More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1711 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1711  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 		 588 aa  1192    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.619498  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0769  DNA mismatch repair protein MutL  50.67 
 
 		 551 aa  566  1e-160  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0599  DNA mismatch repair protein MutL  40.58 
 
 		 621 aa  409  1e-113  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0798741  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0923  DNA mismatch repair protein MutL  35.78 
 
 		 516 aa  327  3e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0901  DNA mismatch repair protein MutL  36.12 
 
 		 516 aa  323  7e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  31.78 
 
 		 606 aa  322  9.999999999999999e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  35.86 
 
 		 559 aa  321  3e-86  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0172  DNA mismatch repair protein MutL  32.91 
 
 		 624 aa  320  6e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2701  DNA mismatch repair protein MutL  31.13 
 
 		 626 aa  315  9.999999999999999e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00383046  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0145  DNA mismatch repair protein  30.98 
 
 		 644 aa  315  9.999999999999999e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0023  DNA mismatch repair protein MutL  32.23 
 
 		 621 aa  311  2.9999999999999997e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000493473  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4047  DNA mismatch repair protein  30.53 
 
 		 610 aa  310  6.999999999999999e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  34.45 
 
 		 586 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  31.7 
 
 		 628 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0267  DNA mismatch repair protein MutL  31.22 
 
 		 622 aa  306  9.000000000000001e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000997696 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4176  DNA mismatch repair protein  31.68 
 
 		 597 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  30.25 
 
 		 644 aa  303  5.000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  31.49 
 
 		 630 aa  302  9e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  32.52 
 
 		 605 aa  301  3e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  31.88 
 
 		 613 aa  300  6e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  30.89 
 
 		 608 aa  299  9e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  31.88 
 
 		 611 aa  298  2e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  31.53 
 
 		 616 aa  298  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1981  DNA mismatch repair protein  29.91 
 
 		 626 aa  298  2e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1201  DNA mismatch repair protein  30.89 
 
 		 611 aa  298  2e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.894444  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  30.99 
 
 		 632 aa  297  3e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0554  DNA mismatch repair protein MutL  32.5 
 
 		 565 aa  297  3e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1612  DNA mismatch repair protein  33.28 
 
 		 614 aa  297  4e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.235254  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  32.7 
 
 		 623 aa  297  4e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4032  DNA mismatch repair protein  31.2 
 
 		 597 aa  296  5e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.733731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  29.21 
 
 		 625 aa  296  7e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  31.75 
 
 		 600 aa  296  9e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  32.92 
 
 		 644 aa  295  1e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  31.35 
 
 		 612 aa  295  1e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  30.27 
 
 		 607 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1078  DNA mismatch repair protein MutL  34.05 
 
 		 572 aa  295  2e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  31.27 
 
 		 606 aa  294  3e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1084  DNA mismatch repair protein MutL  30.25 
 
 		 630 aa  294  3e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.967595  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4855  DNA mismatch repair protein  30.63 
 
 		 595 aa  294  3e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  31.89 
 
 		 575 aa  294  3e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2328  DNA mismatch repair protein MutL  30.03 
 
 		 629 aa  293  4e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  30.44 
 
 		 602 aa  294  4e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1823  DNA mismatch repair protein MutL  29.36 
 
 		 628 aa  293  5e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000270616  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  30.27 
 
 		 607 aa  293  6e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2548  DNA mismatch repair protein  30.92 
 
 		 603 aa  293  8e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1006  DNA mismatch repair protein MutL  33.5 
 
 		 566 aa  292  1e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  31.28 
 
 		 574 aa  291  2e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  30.43 
 
 		 608 aa  291  2e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  31.23 
 
 		 605 aa  291  2e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  31.14 
 
 		 632 aa  291  3e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  30.44 
 
 		 601 aa  291  3e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  30.71 
 
 		 600 aa  291  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0267  DNA mismatch repair protein MutL  32.2 
 
 		 610 aa  290  6e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  31.12 
 
 		 633 aa  290  7e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  31.28 
 
 		 632 aa  289  9e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3169  DNA mismatch repair protein  30.15 
 
 		 603 aa  288  1e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.484911  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  30.97 
 
 		 612 aa  289  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  32 
 
 		 616 aa  288  2e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  30.22 
 
 		 632 aa  286  5.999999999999999e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0363  DNA mismatch repair protein  29.76 
 
 		 621 aa  286  8e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  31.39 
 
 		 633 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  31.48 
 
 		 641 aa  285  2.0000000000000002e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  29.22 
 
 		 631 aa  285  2.0000000000000002e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0302  DNA mismatch repair protein MutL  30.52 
 
 		 624 aa  284  3.0000000000000004e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000565974  hitchhiker  0.00985332 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  30.81 
 
 		 622 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2754  DNA mismatch repair protein  28.73 
 
 		 634 aa  284  3.0000000000000004e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.679624 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  30.1 
 
 		 602 aa  284  4.0000000000000003e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_978  DNA mismatch repair protein, MutL/HexB family  33.22 
 
 		 566 aa  284  4.0000000000000003e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1195  MutL/HexB family DNA mismatch repair protein  32.94 
 
 		 566 aa  283  5.000000000000001e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0321912  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  30.52 
 
 		 635 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1087  DNA mismatch repair protein MutL  32.11 
 
 		 582 aa  283  7.000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0917186  normal  0.0241297 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1696  DNA mismatch repair protein MutL  32.04 
 
 		 665 aa  283  9e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930861  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  30.66 
 
 		 611 aa  282  1e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2031  DNA mismatch repair protein MutL  31.18 
 
 		 604 aa  282  1e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  30.41 
 
 		 608 aa  282  1e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  28.8 
 
 		 623 aa  281  2e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1389  DNA mismatch repair protein  30.08 
 
 		 599 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41073  normal  0.777612 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  28.8 
 
 		 623 aa  281  2e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3539  DNA mismatch repair protein  30.57 
 
 		 644 aa  281  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1517  DNA mismatch repair protein MutL  29.89 
 
 		 598 aa  281  3e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3811  DNA mismatch repair protein MutL  30.76 
 
 		 629 aa  281  3e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  31.33 
 
 		 605 aa  281  3e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  29.5 
 
 		 643 aa  280  4e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  30.96 
 
 		 629 aa  280  5e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  31.47 
 
 		 645 aa  280  5e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  28.68 
 
 		 626 aa  280  5e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  29.02 
 
 		 647 aa  280  6e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  29.07 
 
 		 636 aa  280  7e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3509  DNA mismatch repair protein  30.55 
 
 		 647 aa  279  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  29.92 
 
 		 615 aa  279  1e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  29.45 
 
 		 617 aa  279  1e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1432  DNA mismatch repair protein  30.4 
 
 		 647 aa  279  1e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.980701 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1884  DNA mismatch repair protein  30.34 
 
 		 640 aa  279  1e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1487  DNA mismatch repair protein MutL  30.63 
 
 		 622 aa  278  2e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.101291  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3802  DNA mismatch repair protein  30.24 
 
 		 647 aa  278  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.618994  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  30.08 
 
 		 655 aa  278  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3815  DNA mismatch repair protein  30.4 
 
 		 647 aa  278  2e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3527  DNA mismatch repair protein  30.4 
 
 		 647 aa  278  3e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  31.33 
 
 		 648 aa  278  3e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  29.67 
 
 		 641 aa  277  4e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>