More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2945 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2945  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
290 aa  570  1e-161  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3496  alpha/beta hydrolase fold protein  41 
 
 
267 aa  188  7e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.094698 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0581  alpha/beta hydrolase fold protein  40.38 
 
 
275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4750  alpha/beta hydrolase fold protein  40.3 
 
 
268 aa  162  6e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0847  alpha/beta hydrolase fold protein  39.27 
 
 
404 aa  149  8e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.135304  normal  0.159023 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4600  alpha/beta hydrolase fold protein  39.68 
 
 
286 aa  142  9e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.413191  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1010  alpha/beta hydrolase fold protein  39.43 
 
 
257 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0646  alpha/beta hydrolase fold protein  32.27 
 
 
265 aa  125  8.000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2868  alpha/beta hydrolase fold protein  34.33 
 
 
265 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0147271  normal  0.0470272 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3372  alpha/beta hydrolase fold protein  35.85 
 
 
287 aa  108  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000420005  normal  0.0275463 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3024  alpha/beta hydrolase fold protein  34.23 
 
 
273 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  hitchhiker  0.00214769 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3816  alpha/beta hydrolase fold  29.62 
 
 
257 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5901  alpha/beta hydrolase fold protein  30.62 
 
 
273 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0862  alpha/beta hydrolase fold protein  36.23 
 
 
298 aa  99.4  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
266 aa  98.6  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158315  decreased coverage  0.007429 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  31.46 
 
 
333 aa  91.3  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 
350 aa  89  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  30.12 
 
 
323 aa  87.8  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  32.84 
 
 
340 aa  86.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  32.46 
 
 
340 aa  86.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  27.82 
 
 
562 aa  85.9  7e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  28.86 
 
 
361 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  29.73 
 
 
299 aa  77.4  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  29.26 
 
 
341 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  27.91 
 
 
330 aa  76.3  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 
329 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  29.3 
 
 
314 aa  75.5  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  29.01 
 
 
315 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2104  alpha/beta hydrolase fold  23.91 
 
 
300 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000418183  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1065  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 
275 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.289777  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  29.76 
 
 
309 aa  74.3  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  36.55 
 
 
325 aa  73.9  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1555  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 
285 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0958412 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  28.2 
 
 
296 aa  72.8  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  24.01 
 
 
300 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  27.41 
 
 
287 aa  72.4  0.000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5011  putative alpha/beta hydrolase  30.43 
 
 
350 aa  72  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  26.57 
 
 
350 aa  72  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1418  alpha/beta hydrolase fold protein  29.69 
 
 
276 aa  72  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.961025  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2720  alpha/beta hydrolase fold protein  29.53 
 
 
342 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2266  alpha/beta hydrolase fold protein  28.79 
 
 
274 aa  71.6  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.620512 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4874  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 
277 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0356151  normal  0.0554825 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  26.14 
 
 
264 aa  70.9  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  24.18 
 
 
316 aa  70.5  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2535  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 
344 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1210  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 
284 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.297219  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2120  alpha/beta hydrolase fold protein  27.3 
 
 
437 aa  70.5  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1227  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 
284 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1237  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 
284 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.145679 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  30.45 
 
 
301 aa  70.1  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3221  alpha/beta hydrolase fold  31.3 
 
 
273 aa  69.7  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000558124  normal  0.0180053 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  26.2 
 
 
339 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  23.74 
 
 
300 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0199  alpha/beta hydrolase fold protein  29.1 
 
 
254 aa  69.3  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.355967  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.69 
 
 
370 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6254  alpha/beta hydrolase fold protein  26.98 
 
 
277 aa  68.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.92 
 
 
369 aa  68.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  37.78 
 
 
272 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  40.45 
 
 
282 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  22.35 
 
 
281 aa  67.8  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  23.66 
 
 
300 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.91 
 
 
372 aa  67.8  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  43.16 
 
 
390 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.36 
 
 
371 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.34 
 
 
368 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8725  alpha/beta hydrolase fold protein  30.15 
 
 
332 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.72 
 
 
372 aa  67  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  23.38 
 
 
300 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  26.56 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  26.56 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 
290 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  26.56 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  40.45 
 
 
282 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1905  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
354 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6445  alpha/beta hydrolase fold protein  39.18 
 
 
340 aa  67  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668195  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  25.57 
 
 
284 aa  66.6  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.71 
 
 
374 aa  66.2  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  26.29 
 
 
276 aa  66.6  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2101  alpha/beta hydrolase fold  45.98 
 
 
285 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3642  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 
379 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3925  alpha/beta hydrolase fold  30.31 
 
 
367 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182869  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.11 
 
 
368 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 
287 aa  65.9  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5882  alpha/beta hydrolase fold  32.58 
 
 
273 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2696  alpha/beta hydrolase fold protein  29.32 
 
 
268 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.094894  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1287  alpha/beta hydrolase fold protein  44.44 
 
 
255 aa  65.1  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00130508  normal  0.0205637 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1179  alpha/beta hydrolase fold protein  29.74 
 
 
278 aa  65.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798469  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  30.2 
 
 
322 aa  65.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 
265 aa  65.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1079  alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 
283 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.622662  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.51 
 
 
368 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  27 
 
 
291 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3935  alpha/beta hydrolase fold protein  29.53 
 
 
371 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28 
 
 
380 aa  64.7  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  36.17 
 
 
226 aa  64.3  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  25.82 
 
 
286 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3801  alpha/beta hydrolase fold  36.07 
 
 
351 aa  63.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2122  alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 
249 aa  63.5  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.237751 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  28.02 
 
 
257 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5140  alpha/beta hydrolase fold  31.68 
 
 
305 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773664  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>