85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2987 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2987  amidohydrolase 2  100 
 
 		 315 aa  634    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.390637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1956  amidohydrolase 2  49.84 
 
 		 321 aa  301  7.000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0037729  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4912  amidohydrolase 2  50.16 
 
 		 316 aa  276  4e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2954  amidohydrolase 2  50.32 
 
 		 316 aa  269  4e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2820  amidohydrolase 2  42.17 
 
 		 313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2721  metal-dependent hydrolase  40.95 
 
 		 356 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277634  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6458  amidohydrolase 2  38.14 
 
 		 366 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0823861  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2549  amidohydrolase 2  39.69 
 
 		 312 aa  186  5e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1808  amidohydrolase 2  33.7 
 
 		 337 aa  171  2e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0190647 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03601  conserved hypothetical protein  34.91 
 
 		 367 aa  158  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5506  twin-arginine translocation pathway signal  32.92 
 
 		 363 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5604  amidohydrolase 2  28.86 
 
 		 336 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  27.44 
 
 		 364 aa  107  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7137  amidohydrolase 2  29.14 
 
 		 350 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.032027  normal  0.227522 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5929  amidohydrolase 2  28.32 
 
 		 338 aa  94.7  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  25.42 
 
 		 345 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  25.08 
 
 		 320 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  24.26 
 
 		 351 aa  78.6  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.64 
 
 		 339 aa  73.9  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4292  amidohydrolase 2  25.77 
 
 		 331 aa  72.8  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1753  amidohydrolase 2  27.85 
 
 		 333 aa  72.8  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  27.99 
 
 		 325 aa  72.4  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  27.59 
 
 		 326 aa  70.5  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0258  amidohydrolase 2  28.03 
 
 		 326 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4102  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  28.1 
 
 		 383 aa  69.7  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13287  normal  0.0312348 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  24.91 
 
 		 358 aa  69.7  0.00000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  26.21 
 
 		 326 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  26.06 
 
 		 336 aa  65.1  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4213  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.42 
 
 		 342 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4525  amidohydrolase 2  25.6 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273896  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06723  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05840)  22.49 
 
 		 338 aa  63.9  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4794  amidohydrolase 2  26.99 
 
 		 334 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707579  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  26.43 
 
 		 372 aa  63.5  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2293  amidohydrolase 2  25.84 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3833  amidohydrolase 2  25.96 
 
 		 336 aa  62.8  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2163  amidohydrolase  29.83 
 
 		 297 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  21.99 
 
 		 317 aa  62.4  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00050  iso-orotate decarboxylase (Eurofung)  21.95 
 
 		 381 aa  62.4  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0110807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  20.07 
 
 		 336 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  20.07 
 
 		 336 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0650  putative hydrolase  26.79 
 
 		 364 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60927  normal  0.264449 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1616  amidohydrolase 2  27.85 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7640  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.65 
 
 		 341 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  26.57 
 
 		 354 aa  59.7  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1036  amidohydrolase 2  25.17 
 
 		 340 aa  59.3  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105862  normal  0.443407 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5140  amidohydrolase 2  26.97 
 
 		 334 aa  59.3  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.073212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4717  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.25 
 
 		 358 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3061  amidohydrolase 2  28.93 
 
 		 330 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3548  amidohydrolase 2  26.16 
 
 		 358 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  23.21 
 
 		 339 aa  58.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3915  amidohydrolase 2  25.72 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150149  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0594  hypothetical protein  28.08 
 
 		 361 aa  57  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114324  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  23.78 
 
 		 353 aa  56.6  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.63 
 
 		 350 aa  55.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1233  hypothetical protein  23.93 
 
 		 283 aa  55.8  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.047212  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1929  amidohydrolase 2  25 
 
 		 358 aa  55.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51746  normal  0.799765 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02118  conserved hypothetical protein  22.71 
 
 		 337 aa  54.3  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3524  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.03 
 
 		 342 aa  53.5  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.635162  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5776  amidohydrolase 2  28.08 
 
 		 337 aa  52.8  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2814  amidohydrolase 2  23.89 
 
 		 341 aa  52.8  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162302  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3274  amidohydrolase 2  24.63 
 
 		 343 aa  52  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3063  amidohydrolase 2  27.03 
 
 		 333 aa  52  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0292  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold  24.51 
 
 		 341 aa  51.2  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.951151  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0621  putative hydrolase  24.69 
 
 		 341 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.148858 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  25 
 
 		 339 aa  50.8  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1256  amidohydrolase 2  23.21 
 
 		 283 aa  50.4  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00133666  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4331  amidohydrolase 2  20.97 
 
 		 326 aa  50.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639652  normal  0.0344092 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0682  tryptophan 2,3-dioxygenase  24.08 
 
 		 629 aa  49.3  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431731  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0614  amidohydrolase 2  26.12 
 
 		 291 aa  48.5  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1503  o-pyrocatechuate decarboxylase  26.35 
 
 		 330 aa  48.5  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4307  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25 
 
 		 351 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1472  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.22 
 
 		 334 aa  47  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1931  amidohydrolase 2  23.05 
 
 		 342 aa  46.2  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502037  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2750  amidohydrolase 2  25.34 
 
 		 387 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0158  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  24.17 
 
 		 346 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5212  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.11 
 
 		 333 aa  45.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.473622  normal  0.325543 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2274  amidohydrolase 2  25.79 
 
 		 335 aa  44.3  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.345046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0855  amidohydrolase 2  21.9 
 
 		 280 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000589459  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4140  amidohydrolase 2  23.83 
 
 		 261 aa  43.5  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  22.01 
 
 		 391 aa  42.7  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3888  amidohydrolase 2  22.15 
 
 		 339 aa  42.7  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6039  amidohydrolase 2  21.8 
 
 		 341 aa  42.7  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0698551  normal  0.185903 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07911  conserved hypothetical protein  21.43 
 
 		 331 aa  42.4  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1832  amidohydrolase 2  21.47 
 
 		 348 aa  42.4  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5503  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.17 
 
 		 337 aa  42.4  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>