More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1954 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1954  NLP/P60 protein  100 
 
 		 384 aa  783    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1426  NLP/P60 protein  61.9 
 
 		 165 aa  171  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2379  peptidoglycan-binding LysM  43.95 
 
 		 698 aa  149  6e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.829657  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  33 
 
 		 341 aa  126  7e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  33.11 
 
 		 342 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  30.86 
 
 		 342 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  29.31 
 
 		 301 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  32.3 
 
 		 342 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2100  NLP/P60 protein  44.63 
 
 		 302 aa  116  6.9999999999999995e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.660776  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  29.87 
 
 		 346 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04820  hypothetical protein  46.9 
 
 		 186 aa  111  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2639  NLP/P60 protein  29.8 
 
 		 349 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  27.47 
 
 		 341 aa  110  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  27.78 
 
 		 257 aa  106  9e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1158  NLP/P60 protein  41.86 
 
 		 181 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01000  LysM-repeat domain protein  33.96 
 
 		 651 aa  105  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2476  NLP/P60 protein  48.31 
 
 		 214 aa  104  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.188506  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4179  NLP/P60 protein  39.37 
 
 		 168 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0481386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2584  NLP/P60 protein  42.06 
 
 		 205 aa  104  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.416294  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  28.81 
 
 		 255 aa  103  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  27.62 
 
 		 338 aa  103  6e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  28.85 
 
 		 285 aa  101  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  40.94 
 
 		 424 aa  100  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3056  NLP/P60 protein  30.49 
 
 		 347 aa  99.8  8e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000688808  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2378  peptidoglycan-binding LysM  29.69 
 
 		 634 aa  99  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.903959  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0057  lipoprotein  40 
 
 		 174 aa  98.6  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.438446  hitchhiker  0.00939156 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2161  NLP/P60 protein  41.98 
 
 		 154 aa  98.6  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.854022 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  29.63 
 
 		 208 aa  97.4  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1344  NLP/P60 protein  44.92 
 
 		 207 aa  97.1  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0897  NLP/P60 family protein  40.46 
 
 		 231 aa  96.7  6e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.624146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  28.19 
 
 		 295 aa  96.7  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  42.61 
 
 		 188 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  42.61 
 
 		 188 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2605  NlpC/P60 family lipoprotein  41.22 
 
 		 143 aa  95.9  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1732  NlpC/P60 family lipoprotein  41.22 
 
 		 154 aa  95.5  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1838  NLP/P60 protein  41.22 
 
 		 154 aa  95.5  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  45.22 
 
 		 207 aa  95.9  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  42.61 
 
 		 188 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  42.61 
 
 		 188 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  42.61 
 
 		 188 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  42.61 
 
 		 188 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  42.61 
 
 		 188 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  42.61 
 
 		 188 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  42.61 
 
 		 188 aa  95.9  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  26.25 
 
 		 303 aa  95.1  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2842  LysM repeat-containing protein  34.98 
 
 		 389 aa  95.1  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  42.74 
 
 		 210 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0781  NLP/P60 protein  34.13 
 
 		 260 aa  94.4  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1788  NlpC/P60 family lipoprotein  42.52 
 
 		 154 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2426  lipoprotein, NlpC/P60 family  42.52 
 
 		 154 aa  93.6  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1482  NlpC/P60 family lipoprotein  42.52 
 
 		 154 aa  93.6  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  30.1 
 
 		 217 aa  93.6  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1927  NlpC/P60 family lipoprotein  42.52 
 
 		 154 aa  93.6  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00858399  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2771  putative outer membrane lipoprotein  41.74 
 
 		 189 aa  92.8  8e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.805322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  28.83 
 
 		 216 aa  92.8  9e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1830  NlpC (ORF-17)  41.73 
 
 		 154 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2002  putative lipoprotein nlpC  41.73 
 
 		 154 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.303201 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1637  NLP/P60  40.77 
 
 		 226 aa  92  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58461  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1471  hypothetical protein  41.73 
 
 		 154 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.235317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1454  putative lipoprotein nlpC  41.73 
 
 		 154 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.297729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1438  NlpC (ORF-17)  41.73 
 
 		 154 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0813186 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2178  NLP/P60 protein  37.8 
 
 		 193 aa  92.4  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01677  predicted lipoprotein  41.73 
 
 		 154 aa  92  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0294155  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1934  NLP/P60 protein  41.73 
 
 		 154 aa  92  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0636747  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1923  NLP/P60 protein  41.73 
 
 		 154 aa  92  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.468553 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  35.26 
 
 		 183 aa  91.3  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2565  putative outer membrane lipoprotein  41.74 
 
 		 190 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.159761  hitchhiker  0.000144355 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2451  putative outer membrane lipoprotein  41.74 
 
 		 190 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000518421 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01666  hypothetical protein  41.73 
 
 		 154 aa  92  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0178073  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0791  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)-like  38.4 
 
 		 221 aa  91.3  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2454  putative outer membrane lipoprotein  41.74 
 
 		 190 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00195047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02243  hypothetical protein  42.61 
 
 		 162 aa  92  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2408  putative outer membrane lipoprotein  41.74 
 
 		 147 aa  90.9  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210623 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2363  putative outer membrane lipoprotein  41.74 
 
 		 147 aa  90.9  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000243067  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1912  lipoprotein, NlpC/P60 family  40.94 
 
 		 154 aa  90.5  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1669  NLP/P60 protein  41.54 
 
 		 214 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4049  NLP/P60 protein  41.54 
 
 		 212 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  35.48 
 
 		 333 aa  90.5  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1267  NLP/P60 protein  41.54 
 
 		 214 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1734  NLP/P60 protein  41.96 
 
 		 154 aa  90.1  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1227  NLP/P60 protein  40.77 
 
 		 214 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2819  NLP/P60 protein  38.4 
 
 		 159 aa  89.7  8e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  34.86 
 
 		 205 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  41.74 
 
 		 188 aa  89.4  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1657  NLP/P60 protein  41.96 
 
 		 154 aa  89.4  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.983654  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  35.15 
 
 		 193 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4200  NLP/P60 protein  37.4 
 
 		 156 aa  88.6  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1628  NLP/P60 protein  41.96 
 
 		 155 aa  88.6  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6213  NLP/P60  38.17 
 
 		 363 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1866  NLP/P60 protein  38.17 
 
 		 363 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2700  NLP/P60 protein  38.56 
 
 		 188 aa  88.6  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000637216  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1890  NLP/P60 protein  38.17 
 
 		 363 aa  87.8  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00780805  hitchhiker  0.0000000811276 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1804  NLP/P60 protein  37.4 
 
 		 354 aa  87.8  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  29.92 
 
 		 370 aa  87.8  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  26.28 
 
 		 298 aa  87.4  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1293  NLP/P60  31.02 
 
 		 205 aa  87  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0496746  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5167  NLP/P60 family lipoprotein  36.09 
 
 		 364 aa  86.7  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33180  NLP/P60 family lipoprotein  34.97 
 
 		 205 aa  86.7  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.38174  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1746  NLP/P60 protein  39.23 
 
 		 203 aa  86.3  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1407  NLP/P60 protein  31.95 
 
 		 369 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.374528 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>