136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1214 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1214  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  639    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.711737  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0882  hypothetical protein  45.9 
 
 		 334 aa  267  2e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1434  hypothetical protein  32.93 
 
 		 338 aa  181  2e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1480  hypothetical protein  32.93 
 
 		 338 aa  181  2e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0225  protein of unknown function UPF0118  29.3 
 
 		 345 aa  73.9  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000651141  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0224  protein of unknown function UPF0118  29.21 
 
 		 345 aa  67.8  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000072412  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  24.58 
 
 		 390 aa  67.4  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  23.13 
 
 		 405 aa  62.4  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  22.87 
 
 		 396 aa  61.6  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  25 
 
 		 393 aa  61.6  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1742  putative permease PerM  22.73 
 
 		 354 aa  61.6  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  25.43 
 
 		 404 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1990  protein of unknown function UPF0118  21.71 
 
 		 372 aa  59.3  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3012  protein of unknown function UPF0118  28.03 
 
 		 369 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2867  permease PerM, putative  21.9 
 
 		 361 aa  58.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  22.53 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2477  hypothetical protein  28.93 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0938  protein of unknown function UPF0118  22.34 
 
 		 420 aa  57  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  23.1 
 
 		 351 aa  56.2  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0660  riboflavin transporter  26.21 
 
 		 363 aa  56.2  0.0000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0764  hypothetical protein  26.21 
 
 		 363 aa  56.2  0.0000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002790  permease PerM  22.33 
 
 		 357 aa  56.2  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1694  permease-like protein  26.45 
 
 		 443 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111642  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3470  hypothetical protein  22.5 
 
 		 362 aa  55.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  22.11 
 
 		 369 aa  54.7  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2001  permease  24.1 
 
 		 371 aa  54.3  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0546  hypothetical protein  22.97 
 
 		 318 aa  54.3  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1757  hypothetical protein  21.86 
 
 		 360 aa  53.5  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.805933  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10207  transmembrane protein  24.48 
 
 		 367 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1651  hypothetical protein  21.57 
 
 		 366 aa  53.1  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03191  hypothetical protein  21 
 
 		 356 aa  52.8  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2417  hypothetical protein  21.57 
 
 		 366 aa  52  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.798484  hitchhiker  0.00111788 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1793  hypothetical protein  23.75 
 
 		 387 aa  52  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116515  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2478  hypothetical protein  26.49 
 
 		 369 aa  52.4  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  23.08 
 
 		 353 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  24.26 
 
 		 392 aa  52.4  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0910  hypothetical protein  23.24 
 
 		 379 aa  51.2  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2345  hypothetical protein  20.92 
 
 		 366 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000997744 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0823  protein of unknown function UPF0118  22.98 
 
 		 358 aa  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74505  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  21.5 
 
 		 402 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  21.5 
 
 		 402 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09331  permease  24.79 
 
 		 347 aa  50.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1792  hypothetical protein  20.78 
 
 		 360 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1660  hypothetical protein  21.18 
 
 		 356 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1785  hypothetical protein  20.78 
 
 		 360 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.539102  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1829  hypothetical protein  20.78 
 
 		 360 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.2453  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  22.84 
 
 		 417 aa  50.8  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2493  protein of unknown function UPF0118  20.78 
 
 		 360 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.544644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1973  hypothetical protein  21.24 
 
 		 369 aa  50.1  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0953876  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0960  protein of unknown function UPF0118  26.88 
 
 		 353 aa  50.1  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  22.07 
 
 		 383 aa  49.7  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1156  permease  30.07 
 
 		 382 aa  50.1  0.00006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0866214  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1352  protein of unknown function UPF0118  23.44 
 
 		 438 aa  49.7  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2979  hypothetical protein  21.47 
 
 		 387 aa  49.3  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0873  hypothetical protein  23.72 
 
 		 347 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.475897  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  30.07 
 
 		 384 aa  48.9  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3615  hypothetical protein  25.75 
 
 		 412 aa  48.9  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08290  predicted permease  23.08 
 
 		 367 aa  48.9  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  24.75 
 
 		 381 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  24.75 
 
 		 381 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09321  permease  25.07 
 
 		 347 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  25.27 
 
 		 373 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08190  predicted permease  25.49 
 
 		 455 aa  47.8  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0210651 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5351  protein of unknown function UPF0118  23.55 
 
 		 364 aa  47.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0138969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1693  hypothetical protein  23.13 
 
 		 358 aa  47.8  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.561325  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  22.94 
 
 		 423 aa  47.8  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1697  hypothetical protein  22.5 
 
 		 360 aa  47.8  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.588209  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  23.86 
 
 		 373 aa  47.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1895  protein of unknown function UPF0118  28.74 
 
 		 483 aa  47.4  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  23.34 
 
 		 529 aa  47.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07661  permease  21.54 
 
 		 358 aa  47.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0677332 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1984  hypothetical protein  23.35 
 
 		 340 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.372704  normal  0.185401 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0340  hypothetical protein  23.35 
 
 		 340 aa  47  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1649  hypothetical protein  22.51 
 
 		 360 aa  47  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.673436  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2482  hypothetical protein  22.56 
 
 		 359 aa  47  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  23.05 
 
 		 349 aa  46.6  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0956  hypothetical protein  20.83 
 
 		 349 aa  47  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0392869 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4116  protein of unknown function UPF0118  22.17 
 
 		 360 aa  47  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.614918  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  24.41 
 
 		 381 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2977  hypothetical protein  21.22 
 
 		 353 aa  46.6  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.283703 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1240  putative permease PerM  22.11 
 
 		 354 aa  46.6  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00935863  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5305  hypothetical protein  22.27 
 
 		 464 aa  46.6  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111321  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3128  putative permease PerM  22.11 
 
 		 354 aa  46.6  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00611871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1357  hypothetical protein  22.11 
 
 		 354 aa  46.6  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1003  permease  26.75 
 
 		 350 aa  46.6  0.0007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  23.91 
 
 		 383 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2006  hypothetical protein  22.76 
 
 		 363 aa  46.6  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000247505  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4216  hypothetical protein  19.83 
 
 		 346 aa  46.6  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.329203  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  23.79 
 
 		 376 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  24.54 
 
 		 376 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  24.54 
 
 		 376 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  24.54 
 
 		 376 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  24.54 
 
 		 376 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1911  hypothetical protein  22.3 
 
 		 372 aa  45.8  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  24.54 
 
 		 373 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  23.79 
 
 		 373 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  23.79 
 
 		 373 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  21 
 
 		 400 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0915  hypothetical protein  19.31 
 
 		 346 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1843  hypothetical protein  21.22 
 
 		 366 aa  44.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.633644  normal  0.110752 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>