More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1794 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1794  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  328  2e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.786211 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1030  hypothetical protein  66.67 
 
 		 147 aa  167  4e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.163763 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0391  hypothetical protein  44.74 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.588550000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1410  hypothetical protein  71.79 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000260045  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1141  MSHA pilin protein MshB  39.29 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0550  methylation site containing protein  30.09 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000424061  normal  0.764365 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0395  methylation site containing protein  30.97 
 
 		 211 aa  57.4  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0635812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  52.94 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  52.94 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3268  hypothetical protein  38.14 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.359601  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  41.57 
 
 		 133 aa  53.9  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  43.37 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0754  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  50 
 
 		 195 aa  53.5  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.430859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0760  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  42.42 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.014468  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1172  hypothetical protein  33.33 
 
 		 118 aa  52.8  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123806  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  45.28 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  46.55 
 
 		 152 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17770  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein  29.13 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.775526 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  32.38 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0324  hypothetical protein  46.55 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00212965  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4569  MSHA pilin protein MshA  41.56 
 
 		 187 aa  52.4  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442923  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  32.29 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  43.55 
 
 		 179 aa  52  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2540  fimbrial protein pilin  46 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1142  general secretion  33.94 
 
 		 121 aa  51.6  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000033549  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1036  hypothetical protein  44.9 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0856  methylation site containing protein  37.08 
 
 		 182 aa  52  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4570  MSHA pilin protein MshB  43.75 
 
 		 229 aa  51.6  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.527275  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3363  methylation  63.64 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57133  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  46.94 
 
 		 142 aa  51.6  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3315  pilin, putative  41.18 
 
 		 185 aa  51.6  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.540059  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0883  general secretion pathway protein H  48.84 
 
 		 146 aa  51.2  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0109332  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3657  methylation site containing protein  28.85 
 
 		 205 aa  51.2  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000205665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3550  Tfp pilus assembly protein PilE  40 
 
 		 164 aa  51.2  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.844187  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4106  MSHA pilin protein MshB  28.85 
 
 		 205 aa  51.2  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0320  N- methylation  32.71 
 
 		 141 aa  50.8  0.000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0568  methylation site containing protein  34.72 
 
 		 169 aa  50.8  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.238644  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  41.82 
 
 		 144 aa  50.8  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_003296  RS00348  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  33.33 
 
 		 128 aa  50.4  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0472  methylation site containing protein  28.85 
 
 		 205 aa  50.4  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000795599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  46.94 
 
 		 142 aa  50.4  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3189  fimbrial protein pilin  44 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  normal  0.535395 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0576  hypothetical protein  32.43 
 
 		 174 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0726397 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  38.33 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2151  membrane protein  43.4 
 
 		 186 aa  50.1  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3217  hypothetical protein  54.76 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000170582 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2664  methylation  43.64 
 
 		 160 aa  50.4  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  44.44 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4411  methylation site containing protein  44.44 
 
 		 219 aa  50.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000316241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3758  hypothetical protein  32.43 
 
 		 174 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2452  methylation site containing protein  31.06 
 
 		 197 aa  50.1  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00816638  normal  0.444869 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  40.68 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3866  hypothetical protein  33.02 
 
 		 191 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0460  MSHA pilin protein MshB  45.45 
 
 		 201 aa  49.7  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2827  MSHA pilin protein MshA  52.94 
 
 		 178 aa  49.3  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.99325  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0490  MSHA pilin protein MshB  48.72 
 
 		 205 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000965015  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0511  MSHA pilin protein MshB  48.72 
 
 		 205 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000086206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  42.59 
 
 		 144 aa  49.7  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3829  MSHA pilin protein MshB  48.72 
 
 		 205 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000175672  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0512  methylation site containing protein  57.14 
 
 		 182 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000175657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0464  hypothetical protein  33.02 
 
 		 191 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0366  N-terminal methylation  41.18 
 
 		 132 aa  49.7  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  33.96 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0842  hypothetical protein  37.93 
 
 		 193 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0514  MSHA pilin protein MshB  48.72 
 
 		 205 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00061527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1321  general secretion pathway protein G  44.44 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2882  methylation  42.86 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.938712  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0530  hypothetical protein  43.33 
 
 		 192 aa  49.7  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002375  MSHA pilin protein MshA  52.5 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0138724  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0491  methylation site containing protein  57.14 
 
 		 186 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000497616  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3480  methylation site containing protein  28.85 
 
 		 205 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000493749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3762  methylation site containing protein  30.68 
 
 		 202 aa  49.7  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000262752  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00258  MSHA pilin protein MshA  32.47 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3745  methylation site containing protein  48.72 
 
 		 201 aa  49.7  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0403042  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  44.44 
 
 		 148 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0448  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0134  hypothetical protein  30.51 
 
 		 139 aa  48.9  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0384  putative pilin  35.38 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4105  MSHA pilin protein MshA  57.14 
 
 		 171 aa  48.9  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0566  MSHA pilin protein MshB  46.15 
 
 		 205 aa  49.3  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.571105  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2532  general secretion pathway protein G  42.59 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211317  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0654  general secretion pathway protein G  38.71 
 
 		 159 aa  48.9  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0121173  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3340  methylation  57.14 
 
 		 172 aa  48.9  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000827612  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3341  methylation  48.72 
 
 		 205 aa  48.9  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000885834  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4704  Type II secretion system protein G  37.04 
 
 		 145 aa  48.9  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0140964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0551  MSHA pilin protein MshA  35.48 
 
 		 173 aa  48.9  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000258454  normal  0.542221 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3828  methylation site containing protein  57.5 
 
 		 172 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000112537  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3100  hypothetical protein  50 
 
 		 136 aa  48.9  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0675  general secretion pathway protein G  38.71 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186648  normal  0.343045 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3744  methylation site containing protein  51.22 
 
 		 173 aa  48.9  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.144711  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  40.98 
 
 		 141 aa  48.9  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20881  pilin  31.65 
 
 		 159 aa  48.9  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0396  methylation site containing protein  48.78 
 
 		 169 aa  48.5  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0195536  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3781  hypothetical protein  37.5 
 
 		 172 aa  48.5  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  39.62 
 
 		 176 aa  48.5  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3044  general secretion pathway protein G  30.09 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0461  MSHA pilin protein MshA  40.68 
 
 		 172 aa  48.5  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20891  pilin  39.22 
 
 		 170 aa  48.5  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1176  hypothetical protein  35.29 
 
 		 163 aa  48.1  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3761  MSHA pilin protein MshA  35.48 
 
 		 178 aa  48.1  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000202365  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>