160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3134 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3134  amidohydrolase  100 
 
 		 399 aa  801    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4371  dihydroorotase  38.66 
 
 		 379 aa  212  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4254  dihydroorotase  38.08 
 
 		 395 aa  208  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0916  dihydroorotase  39.51 
 
 		 395 aa  204  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0177  amidohydrolase  37.47 
 
 		 383 aa  195  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3349  dihydroorotase  32.64 
 
 		 412 aa  179  7e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000206965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2448  aminohydrolase domain-containing protein  33.51 
 
 		 426 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3928  dihydroorotase  36.29 
 
 		 379 aa  171  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0785792  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0558  amidohydrolase 3  33.77 
 
 		 425 aa  170  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.577589 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1052  dihydroorotase  29.9 
 
 		 420 aa  170  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0770373  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6703  dihydroorotase  34.18 
 
 		 402 aa  169  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.235788 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0675  amidohydrolase  31.32 
 
 		 370 aa  168  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5803  dihydroorotase  34.38 
 
 		 404 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.306417  normal  0.050491 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2987  dihydroorotase  32.66 
 
 		 402 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4546  dihydroorotase  30.27 
 
 		 420 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.225827 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5090  dihydroorotase  33.07 
 
 		 403 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3965  amidohydrolase  30.69 
 
 		 414 aa  162  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.690591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6462  dihydroorotase  32.26 
 
 		 412 aa  158  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.815548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3969  amidohydrolase  30.59 
 
 		 427 aa  156  5.0000000000000005e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.209336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5828  dihydroorotase  31.68 
 
 		 427 aa  152  8e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000105478 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5700  dihydroorotase  31.49 
 
 		 424 aa  150  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187758  hitchhiker  0.00402648 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4846  dihydroorotase  31.25 
 
 		 377 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4825  dihydroorotase  31.52 
 
 		 377 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4727  dihydroorotase  31.52 
 
 		 377 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4791  dihydroorotase  31.27 
 
 		 377 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4696  dihydroorotase  31.01 
 
 		 377 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.531695 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2441  dihydroorotase  30.43 
 
 		 417 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0650  dihydroorotase  30.53 
 
 		 425 aa  146  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0429  dihydroorotase  31.58 
 
 		 377 aa  145  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.634096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0106  dihydroorotase  29.63 
 
 		 378 aa  144  3e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2453  dihydroorotase  30.19 
 
 		 423 aa  144  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0512688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0919  dihydroorotase  30.91 
 
 		 377 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3154  dihydroorotase  30.79 
 
 		 377 aa  137  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0260  dihydroorotase  29.55 
 
 		 366 aa  137  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0312532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4988  dihydroorotase  29.26 
 
 		 366 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5003  dihydroorotase  28.98 
 
 		 366 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4960  dihydroorotase  28.98 
 
 		 366 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4376  dihydroorotase  30.85 
 
 		 379 aa  135  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.430681  normal  0.791891 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4740  dihydroorotase  28.98 
 
 		 366 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185439  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4599  dihydroorotase  29.66 
 
 		 366 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231727  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5100  dihydroorotase  28.98 
 
 		 366 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4975  dihydroorotase  29.38 
 
 		 366 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4580  dihydroorotase  28.92 
 
 		 366 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4778  putative metallo-dependent hydrolase  30.18 
 
 		 387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.336327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4682  putative metallo-dependent hydrolase  30.18 
 
 		 387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0195401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4833  putative metallo-dependent hydrolase  30.18 
 
 		 387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.489997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4812  putative metallo-dependent hydrolase  30.18 
 
 		 387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4693  putative metallo-dependent hydrolase  30.18 
 
 		 387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4689  dihydroorotase  29.38 
 
 		 366 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3350  dihydroorotase  28.93 
 
 		 431 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000731035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0926  D-aminoacylase  40 
 
 		 490 aa  62.4  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.888276  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1641  amidohydrolase 3  38.95 
 
 		 590 aa  58.5  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0757893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0561  amidohydrolase 3  45.31 
 
 		 583 aa  57.4  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1862  D-aminoacylase domain-containing protein  39.13 
 
 		 493 aa  57  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.555174  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0356  amidohydrolase 3  46.03 
 
 		 577 aa  57  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0312  amidohydrolase 3  50 
 
 		 578 aa  55.8  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3590  dihydroorotase  43.84 
 
 		 574 aa  55.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.614905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0261  dihydropyrimidinase  22.9 
 
 		 474 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2960  dihydropyrimidinase  21.33 
 
 		 474 aa  54.3  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2152  amidohydrolase 3  44.62 
 
 		 581 aa  53.9  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.288153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3088  dihydroorotase  46.03 
 
 		 570 aa  53.9  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0767  amidohydrolase 3  45.71 
 
 		 575 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.407111  normal  0.251034 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0136  amidohydrolase 3  45.71 
 
 		 574 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2782  hypothetical protein  40.86 
 
 		 598 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1019  hypothetical protein  38.38 
 
 		 587 aa  53.1  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5093  N-acyl-D-amino-acid deacylase  37.84 
 
 		 494 aa  52.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00480971  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2680  amidohydrolase 3  49.21 
 
 		 579 aa  52.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0224  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  32.5 
 
 		 428 aa  51.6  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6046  D-aminoacylase domain protein  35.58 
 
 		 530 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0725  dihydropyrimidinase  42.86 
 
 		 484 aa  50.8  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3660  N-acyl-D-amino-acid deacylase  45.31 
 
 		 532 aa  50.8  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0822791  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3646  amidohydrolase 3  37.8 
 
 		 589 aa  50.4  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.668872  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2836  adenine deaminase  37.18 
 
 		 597 aa  50.4  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1785  allantoinase  43.94 
 
 		 461 aa  49.7  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.827785  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2023  amidohydrolase 3  40.79 
 
 		 579 aa  49.7  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.730117 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1187  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  40.3 
 
 		 494 aa  49.3  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.826213  normal  0.915695 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7586  dihydroorotase  32.89 
 
 		 581 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1432  hypothetical protein  42.03 
 
 		 582 aa  49.7  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2752  hypothetical protein  39.78 
 
 		 598 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0310233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2796  hypothetical protein  39.78 
 
 		 598 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.282284  normal  0.995463 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7926  phenylhydantoinase  38.14 
 
 		 474 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245265  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  39.68 
 
 		 486 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5601  dihydropyrimidinase  41.27 
 
 		 484 aa  48.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4305  N-acyl-D-amino-acid deacylase  41.79 
 
 		 494 aa  48.9  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2980  D-aminoacylase domain protein  36.63 
 
 		 528 aa  48.5  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.572399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3035  hypothetical protein  35.87 
 
 		 604 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2013  dihydroorotase  38.03 
 
 		 566 aa  48.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4195  N-acyl-D-amino-acid deacylase  41.79 
 
 		 494 aa  48.9  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0882  amidohydrolase 3  34.74 
 
 		 579 aa  48.9  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.480099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1348  hypothetical protein  41.27 
 
 		 629 aa  48.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0576  amidohydrolase 3  46.77 
 
 		 578 aa  47.8  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5575  N-acyl-D-amino-acid deacylase  40.62 
 
 		 534 aa  47.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1042  hypothetical protein  33.08 
 
 		 451 aa  47.4  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.289988  normal  0.0665058 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5277  adenine deaminase  41.33 
 
 		 595 aa  47.8  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.899857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6853  amidohydrolase 3  44.44 
 
 		 567 aa  47.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0027  N-acyl-D-aspartate/D-glutamate deacylase  35.63 
 
 		 418 aa  47.4  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1042  hypothetical protein  41.54 
 
 		 588 aa  47  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1578  hypothetical protein  41.54 
 
 		 584 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211733  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1493  hypothetical protein  41.54 
 
 		 584 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154211  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1199  hypothetical protein  35.63 
 
 		 588 aa  47  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.202231  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>