  57.04 
 
 		 150 aa  160  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14050  transcriptional regulator, AsnC family  56.64 
 
 		 156 aa  157  4e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00148538  normal  0.352313 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1645  AsnC family transcriptional regulator  55.63 
 
 		 156 aa  152  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.13365  normal  0.462855 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4797  AsnC family transcriptional regulator  54.23 
 
 		 159 aa  150  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.099377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1271  AsnC family transcriptional regulator  57.04 
 
 		 166 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1288  AsnC family transcriptional regulator  57.04 
 
 		 166 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.15459  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1298  AsnC family transcriptional regulator  57.04 
 
 		 160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.408697  normal  0.183979 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01030  transcriptional regulator, AsnC family  50.69 
 
 		 152 aa  140  6e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  47.22 
 
 		 153 aa  128  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  45.45 
 
 		 167 aa  123  8.000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  47.26 
 
 		 156 aa  123  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  43.75 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  43.06 
 
 		 152 aa  120  6e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0112  transcriptional regulator, AsnC family  44.29 
 
 		 153 aa  120  7e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1426  transcriptional regulator  43.26 
 
 		 144 aa  120  7e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 152 aa  120  9e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4114  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  35.71 
 
 		 144 aa  100  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2774  AsnC family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 156 aa  96.3  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.587297 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  35.86 
 
 		 155 aa  94.4  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0996907 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 149 aa  94.4  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4616  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 		 175 aa  94  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.527388 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3579  transcriptional regulator, AsnC family  38.1 
 
 		 154 aa  92.4  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  35.77 
 
 		 151 aa  91.3  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2359  transcriptional regulator, AsnC family  39.33 
 
 		 167 aa  91.3  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.307081  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  35.37 
 
 		 149 aa  90.9  5e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0987  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 153 aa  90.5  8e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2044  transcriptional regulator, AsnC family  33.1 
 
 		 158 aa  89.7  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1330  transcriptional regulator, AsnC family  38.03 
 
 		 151 aa  89.4  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180396  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  40.5 
 
 		 153 aa  88.6  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 170 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  39.02 
 
 		 162 aa  89  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 170 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 153 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 155 aa  88.6  3e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  35.21 
 
 		 148 aa  88.6  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7362  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 169 aa  88.2  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0360859  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4183  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 195 aa  88.2  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  41.32 
 
 		 153 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 153 aa  88.2  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0407  leucine-responsive regulatory protein  39.02 
 
 		 162 aa  87.4  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0223  leucine-responsive regulatory protein  39.02 
 
 		 162 aa  87.4  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396703  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2550  leucine-responsive regulatory protein  39.02 
 
 		 162 aa  87.4  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.678942  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0924  leucine-responsive regulatory protein  39.02 
 
 		 162 aa  87.4  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 153 aa  87.4  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3105  AsnC family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 171 aa  87  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0808  AsnC family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 159 aa  87  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2863  leucine-responsive regulatory protein  39.02 
 
 		 162 aa  86.7  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.437935  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2973  leucine-responsive regulatory protein  39.02 
 
 		 162 aa  86.7  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 170 aa  86.7  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1657  leucine-responsive regulatory protein  39.02 
 
 		 162 aa  86.7  9e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2511  transcriptional regulator, AsnC family  36.3 
 
 		 167 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2235  AsnC/Lrp family regulatory protein  36.3 
 
 		 167 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2924  leucine-responsive regulatory protein  39.02 
 
 		 162 aa  86.7  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.518607  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3783  putative leucine-responsive regulatory protein  37.23 
 
 		 171 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  32.65 
 
 		 153 aa  86.3  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3529  putative leucine-responsive regulatory protein  37.23 
 
 		 168 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2581  leucine-responsive regulatory protein, putative  37.23 
 
 		 171 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0015  transcriptional regulator  37.23 
 
 		 171 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3844  putative leucine-responsive regulatory protein  37.23 
 
 		 171 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0632  AsnC family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 151 aa  86.7  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.134943 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3752  hypothetical protein  37.14 
 
 		 170 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 153 aa  86.7  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0882  transcriptional regulator, AsnC family  38.33 
 
 		 152 aa  86.3  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0004  AsnC family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 222 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3119  putative leucine-responsive regulatory protein  37.23 
 
 		 222 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533929  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1976  putative leucine-responsive regulatory protein  37.23 
 
 		 168 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.657079  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2396  AsnC family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 162 aa  85.5  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.371515  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0945  AsnC family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 182 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.962352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2239  AsnC family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 162 aa  85.9  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1002  AsnC family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 162 aa  85.9  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782239 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0910  AsnC family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 179 aa  85.5  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2726  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 		 174 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0941  AsnC family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 182 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344592  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0789  AsnC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 170 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5879  AsnC family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 186 aa  85.5  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1024  AsnC family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 182 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0586  AsnC family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 182 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4530  AsnC/Lrp family regulatory protein  36.62 
 
 		 152 aa  84.7  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.668495 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2126  leucine-responsive transcriptional regulator  39.57 
 
 		 167 aa  85.1  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000250913  normal  0.0385806 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1065  AsnC family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 182 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 154 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  33.8 
 
 		 157 aa  85.1  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5271  leucine-responsive regulatory protein  37.1 
 
 		 162 aa  84.3  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5181  AsnC family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 162 aa  84.3  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.73265  normal  0.0995684 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1396  AsnC family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 174 aa  84.3  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.441206 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2193  transcriptional regulator, AsnC family  35.56 
 
 		 167 aa  84.3  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.134817  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>