More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1735 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1735  trigger factor  100 
 
 		 433 aa  873    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0657081  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0109  trigger factor  76.74 
 
 		 432 aa  702    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17984 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2222  trigger factor  67.45 
 
 		 438 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.939539  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0690  trigger factor  58.84 
 
 		 452 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.110264  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0510  trigger factor  53.95 
 
 		 448 aa  462  1e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.155195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0198  trigger factor  50 
 
 		 435 aa  437  1e-121  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  29.7 
 
 		 433 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  27.74 
 
 		 433 aa  216  8e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  28.47 
 
 		 437 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  26.76 
 
 		 431 aa  196  8.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  29.33 
 
 		 439 aa  194  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  29.16 
 
 		 435 aa  194  4e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  28.94 
 
 		 435 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  30.44 
 
 		 446 aa  185  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  27.55 
 
 		 429 aa  180  4.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1549  trigger factor  30.38 
 
 		 463 aa  179  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1929  trigger factor  29.32 
 
 		 440 aa  178  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2692  trigger factor  26.21 
 
 		 443 aa  177  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538517  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  28.64 
 
 		 438 aa  177  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  28.34 
 
 		 433 aa  176  9.999999999999999e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  28.6 
 
 		 428 aa  173  5e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  29.26 
 
 		 448 aa  172  9e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  27.63 
 
 		 426 aa  171  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  30.1 
 
 		 442 aa  171  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2739  trigger factor  30.86 
 
 		 440 aa  170  4e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.138547  decreased coverage  0.00279907 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2048  trigger factor  30.18 
 
 		 454 aa  169  6e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0916  trigger factor  29.15 
 
 		 440 aa  169  9e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  27.17 
 
 		 438 aa  169  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3235  trigger factor  28.6 
 
 		 512 aa  169  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112931  normal  0.882786 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4984  trigger factor  27.83 
 
 		 448 aa  167  4e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  30.29 
 
 		 428 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2185  trigger factor  29.01 
 
 		 460 aa  163  5.0000000000000005e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.368629  normal  0.570218 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3605  trigger factor  27.8 
 
 		 471 aa  162  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  27.63 
 
 		 435 aa  162  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1176  trigger factor  27.68 
 
 		 436 aa  161  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3400  trigger factor  29.23 
 
 		 481 aa  161  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2289  trigger factor  31.63 
 
 		 450 aa  162  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.030502  normal  0.410432 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  25.78 
 
 		 436 aa  161  2e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7296  trigger factor  31.93 
 
 		 466 aa  160  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.648727 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  27.25 
 
 		 433 aa  160  5e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  27.25 
 
 		 433 aa  160  5e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1561  trigger factor  25.41 
 
 		 437 aa  160  5e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.528079  decreased coverage  0.00345443 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  27.07 
 
 		 428 aa  160  6e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  25.74 
 
 		 488 aa  158  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  28.35 
 
 		 434 aa  159  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00701  trigger factor  27.89 
 
 		 479 aa  158  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.195146 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  26.9 
 
 		 432 aa  158  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2160  trigger factor  28.47 
 
 		 464 aa  158  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000432452 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  28.95 
 
 		 425 aa  157  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  25.94 
 
 		 435 aa  157  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7292  trigger factor  28.84 
 
 		 468 aa  156  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46399  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5275  trigger factor  30.46 
 
 		 507 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1830  trigger factor  29.41 
 
 		 443 aa  155  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1826  trigger factor  29.41 
 
 		 443 aa  155  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1181  trigger factor  29.44 
 
 		 491 aa  155  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.176713  normal  0.0554389 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  25.45 
 
 		 435 aa  155  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  26.34 
 
 		 438 aa  154  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004045  cell division trigger factor  27.21 
 
 		 435 aa  155  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000395206  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1528  trigger factor  26.51 
 
 		 481 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156362  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  27.64 
 
 		 446 aa  154  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1513  trigger factor  27.21 
 
 		 433 aa  153  5e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000677902  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  31.72 
 
 		 436 aa  153  5e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1677  trigger factor  28.65 
 
 		 443 aa  153  5e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294765  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3500  trigger factor  28.18 
 
 		 465 aa  153  5e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.216991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0066  trigger factor  27.61 
 
 		 469 aa  153  5.9999999999999996e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0586  trigger factor  27.05 
 
 		 485 aa  153  5.9999999999999996e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.960131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3059  trigger factor  28.71 
 
 		 513 aa  153  7e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438703  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3879  trigger factor  28.89 
 
 		 448 aa  152  8.999999999999999e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129636  hitchhiker  0.00665931 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1464  trigger factor  28.02 
 
 		 435 aa  152  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0604  trigger factor  28.28 
 
 		 436 aa  152  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2912  trigger factor  27.97 
 
 		 462 aa  151  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17811  trigger factor  26.79 
 
 		 471 aa  151  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3480  trigger factor  27.74 
 
 		 471 aa  151  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0553  trigger factor  25.82 
 
 		 474 aa  150  4e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.017975  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  27.01 
 
 		 427 aa  150  5e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0063  trigger factor  28.23 
 
 		 447 aa  149  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.461988  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3354  trigger factor  28.47 
 
 		 429 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0767  trigger factor  27.5 
 
 		 424 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2644  trigger factor  25.7 
 
 		 436 aa  148  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156375 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3114  trigger factor  26.17 
 
 		 434 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000617295  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0736  trigger factor  27.87 
 
 		 449 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.45082  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  26.57 
 
 		 425 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  26.57 
 
 		 425 aa  147  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  26.57 
 
 		 425 aa  147  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2049  trigger factor  26.91 
 
 		 436 aa  147  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431317  normal  0.217945 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  26.57 
 
 		 425 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  26.57 
 
 		 425 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1790  trigger factor  27.51 
 
 		 476 aa  147  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.147522  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2922  trigger factor  30.22 
 
 		 460 aa  147  3e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.583147  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1703  trigger factor  27.46 
 
 		 494 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216762  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  26.57 
 
 		 425 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0751  trigger factor  24.59 
 
 		 437 aa  147  4.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.173993  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1204  trigger factor  29.41 
 
 		 483 aa  147  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00286566  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1538  trigger factor  30.18 
 
 		 478 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1214  trigger factor  24.36 
 
 		 437 aa  146  6e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3436  trigger factor  27.78 
 
 		 429 aa  146  6e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3500  trigger factor  27.78 
 
 		 429 aa  146  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  26.33 
 
 		 425 aa  146  6e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3518  trigger factor  29.1 
 
 		 471 aa  146  6e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  26 
 
 		 434 aa  145  9e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>