More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3168 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3168  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 
434 aa  878    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0578626  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0659  AAA ATPase central domain protein  52.53 
 
 
442 aa  456  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372478  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1669  AAA ATPase central domain protein  53.06 
 
 
450 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2559  AAA ATPase central domain protein  52.55 
 
 
450 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3934  AAA ATPase central domain protein  50.79 
 
 
450 aa  405  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5237  AAA ATPase central domain protein  48.52 
 
 
459 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.368199  hitchhiker  0.00000000902621 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1049  elongation factor P  45.8 
 
 
432 aa  386  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0362  ATPase central domain-containing protein  47.11 
 
 
448 aa  380  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4120  AAA ATPase central domain protein  42.44 
 
 
466 aa  354  2e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0052109  hitchhiker  0.000242019 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3602  AAA ATPase, central region  41.98 
 
 
448 aa  348  1e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000057004 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2996  AAA ATPase, central region  44.21 
 
 
478 aa  340  2e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2455  putative ATPase  44.44 
 
 
441 aa  281  1e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0571186  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3136  AAA ATPase, central region  38.5 
 
 
478 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2559  AAA ATPase  36.51 
 
 
444 aa  224  3e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000494228 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1879  AAA ATPase  40.54 
 
 
787 aa  219  6e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0972  AAA family ATPase  40.08 
 
 
743 aa  218  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1952  AAA ATPase central domain protein  44.03 
 
 
656 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.248161 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1651  ATPase central domain-containing protein  40.67 
 
 
653 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0496762 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2830  ATPase central domain-containing protein  40.67 
 
 
657 aa  212  7.999999999999999e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4356  hypothetical protein  40.84 
 
 
652 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00948823  normal  0.0832553 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2258  AAA ATPase central domain protein  38.76 
 
 
680 aa  204  2e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226213  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2524  AAA ATPase central domain protein  40.58 
 
 
656 aa  203  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1500  AAA ATPase central domain protein  41.41 
 
 
639 aa  202  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1499  AAA ATPase central domain protein  39.69 
 
 
744 aa  199  9e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0755  AAA ATPase central domain protein  38.55 
 
 
725 aa  198  1.0000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1943  AAA ATPase central domain protein  37.98 
 
 
619 aa  199  1.0000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00697304  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0938  ATPase central domain-containing protein  39.77 
 
 
671 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1734  AAA ATPase central domain protein  41.09 
 
 
697 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.168086 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4150  AAA ATPase central domain protein  40.89 
 
 
665 aa  193  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  37.86 
 
 
662 aa  192  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5978  AAA ATPase central domain protein  35.82 
 
 
1085 aa  192  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3811  ATPase central domain-containing protein  38.61 
 
 
788 aa  191  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1753  ATPase central domain-containing protein  40.24 
 
 
450 aa  189  7e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.215663  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1133  AAA ATPase, central region  35.13 
 
 
445 aa  187  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0859  AAA ATPase  38.35 
 
 
634 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1893  AAA ATPase central domain protein  38.46 
 
 
698 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00103439  normal  0.0680609 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2933  AAA ATPase central domain protein  35.14 
 
 
689 aa  183  5.0000000000000004e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5393  AAA ATPase central domain protein  35.36 
 
 
682 aa  179  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1020  AAA ATPase central domain protein  36.4 
 
 
646 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4397  AAA ATPase central domain protein  35.91 
 
 
687 aa  174  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3054  ATPase central domain-containing protein  35.74 
 
 
725 aa  172  7.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821112 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1864  AAA ATPase central domain protein  37.26 
 
 
678 aa  171  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5257  AAA ATPase central domain protein  35.48 
 
 
749 aa  170  5e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3668  AAA ATPase central domain protein  61.11 
 
 
134 aa  168  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2009  AAA ATPase central domain protein  31.73 
 
 
1193 aa  164  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1822  ATPase central domain-containing protein  36.26 
 
 
622 aa  156  9e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1667  ATPase, AAA family protein  31.29 
 
 
569 aa  149  7e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0827  AAA ATPase, central region  37.25 
 
 
697 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.934037  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1549  ATPase, AAA family protein  29.88 
 
 
570 aa  147  3e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.974713  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0401  ATPase, AAA family protein  30.18 
 
 
570 aa  146  6e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1579  ATPase, AAA family protein  30.38 
 
 
570 aa  145  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0426  ATPase, AAA family protein  29.88 
 
 
570 aa  144  2e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  33.03 
 
 
578 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1774  cysteine synthase A  29.52 
 
 
580 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0393214  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0853  AAA ATPase  33.08 
 
 
305 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  33.19 
 
 
577 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2297  AAA ATPase, central region  40.11 
 
 
228 aa  130  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.754524 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0869  AAA ATPase family protein  34.73 
 
 
352 aa  129  7.000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000165138  normal  0.784704 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4054  AAA ATPase, central region  33.19 
 
 
299 aa  121  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0357172 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0172  ATPase central domain-containing protein  30.04 
 
 
387 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1882  ATPase central domain-containing protein  32.24 
 
 
617 aa  106  9e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.58 
 
 
738 aa  102  9e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2427  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.66 
 
 
805 aa  102  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0025  AAA ATPase central domain protein  32.9 
 
 
443 aa  100  4e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  30.35 
 
 
764 aa  99.4  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1890  AAA ATPase central domain protein  32.98 
 
 
367 aa  98.6  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.439906  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2451  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.88 
 
 
804 aa  98.6  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.530015 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30 
 
 
718 aa  98.6  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  29.85 
 
 
754 aa  97.1  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0262  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.58 
 
 
810 aa  97.1  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90881  AAA+-type ATPase  33.82 
 
 
788 aa  97.1  6e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.369927 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  28.35 
 
 
727 aa  95.5  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.34 
 
 
739 aa  96.3  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.14 
 
 
701 aa  94.7  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.9 
 
 
721 aa  95.5  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.55 
 
 
723 aa  94.7  3e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.27 
 
 
736 aa  94.4  4e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  32.82 
 
 
776 aa  94  5e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  29.41 
 
 
804 aa  93.6  5e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.15 
 
 
740 aa  94  5e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.33 
 
 
806 aa  93.6  7e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1672  ATPase central domain-containing protein  31.94 
 
 
369 aa  92.4  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00463679  normal  0.710335 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3392  Adenosinetriphosphatase  30.24 
 
 
746 aa  92.8  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0642335  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1223  AAA family ATPase  29.58 
 
 
721 aa  92.8  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  30.32 
 
 
348 aa  92.4  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.36 
 
 
784 aa  92.8  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3020  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  28.93 
 
 
709 aa  92.4  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3794  AAA ATPase, central region  36.76 
 
 
369 aa  92.4  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.74 
 
 
756 aa  92.4  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.23 
 
 
781 aa  92.4  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  25.81 
 
 
737 aa  92.4  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1247  cell division protein CDC48  30.4 
 
 
732 aa  91.7  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.0692611 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.41 
 
 
740 aa  92  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  29.13 
 
 
763 aa  91.3  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  28.83 
 
 
769 aa  90.9  4e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  28.74 
 
 
394 aa  90.9  4e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.88 
 
 
743 aa  90.9  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.37 
 
 
742 aa  90.5  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.73 
 
 
742 aa  90.5  5e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  29.02 
 
 
699 aa  90.5  5e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>