69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_1599 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_1599  intergrase  100 
 
 		 380 aa  796    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122116 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1650  phage integrase family protein  78.72 
 
 		 311 aa  513  1e-144  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.187891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1426  site-specific recombinase, phage integrase family  50.81 
 
 		 376 aa  400  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0270724  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1415  phage integrase family site specific recombinase  50.81 
 
 		 376 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0278227  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1744  site-specific recombinase, phage integrase family  50.81 
 
 		 376 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000266789  hitchhiker  0.000213416 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3178  site-specific recombinase, phage integrase family  50.54 
 
 		 376 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0439431  hitchhiker  0.000000000000369688 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1821  site-specific recombinase, phage integrase family  50.54 
 
 		 376 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0160439  hitchhiker  0.00000000000638112 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2028  integrase family protein  62.89 
 
 		 260 aa  341  1e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0383876  normal  0.0301338 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1503  phage integrase family protein  43.73 
 
 		 372 aa  335  1e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.279125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1248  phage integrase family protein  44 
 
 		 372 aa  330  2e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0661784  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2269  phage integrase family protein  44.97 
 
 		 372 aa  328  1.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0691132  hitchhiker  0.00139304 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1841  phage integrase family protein  40.55 
 
 		 394 aa  292  6e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0400369  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1532  phage integrase, putative  38.95 
 
 		 368 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal  0.0751805 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0656  Phage integrase  36.27 
 
 		 372 aa  219  7.999999999999999e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0877  phage integrase family protein  34.78 
 
 		 356 aa  203  5e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2889  lambda integrase  34.78 
 
 		 356 aa  202  5e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  normal  0.0727877 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0800  phage integrase family protein  34.51 
 
 		 356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.501928  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2023  phage integrase  36.11 
 
 		 359 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.280518  normal  0.814063 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2029  phage integrase  36.31 
 
 		 359 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188872  normal  0.0993134 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1379  phage integrase  36.59 
 
 		 359 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000565692 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1432  integrase  36.24 
 
 		 359 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00370653  normal  0.301971 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2946  integrase  34.46 
 
 		 312 aa  177  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00837646  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2084  integrase  37.98 
 
 		 284 aa  176  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.266989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2426  integrase family protein  34.55 
 
 		 362 aa  173  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1011  integrase-like protein  32.04 
 
 		 375 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1674  lambda integrase  33.93 
 
 		 385 aa  163  5.0000000000000005e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.154447  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00705  hypothetical protein  30.77 
 
 		 304 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000850407  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0688  phage integrase  37.38 
 
 		 228 aa  125  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000188097  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7378  hypothetical protein  39.46 
 
 		 194 aa  107  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0269984 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  32.45 
 
 		 326 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4057  site-specific recombinase, phage integrase family  24.62 
 
 		 325 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251442  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2577  hypothetical protein  29.9 
 
 		 394 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0261207  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2016  putative cytoplasmic protein  38.46 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544327 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2069  hypothetical protein  38.46 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00702  hypothetical protein  57.69 
 
 		 54 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000701341  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2301  integrase protein  22.08 
 
 		 329 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.054386  hitchhiker  1.04073e-17 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1255  integrase  37.37 
 
 		 119 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1711  phage integrase family site specific recombinase  22.88 
 
 		 412 aa  50.8  0.00004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.109481  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1428  hypothetical protein  52.94 
 
 		 72 aa  50.8  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3920  phage integrase, putative  26.01 
 
 		 349 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.227044  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2096  phage integrase family protein  25.13 
 
 		 200 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000635069  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  24.91 
 
 		 351 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3971  integrase family protein  22.3 
 
 		 340 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1340  phage-related integrase  23.94 
 
 		 339 aa  48.5  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2954  integrase family protein  29.2 
 
 		 409 aa  47.8  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  23.88 
 
 		 354 aa  47.8  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4708  integrase family protein  21.29 
 
 		 342 aa  47.4  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.014031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0894  phage-related integrase  25.13 
 
 		 339 aa  47.4  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1185  phage-related integrase  29.87 
 
 		 339 aa  47.4  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0429  phage-related integrase  25.79 
 
 		 339 aa  47.4  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  24.02 
 
 		 432 aa  47.4  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2546  phage integrase family protein  24.64 
 
 		 400 aa  46.2  0.0009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40023  hitchhiker  0.00168033 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1275  integrase family protein  25.79 
 
 		 339 aa  45.8  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4258  phage integrase family site specific recombinase  22.93 
 
 		 293 aa  45.8  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3294  phage integrase family protein  28.33 
 
 		 360 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2290  phage-related integrase  27.67 
 
 		 346 aa  45.4  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0241  Phage integrase  23.6 
 
 		 377 aa  45.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1390  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.36 
 
 		 328 aa  45.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000179914  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1083  integrase family protein  29.22 
 
 		 339 aa  44.3  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000439188  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0376  integrase family protein  24.61 
 
 		 339 aa  43.9  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2100  putative integrase  26.58 
 
 		 529 aa  43.9  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1722  hypothetical protein  26.94 
 
 		 339 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5336  integrase family protein  26.8 
 
 		 378 aa  43.5  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2257  phage integrase family site specific recombinase  23.27 
 
 		 342 aa  43.5  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0808  integrase family protein  28.57 
 
 		 339 aa  43.5  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3779  phage integrase family protein  24.46 
 
 		 404 aa  43.1  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.794944 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6147  Integrase  21.7 
 
 		 344 aa  43.1  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1212  integrase family protein  25.26 
 
 		 339 aa  43.1  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1726  phage integrase family protein  21.8 
 
 		 395 aa  42.7  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>