200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3155 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3155  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 581 aa  1180    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2550  Rhs element Vgr protein  48.39 
 
 		 589 aa  630  1e-179  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0669  Rhs element Vgr protein  52.41 
 
 		 576 aa  627  1e-178  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1682  Rhs element Vgr protein  47.71 
 
 		 589 aa  619  1e-176  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5250  Rhs element Vgr protein  44.71 
 
 		 596 aa  545  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012293 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0369  Rhs element Vgr protein  40 
 
 		 596 aa  488  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3609  Rhs element Vgr protein  42.73 
 
 		 574 aa  478  1e-133  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128418 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1042  phosphoserine phosphatase SerB  41.84 
 
 		 565 aa  469  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3003  Rhs element Vgr protein  39.8 
 
 		 598 aa  452  1e-125  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0676  Rhs element Vgr protein  36.1 
 
 		 596 aa  441  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2462  hypothetical protein  38.84 
 
 		 595 aa  432  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3927  Rhs element Vgr protein  36.86 
 
 		 604 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00332693  hitchhiker  0.00450013 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1080  hypothetical protein  35.23 
 
 		 599 aa  375  1e-103  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.752206 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0896  Rhs element Vgr protein  29.44 
 
 		 545 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.79786 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1040  Rhs element Vgr protein  29.44 
 
 		 545 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.605907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2817  Rhs element Vgr protein  26.37 
 
 		 593 aa  189  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1663  Rhs element Vgr protein  26.2 
 
 		 589 aa  179  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485896  normal  0.191701 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1732  Rhs element Vgr protein  24.21 
 
 		 641 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520263 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2267  Rhs element Vgr protein  22.96 
 
 		 610 aa  120  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267374  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3822  Rhs element Vgr protein  21.49 
 
 		 578 aa  112  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.112104  normal  0.0443202 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0926  Rhs element Vgr protein  23.08 
 
 		 587 aa  108  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.91076  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1906  Rhs element Vgr protein  24.57 
 
 		 606 aa  104  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194585  hitchhiker  0.0014616 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1626  Rhs element Vgr protein  22.81 
 
 		 592 aa  100  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0131276 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1051  Rhs element Vgr protein  23.34 
 
 		 594 aa  99.8  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3043  Rhs element Vgr protein  29.75 
 
 		 229 aa  97.4  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160638 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0769  Rhs element Vgr protein  30.77 
 
 		 248 aa  95.1  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0983  hypothetical protein  31.92 
 
 		 218 aa  92  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208742  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3666  Rhs element Vgr protein  31.07 
 
 		 226 aa  92  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.408922  decreased coverage  0.0000749166 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1564  hypothetical protein  21.65 
 
 		 504 aa  91.3  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.21515 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5384  Rhs element Vgr protein  23 
 
 		 602 aa  91.3  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2945  Rhs element Vgr protein  22.5 
 
 		 589 aa  90.9  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703955  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4390  Rhs element Vgr protein  24.12 
 
 		 652 aa  88.6  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.86257  normal  0.698434 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3684  Rhs element Vgr protein  32.16 
 
 		 247 aa  87  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.149401  hitchhiker  0.000521794 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1509  Rhs element Vgr protein  29.68 
 
 		 239 aa  81.6  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26590  hypothetical protein  26.83 
 
 		 599 aa  80.9  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0848935  normal  0.672502 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0660  hypothetical protein  26.33 
 
 		 605 aa  79.3  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.279373 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1875  hypothetical protein  30.51 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.133633  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1818  hypothetical protein  25.75 
 
 		 352 aa  74.7  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3260  Rhs element Vgr protein  22.2 
 
 		 602 aa  73.2  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386521  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4109  Rhs element Vgr protein  22 
 
 		 576 aa  72.4  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0273732 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3664  hypothetical protein  25.09 
 
 		 360 aa  72.8  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000879822 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1953  Rhs element Vgr protein  27.81 
 
 		 275 aa  69.7  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3589  Rhs element Vgr protein  20.54 
 
 		 612 aa  69.3  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.512863 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000029  hypothetical protein  28.4 
 
 		 611 aa  68.2  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1508  phage protein D  22.71 
 
 		 348 aa  67.8  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6416  Rhs element Vgr protein  23.54 
 
 		 617 aa  67.4  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0770  Phage protein D-like protein  22.22 
 
 		 341 aa  67  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.737587  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2892  hypothetical protein  19.14 
 
 		 499 aa  66.6  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3665  Rhs element Vgr protein  27.63 
 
 		 245 aa  65.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412379  hitchhiker  0.000248141 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6124  type VI secretion system Vgr family protein  25.33 
 
 		 714 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.029227  normal  0.478766 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5985  type VI secretion system Vgr family protein  21.73 
 
 		 641 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1796  Rhs element Vgr protein  21.74 
 
 		 619 aa  63.9  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1137  hypothetical protein  22.46 
 
 		 381 aa  62  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2360  Rhs element Vgr protein  25.74 
 
 		 618 aa  60.8  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0982  hypothetical protein  21.38 
 
 		 362 aa  60.1  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3931  Rhs element Vgr protein  26.48 
 
 		 616 aa  60.1  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.410968  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1954  Phage protein D-like protein  22.15 
 
 		 407 aa  60.1  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1138  hypothetical protein  25.37 
 
 		 270 aa  58.9  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3177  Rhs family protein  28.57 
 
 		 697 aa  57.4  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3254  vgrG protein  23.58 
 
 		 710 aa  56.6  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4483  type VI secretion system Vgr family protein  24.38 
 
 		 778 aa  56.6  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0531  type VI secretion system Vgr family protein  29.32 
 
 		 1003 aa  56.6  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4864  Rhs element Vgr protein  22.29 
 
 		 599 aa  56.2  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0846936  normal  0.155196 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3783  Rhs element Vgr protein  32.69 
 
 		 785 aa  55.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4348  hypothetical protein  26.24 
 
 		 157 aa  55.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0387743  normal  0.103118 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0286  Rhs element Vgr protein:Gp5-like  28.24 
 
 		 709 aa  55.1  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.856224 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0065  type VI secretion system Vgr family protein  21.21 
 
 		 822 aa  54.7  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0454  Rhs element Vgr protein  24.15 
 
 		 671 aa  54.7  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5894  Rhs element Vgr protein  26.34 
 
 		 615 aa  54.7  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6682  type VI secretion system Vgr family protein  33.78 
 
 		 1057 aa  54.3  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  22.38 
 
 		 841 aa  54.3  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  23.26 
 
 		 774 aa  54.3  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2447  type VI secretion system Vgr family protein  24.76 
 
 		 735 aa  53.9  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.764507  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1613  Rhs element Vgr protein  33.78 
 
 		 858 aa  53.5  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0129  Rhs element Vgr protein  33.78 
 
 		 872 aa  53.5  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176404  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  30.85 
 
 		 838 aa  53.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0166  Rhs element Vgr protein  33.78 
 
 		 930 aa  53.5  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275346  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0143  Rhs element Vgr protein  33.78 
 
 		 896 aa  53.5  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420233  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2014  type VI secretion system Vgr family protein  30.94 
 
 		 753 aa  53.5  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758033  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3220  Rhs element Vgr protein  22.48 
 
 		 618 aa  53.5  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0014  vgrG protein  23.35 
 
 		 1017 aa  53.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  25.37 
 
 		 1981 aa  52.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2555  hypothetical protein  24.53 
 
 		 273 aa  53.1  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000216389 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  30.85 
 
 		 841 aa  52.8  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  30.85 
 
 		 841 aa  52.8  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3752  Rhs element Vgr protein  23.26 
 
 		 755 aa  52.4  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.617325 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  23.45 
 
 		 613 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  30.14 
 
 		 616 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0300  type VI secretion system Vgr family protein  22.91 
 
 		 794 aa  52  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2735  Rhs element Vgr protein  23.02 
 
 		 788 aa  52  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3019  type VI secretion system Vgr family protein  31.08 
 
 		 1048 aa  51.6  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  23.02 
 
 		 907 aa  51.6  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50870  Rhs element Vgr protein  27.22 
 
 		 668 aa  51.6  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  24.12 
 
 		 703 aa  51.2  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  25.32 
 
 		 668 aa  50.4  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2127  Rhs element Vgr protein  33.33 
 
 		 748 aa  50.4  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4015  Rhs element Vgr protein  25.9 
 
 		 602 aa  50.4  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.211679  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3415  Rhs element Vgr protein  26.62 
 
 		 669 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2888  hypothetical protein  25.32 
 
 		 668 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0536  type VI secretion system Vgr family protein  32.47 
 
 		 792 aa  50.1  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>