206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3903 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3903  LmbE-like protein  100 
 
 		 300 aa  609  1e-173  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.704498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0826  LmbE family protein  82.01 
 
 		 298 aa  466  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933312  normal  0.598429 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3098  mycothiol conjugate amidase Mca  67.71 
 
 		 293 aa  388  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal  0.203495 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0925  LmbE family protein  64.58 
 
 		 287 aa  383  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0643281  normal  0.488564 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0981  LmbE family protein  64.6 
 
 		 309 aa  380  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.955127  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0941  mycothiol conjugate amidase Mca  65.97 
 
 		 295 aa  378  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0709  mycothiol conjugate amidase Mca  64.01 
 
 		 293 aa  376  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0868  LmbE family protein  65.97 
 
 		 287 aa  375  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00918813 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1066  mycothiol conjugate amidase Mca  70.14 
 
 		 303 aa  373  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8537  conserved hypothetical protein LmbE  64.24 
 
 		 294 aa  362  6e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0724  mycothiol conjugate amidase Mca  62.33 
 
 		 291 aa  352  5e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.779113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0670  mycothiol conjugate amidase Mca  59.73 
 
 		 312 aa  347  1e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0449  hypothetical protein  64.38 
 
 		 290 aa  343  1e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.869172  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0096  mycothiol conjugate amidase Mca  61.46 
 
 		 292 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1886  LmbE family protein  63.89 
 
 		 328 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.63571 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3145  mycothiol conjugate amidase Mca  58.97 
 
 		 288 aa  336  3.9999999999999995e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4142  LmbE-like protein  61.94 
 
 		 290 aa  334  9e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4217  LmbE family protein  61.94 
 
 		 290 aa  334  9e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.105692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4373  LmbE family protein  61.94 
 
 		 290 aa  334  9e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1639  mycothiol conjugate amidase Mca  57.09 
 
 		 299 aa  333  2e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0942  mycothiol conjugate amidase Mca  59.86 
 
 		 295 aa  332  5e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31790  mycothiol conjugate amidase Mca  61.03 
 
 		 303 aa  332  6e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07280  mycothiol conjugate amidase Mca  58.42 
 
 		 316 aa  325  4.0000000000000003e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.608208 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1079  mycothiol conjugate amidase Mca  57.88 
 
 		 289 aa  321  8e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1101  LmbE family protein  56 
 
 		 313 aa  316  3e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0911817  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1241  mycothiol conjugate amidase Mca  57.77 
 
 		 301 aa  314  9.999999999999999e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000367029 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08230  mycothiol conjugate amidase Mca  56.06 
 
 		 295 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0513099 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2050  LmbE family protein  56.9 
 
 		 291 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379996  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2633  mycothiol conjugate amidase Mca  56.7 
 
 		 293 aa  312  3.9999999999999997e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.342297  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11100  mycothiol conjugate amidase mca  57.79 
 
 		 288 aa  311  9e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.24323e-19  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23070  mycothiol conjugate amidase Mca  54.48 
 
 		 303 aa  297  1e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1891  mycothiol conjugate amidase Mca  57.04 
 
 		 291 aa  295  5e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1169  LmbE family protein  58.92 
 
 		 301 aa  295  6e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.805763  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4667  LmbE family protein  59.31 
 
 		 290 aa  295  6e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4417  mycothiol conjugate amidase Mca  52.58 
 
 		 359 aa  286  2e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05100  uncharacterized LmbE-like protein  47.3 
 
 		 330 aa  243  1.9999999999999999e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.34779  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1609  LmbE family protein  40.34 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3024  LmbE family protein  36.46 
 
 		 288 aa  167  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.439999  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0756  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  37.5 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3036  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  41.01 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1084  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  35.97 
 
 		 294 aa  140  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0486  hypothetical protein  38.79 
 
 		 286 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.522878  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1157  LmbE family protein  36.98 
 
 		 302 aa  139  7.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103463  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  37.69 
 
 		 309 aa  136  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3459  LmbE-like protein  35.29 
 
 		 307 aa  135  7.000000000000001e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0865  LmbE family protein  36.18 
 
 		 305 aa  133  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.76321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8449  conserved hypothetical protein LmbE  36.74 
 
 		 302 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4145  LmbE family protein  34.77 
 
 		 308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5063  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  34.75 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3908  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidedeacetylase  36.39 
 
 		 282 aa  125  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1868  LmbE family protein  35.29 
 
 		 292 aa  125  7e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.584409 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3561  conserved hypothetical protein LmbE  35.03 
 
 		 276 aa  125  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5506  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidede acetylase  35.94 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194637 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  35.45 
 
 		 311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3864  LmbE-like protein  33.88 
 
 		 314 aa  120  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0961679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1131  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  36.84 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1904  LmbE family protein  35.76 
 
 		 271 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  42.37 
 
 		 299 aa  116  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3763  LmbE family protein  34.11 
 
 		 314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0766  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  33.33 
 
 		 283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1134  LmbE family protein  33.97 
 
 		 361 aa  110  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0281137 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  31.38 
 
 		 304 aa  108  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4535  LmbE family protein  35.21 
 
 		 284 aa  106  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.750354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2165  LmbE family protein  39.57 
 
 		 284 aa  106  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.083902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6362  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  32.82 
 
 		 355 aa  105  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.797199  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4264  LmbE family protein  34.4 
 
 		 308 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.183979 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1146  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  34.18 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0802505  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31100  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  31.53 
 
 		 268 aa  104  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.714678 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4034  LmbE-like protein  34.4 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4109  LmbE family protein  34.4 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1717  LmbE family protein  30.86 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0264749  normal  0.141737 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7414  LmbE family protein  43.31 
 
 		 277 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0111  LmbE family protein  33.46 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.061479  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2430  LmbE family protein  32.93 
 
 		 274 aa  98.6  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0988  LmbE family protein  37.43 
 
 		 306 aa  97.8  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.296192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  38.61 
 
 		 260 aa  97.1  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2667  LmbE family protein  36.6 
 
 		 272 aa  90.1  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11195  N-acetyl-1-D-myo-inosityl-2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside deacetylase mshB  41.67 
 
 		 303 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26080  uncharacterized LmbE-like protein  33.33 
 
 		 369 aa  85.9  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2816  LmbE family protein  26.96 
 
 		 271 aa  85.5  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0595539 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1021  LmbE-like protein protein  28.04 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0809018  hitchhiker  0.000000427707 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11830  uncharacterized LmbE-like protein  35.63 
 
 		 268 aa  82.4  0.000000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.263602  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0963  LmbE family protein  34.15 
 
 		 408 aa  82.4  0.000000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.871469  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7629  conserved hypothetical protein LmbE  42.86 
 
 		 263 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19500  conserved protein of DIM6/NTAB family  31.02 
 
 		 484 aa  81.6  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.224099  decreased coverage  0.00249696 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1124  LmbE family protein  32.74 
 
 		 463 aa  79.7  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2744  LmbE family protein  34.08 
 
 		 253 aa  80.1  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3789  LmbE family protein  31.79 
 
 		 283 aa  79.3  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.728369 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3329  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  27.72 
 
 		 283 aa  78.6  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  31.84 
 
 		 227 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2880  LmbE-like protein  29.79 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4309  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  40.96 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.414925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1564  LmbE family protein  31.13 
 
 		 249 aa  75.1  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  33.9 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  30.93 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0794  LmbE family protein  29.44 
 
 		 331 aa  72.4  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0272  LmbE family protein  28.76 
 
 		 244 aa  68.2  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.733991  normal  0.923307 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  30.22 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4220  conserved hypothetical protein LmbE  37.25 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0270991  hitchhiker  0.000751351 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0833  LmbE family protein  33.14 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>