More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3569 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3236  DNA polymerase III, alpha subunit  46.67 
 
 		 980 aa  914    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6872  DNA polymerase III, alpha subunit  46.64 
 
 		 982 aa  886    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4916  DNA polymerase III, alpha subunit  43.2 
 
 		 989 aa  827    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188475  normal  0.0948833 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3569  DNA polymerase III, alpha subunit  100 
 
 		 1017 aa  2122    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3769  DNA polymerase III, alpha subunit  75.1 
 
 		 1018 aa  1626    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1371  DNA polymerase III, alpha subunit  50.77 
 
 		 979 aa  1005    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.940819 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0499  DNA polymerase III, alpha subunit  31.22 
 
 		 1029 aa  469  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0237  DNA polymerase III, alpha subunit  32.05 
 
 		 1003 aa  455  1.0000000000000001e-126  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1741  DNA polymerase III, alpha subunit  31.51 
 
 		 1047 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0516  DNA polymerase III, alpha subunit  32.89 
 
 		 1079 aa  446  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0929  DNA polymerase III, alpha subunit  28.84 
 
 		 1003 aa  402  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1009  DNA polymerase III, alpha subunit  29.19 
 
 		 1039 aa  391  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0533804  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1872  DNA polymerase III DnaE  29.99 
 
 		 1156 aa  386  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1262  DNA polymerase III DnaE  30.29 
 
 		 1139 aa  374  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.842621  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1391  DNA polymerase III, alpha subunit  29.74 
 
 		 1127 aa  375  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  33.91 
 
 		 1075 aa  373  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0809  DNA polymerase III DnaE  29.8 
 
 		 1145 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000123157  decreased coverage  0.00151258 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03140  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  29.71 
 
 		 1122 aa  365  2e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.677635  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1192  DNA polymerase III DnaE  29.12 
 
 		 1145 aa  359  9.999999999999999e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0750  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  28.18 
 
 		 1115 aa  358  1.9999999999999998e-97  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  28 
 
 		 1225 aa  357  6.999999999999999e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0773  DNA polymerase III, alpha subunit  28.91 
 
 		 1092 aa  354  5e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0831  DNA polymerase III, alpha subunit  29.78 
 
 		 1132 aa  348  3e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  27.33 
 
 		 1130 aa  348  4e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0549  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  27.82 
 
 		 1134 aa  347  4e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2786  DNA polymerase III subunit alpha  28.93 
 
 		 1149 aa  347  6e-94  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  29.69 
 
 		 1181 aa  342  2e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0434  DNA polymerase III, alpha subunit  30.93 
 
 		 1139 aa  341  5e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4714  DNA polymerase III DnaE  26.49 
 
 		 1108 aa  337  5e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1396  DNA polymerase III, alpha subunit  28.9 
 
 		 1159 aa  337  5e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253021  normal  0.727837 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0880  DNA polymerase III, alpha subunit  27.97 
 
 		 1038 aa  337  5e-91  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.191787  hitchhiker  0.00000000000153929 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1860  DNA polymerase III subunit alpha  27.74 
 
 		 1168 aa  336  1e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.100328 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3197  DNA polymerase III, alpha subunit  29.94 
 
 		 1139 aa  336  1e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0523  DNA polymerase III DnaE  26.49 
 
 		 1108 aa  335  3e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1266  DNA polymerase III, alpha subunit  27.84 
 
 		 1065 aa  332  2e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.502736  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4333  DNA polymerase III DnaE  26.3 
 
 		 1108 aa  332  2e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1693  DNA polymerase III subunit alpha  29.71 
 
 		 1168 aa  332  2e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1165  DNA polymerase III DnaE  29.07 
 
 		 1036 aa  332  2e-89  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1793  DNA polymerase III, alpha subunit  29.02 
 
 		 1065 aa  332  3e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1759  DNA polymerase III, alpha subunit  29.02 
 
 		 1065 aa  332  3e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.463991  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4434  DNA polymerase III DnaE  26.66 
 
 		 1110 aa  330  6e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4498  DNA polymerase III DnaE  26.35 
 
 		 1108 aa  329  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4345  DNA polymerase III DnaE  26.4 
 
 		 1108 aa  329  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4719  DNA polymerase III DnaE  26.3 
 
 		 1108 aa  330  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4849  DNA polymerase III DnaE  26.35 
 
 		 1108 aa  329  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1849  DNA polymerase III, alpha subunit  29.36 
 
 		 1182 aa  329  1.0000000000000001e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.134668  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2164  DNA polymerase III, alpha subunit, putative  27.92 
 
 		 1047 aa  329  2.0000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4735  DNA polymerase III DnaE  26.07 
 
 		 1108 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4730  DNA polymerase III DnaE  26.3 
 
 		 1108 aa  329  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0675  DNA polymerase III, alpha subunit  30.62 
 
 		 1148 aa  328  3e-88  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1715  DNA polymerase III, alpha subunit  29.5 
 
 		 1175 aa  327  5e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49916  normal  0.677237 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3288  DNA polymerase III DnaE  25.99 
 
 		 1109 aa  326  1e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1264  DNA polymerase III, alpha subunit  27.17 
 
 		 1155 aa  325  2e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0096  DNA polymerase III, alpha subunit  30.33 
 
 		 1151 aa  325  3e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.810427  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4284  DNA polymerase III subunit alpha  28.25 
 
 		 1150 aa  324  4e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.166792 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0506  DNA polymerase III subunit alpha  28 
 
 		 1201 aa  323  9.999999999999999e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1331  DNA polymerase III, alpha subunit  26.07 
 
 		 1049 aa  322  1.9999999999999998e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0774  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  25.76 
 
 		 1112 aa  322  1.9999999999999998e-86  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04615  putative DNA polymerase III alpha subunit  29.32 
 
 		 1454 aa  319  1e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1265  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  29.66 
 
 		 1170 aa  320  1e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4522  DNA polymerase III subunit alpha  27.93 
 
 		 1173 aa  319  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4061  DNA polymerase III, alpha subunit  28.57 
 
 		 1174 aa  318  2e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496247  normal  0.0397833 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2531  DNA polymerase III, alpha subunit  26.38 
 
 		 1085 aa  318  2e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465943 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1489  DNA polymerase III, alpha subunit  28.77 
 
 		 1143 aa  318  4e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1885  DNA polymerase III, alpha subunit  32.56 
 
 		 1182 aa  317  5e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0780  DNA polymerase III, alpha subunit  29.16 
 
 		 1109 aa  317  7e-85  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.493984  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0872  DNA polymerase III subunit alpha  27.3 
 
 		 1161 aa  317  7e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.224124  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1325  DNA polymerase III, alpha subunit  26.55 
 
 		 1026 aa  317  7e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0583  DNA polymerase III, alpha subunit  28.41 
 
 		 1168 aa  317  9e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2410  DNA polymerase III, alpha subunit  29.04 
 
 		 1190 aa  316  9.999999999999999e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00080646  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1464  DNA polymerase III, alpha subunit  29.79 
 
 		 1170 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1426  DNA polymerase III alpha subunit  28.77 
 
 		 1143 aa  316  1.9999999999999998e-84  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1225  DNA polymerase III, alpha subunit  29.1 
 
 		 1164 aa  316  1.9999999999999998e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344496  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13406  error-prone DNA polymerase  30.4 
 
 		 1079 aa  316  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0998493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0808  DNA polymerase III, alpha subunit  25.33 
 
 		 1059 aa  315  2.9999999999999996e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.881912  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1265  DNA polymerase III, alpha subunit  31.51 
 
 		 1176 aa  315  3.9999999999999997e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.166444  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2433  DNA polymerase III subunit alpha  30.91 
 
 		 1185 aa  314  5.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.184139 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3147  DNA polymerase III, alpha subunit  25.18 
 
 		 1059 aa  313  6.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3150  DNA polymerase III subunit alpha  27.38 
 
 		 1160 aa  314  6.999999999999999e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00762737  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0939  DNA polymerase III DnaE  28.73 
 
 		 1034 aa  313  9e-84  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1286  DNA polymerase III, alpha subunit  28.39 
 
 		 1165 aa  313  1e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.148493  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2690  DNA polymerase III, alpha subunit  26.43 
 
 		 1104 aa  313  1e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1596  DNA polymerase III, alpha subunit  26.42 
 
 		 1159 aa  313  1e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1836  DNA polymerase III subunit alpha  27.99 
 
 		 1164 aa  312  2e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2402  DNA polymerase III subunit alpha  27.87 
 
 		 1163 aa  312  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3606  DNA polymerase III, alpha subunit  28.64 
 
 		 1178 aa  312  2e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.402124  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0854  DNA polymerase III subunit alpha  30.65 
 
 		 1165 aa  311  2.9999999999999997e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0819  DNA polymerase III subunit alpha  27.7 
 
 		 1163 aa  311  2.9999999999999997e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2870  DNA polymerase III subunit alpha  28.11 
 
 		 1177 aa  312  2.9999999999999997e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.91064  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2965  DNA polymerase III subunit alpha  27.28 
 
 		 1160 aa  311  4e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10281  DNA polymerase III subunit alpha  29.4 
 
 		 1165 aa  311  4e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3419  DNA polymerase III, alpha subunit  27.28 
 
 		 1160 aa  310  8e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0194  DNA polymerase III subunit alpha  27.28 
 
 		 1160 aa  310  8e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1242  DNA polymerase III, alpha subunit  29.29 
 
 		 1170 aa  310  8e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0188  DNA polymerase III subunit alpha  27.28 
 
 		 1160 aa  310  8e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0293384  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00182  DNA polymerase III subunit alpha  27.28 
 
 		 1160 aa  310  9e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480953  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1183  error-prone DNA polymerase  30.37 
 
 		 1099 aa  310  9e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00181  hypothetical protein  27.28 
 
 		 1160 aa  310  9e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.466902  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0186  DNA polymerase III subunit alpha  27.28 
 
 		 1160 aa  310  9e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0596563  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1200  error-prone DNA polymerase  30.37 
 
 		 1099 aa  310  9e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>