113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1299 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1299  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 133 aa  273  7e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04930  hypothetical protein  41.35 
 
 		 145 aa  95.9  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2248  thioesterase superfamily protein  36.75 
 
 		 138 aa  83.6  8e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1470  hypothetical protein  34.19 
 
 		 133 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.966701  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1645  phenylacetic acid degradation protein  34.92 
 
 		 136 aa  76.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1701  thioesterase superfamily protein  38.4 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000649367  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1555  phenylacetic acid degradation-related protein  35.71 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000594632  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1848  phenylacetic acid degradation-related protein  31.75 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2154  thioesterase superfamily protein  38.98 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.770141  normal  0.098751 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2152  thioesterase superfamily protein  32.8 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3719  thioesterase superfamily protein  41.27 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.670455 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04950  uncharacterized protein, possibly involved in aromatic compounds catabolism  44.44 
 
 		 101 aa  64.7  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1737  thioesterase superfamily protein  37.76 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000190297  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0402  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.86 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.925599  decreased coverage  0.0065275 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2628  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.48 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45641  normal  0.0525731 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3825  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.44 
 
 		 141 aa  57  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.17422  normal  0.478257 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1830  phenylacetic acid degradation protein PaaD  41.12 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.307923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1384  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487893 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0386  thioesterase superfamily protein  32.2 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2871  phenylacetic acid degradation protein  38.32 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165217  normal  0.133325 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  28.7 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0658  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.11 
 
 		 146 aa  53.5  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3635  phenylacetic acid degradation protein PaaD  41.11 
 
 		 157 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.182413  normal  0.29852 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0902  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.18 
 
 		 165 aa  53.5  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0985  phenylacetic acid degradation protein  33.09 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.594777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1324  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.37 
 
 		 124 aa  52.8  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0859981 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3080  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.33 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.378312 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1510  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.07 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269892  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0373  phenylacetic acid degradation-related protein:phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.71 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000506078  hitchhiker  0.00000423415 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0297  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.64 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05295  hypothetical protein  30.08 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.702585  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3366  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.61 
 
 		 154 aa  52  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27764  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2249  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.92 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0320405  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0682  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.96 
 
 		 158 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1483  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.92 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1581  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.92 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2259  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.92 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.059519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0937  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.91 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0937  thioesterase family protein  33.02 
 
 		 136 aa  50.8  0.000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0346835  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4800  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.04 
 
 		 154 aa  50.4  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.283675  normal  0.204675 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5525  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.04 
 
 		 148 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.717257  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0439  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.33 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.778856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0821  thioesterase superfamily protein  31.5 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1553  thioesterase superfamily protein  32.12 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0657  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.63 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0232  hypothetical protein  31.58 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000358883  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0478  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.39 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5041  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.56 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_808  thioesterase  32.08 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3098  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.03 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278086 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2692  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.33 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250107  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2751  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.96 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00224854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2481  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.91 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000323431  hitchhiker  0.00762361 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  30.63 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1924  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.78 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.082152  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0467  phenylacetic acid degradation- related thioesterase (PaaI)  34.21 
 
 		 153 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2890  thioesterase superfamily protein  33.04 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26560  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.59 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.190774 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2320  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.28 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1660  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.19 
 
 		 164 aa  47.4  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.388826  normal  0.270829 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2615  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.84 
 
 		 146 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.518393  normal  0.199542 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3116  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.79 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00121794  normal  0.101093 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  30.53 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3164  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.71 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000726933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2351  hypothetical protein  35.83 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00694587  normal  0.0126121 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  30.56 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3047  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.43 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  32.11 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3281  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.03 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2874  phenylacetic acid degradation protein  37.25 
 
 		 155 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00122895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2565  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.02 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0540  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.02 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460721  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0286  hypothetical protein  29.36 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2478  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.03 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2854  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.96 
 
 		 152 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0283833  normal  0.621321 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4159  thioesterase superfamily protein  29.81 
 
 		 133 aa  44.7  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.588084  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4483  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.08 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0207  thioesterase superfamily protein  34.26 
 
 		 160 aa  44.3  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2844  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 		 161 aa  44.7  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0512  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.02 
 
 		 150 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.245476  normal  0.787837 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2404  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.71 
 
 		 150 aa  44.7  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.671288 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1510  hypothetical protein  27.68 
 
 		 145 aa  44.3  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382765  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3627  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.43 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0218071  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2476  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  26.52 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3016  phenylacetic acid degradation-related protein:phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.56 
 
 		 178 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0445  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.48 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  26.52 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2696  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.91 
 
 		 160 aa  42.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.165626  hitchhiker  0.00035972 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0470  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.48 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0904963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3489  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.95 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00562362  hitchhiker  0.000228083 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05030  phenylacetic acid degradation protein  29.63 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1237  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.71 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2608  phenylacetic acid degradation-related protein  30.91 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824711  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2652  hypothetical protein  30.91 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  28.83 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2638  hypothetical protein  30.91 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  26.52 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2903  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.48 
 
 		 154 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00325077  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0829  hypothetical protein  30.89 
 
 		 138 aa  42  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>