More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2399 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2399  protein of unknown function UPF0126  100 
 
 
264 aa  528  1e-149  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.53799 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18070  predicted membrane protein  40.09 
 
 
258 aa  155  7e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2715  protein of unknown function UPF0126  36.03 
 
 
317 aa  152  4e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0017  protein of unknown function UPF0126  38.46 
 
 
247 aa  134  9.999999999999999e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000429816  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04050  predicted membrane protein  29.48 
 
 
262 aa  130  3e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.818037 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4671  protein of unknown function UPF0126  33.48 
 
 
245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0543686  normal  0.412484 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2916  hypothetical protein  38.01 
 
 
206 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1929  hypothetical protein  32.46 
 
 
209 aa  103  3e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  31.22 
 
 
201 aa  101  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  34.62 
 
 
206 aa  98.6  8e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3086  protein of unknown function UPF0126  32.97 
 
 
222 aa  96.3  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0456  protein of unknown function UPF0126  32.22 
 
 
210 aa  95.9  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3452  hypothetical protein  32.28 
 
 
211 aa  95.9  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0870  hypothetical protein  32.79 
 
 
213 aa  95.9  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0879  protein of unknown function UPF0126  35.53 
 
 
204 aa  94  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3287  protein of unknown function UPF0126  36.71 
 
 
221 aa  94  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.375068  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0263  hypothetical protein  30.2 
 
 
206 aa  93.6  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000221431  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1208  hypothetical protein  35.12 
 
 
214 aa  93.6  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.101022  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  33.33 
 
 
208 aa  93.6  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3187  protein of unknown function UPF0126  32.43 
 
 
222 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.120724  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2812  hypothetical protein  24.26 
 
 
205 aa  92.8  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2951  hypothetical protein  32.7 
 
 
217 aa  92.8  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.184845 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0682  hypothetical protein  32.47 
 
 
215 aa  92.8  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00825878  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  32.84 
 
 
211 aa  92.8  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2999  protein of unknown function UPF0126  28.28 
 
 
206 aa  92.4  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.542645  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2988  hypothetical protein  32.43 
 
 
222 aa  92.4  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00741318  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4184  hypothetical protein  37.65 
 
 
212 aa  92.4  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.655016 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3856  hypothetical protein  37.65 
 
 
212 aa  92.4  7e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.134324  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2574  hypothetical protein  30.69 
 
 
207 aa  91.3  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0581628  hitchhiker  0.000000675229 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2603  hypothetical protein  30.81 
 
 
213 aa  89.7  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.624077  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4741  hypothetical protein  39.1 
 
 
219 aa  89.7  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0254  hypothetical protein  30.41 
 
 
205 aa  89.4  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0652374 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1842  hypothetical protein  36.47 
 
 
213 aa  89.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.310019  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2822  protein of unknown function UPF0126  32.35 
 
 
218 aa  89  7e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00443209 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0991  hypothetical protein  27.05 
 
 
238 aa  89  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.31278  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0350  hypothetical protein  27.39 
 
 
246 aa  89  8e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5955  hypothetical protein  34.59 
 
 
203 aa  88.6  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0408387  normal  0.0875871 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4643  hypothetical protein  29.38 
 
 
222 aa  88.6  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.0000135142 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0584  hypothetical protein  36.6 
 
 
207 aa  88.2  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  36.2 
 
 
208 aa  88.2  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0722  hypothetical protein  25.13 
 
 
211 aa  88.6  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0179  hypothetical protein  29.59 
 
 
218 aa  87.8  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400734  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2740  protein of unknown function UPF0126  30.92 
 
 
225 aa  87.4  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  28.43 
 
 
209 aa  87.4  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1030  protein of unknown function UPF0126  39.74 
 
 
226 aa  86.7  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  31.41 
 
 
205 aa  86.7  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3444  hypothetical protein  32.03 
 
 
207 aa  87  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4054  protein of unknown function UPF0126  29.47 
 
 
211 aa  87  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1098  putative transmembrane protein  29.84 
 
 
213 aa  87  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0167  protein of unknown function UPF0126  29.67 
 
 
206 aa  85.9  5e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2576  hypothetical protein  34.74 
 
 
201 aa  85.9  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1380  hypothetical protein  34.91 
 
 
204 aa  86.3  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0997848  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20410  predicted membrane protein  30 
 
 
303 aa  86.3  5e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3616  hypothetical protein  31.58 
 
 
210 aa  85.9  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.636133  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  29.69 
 
 
205 aa  85.9  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0647  protein of unknown function UPF0126  29 
 
 
217 aa  85.5  8e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2782  hypothetical protein  29.95 
 
 
209 aa  84.7  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2651  hypothetical protein  29.95 
 
 
209 aa  84.7  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0434  protein of unknown function UPF0126  30.3 
 
 
204 aa  84.7  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  35.9 
 
 
207 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  31 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  27.62 
 
 
213 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0302  protein of unknown function UPF0126  32.21 
 
 
239 aa  84  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4375  protein of unknown function UPF0126  29.47 
 
 
211 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133471  normal  0.220192 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  31 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  31 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4342  hypothetical protein  27.86 
 
 
206 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  27.62 
 
 
213 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  27.62 
 
 
213 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  27.62 
 
 
213 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2854  hypothetical protein  32.26 
 
 
209 aa  84  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.209726 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0933  hypothetical protein  31.37 
 
 
207 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0493  hypothetical protein  31.37 
 
 
207 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.179454  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  31 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50920  hypothetical protein  27.86 
 
 
206 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000428082 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0972  hypothetical protein  31.37 
 
 
207 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  32.34 
 
 
208 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1115  membrane protein  34.66 
 
 
204 aa  83.6  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0182  hypothetical protein  32.09 
 
 
205 aa  84  0.000000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  35.9 
 
 
206 aa  84  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0628  hypothetical protein  30.81 
 
 
208 aa  84  0.000000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.0000000261982  hitchhiker  0.0000034229 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2426  hypothetical protein  30.07 
 
 
207 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1076  hypothetical protein  29.73 
 
 
210 aa  82.8  0.000000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.118965  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  31.84 
 
 
208 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1699  protein of unknown function UPF0126  31.64 
 
 
218 aa  82.8  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0237886  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1367  hypothetical protein  30.39 
 
 
223 aa  82.4  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000869837 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4901  hypothetical protein  28.04 
 
 
203 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0844  hypothetical protein  30.72 
 
 
207 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4777  hypothetical protein  28.04 
 
 
203 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.470301  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4075  hypothetical protein  30.07 
 
 
207 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.737664  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2079  protein of unknown function UPF0126  28.4 
 
 
218 aa  82.4  0.000000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4692  hypothetical protein  28.04 
 
 
203 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0832  hypothetical protein  30.72 
 
 
207 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3716  hypothetical protein  37.01 
 
 
219 aa  82.4  0.000000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560977  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1555  hypothetical protein  33.33 
 
 
209 aa  82  0.000000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000546939 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0632  hypothetical protein  29.45 
 
 
206 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1493  hypothetical protein  34.78 
 
 
213 aa  81.6  0.00000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1683  hypothetical protein  31.16 
 
 
220 aa  82  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000472975 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1491  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0126 domain protein)  33.96 
 
 
208 aa  81.6  0.00000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  31.34 
 
 
208 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>