121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1424 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1424  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 360 aa  719    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0375  permease YjgP/YjgQ family protein  64.43 
 
 		 361 aa  433  1e-120  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0887769 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1949  permease, putative  53.91 
 
 		 359 aa  402  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000528059  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1297  permease YjgP/YjgQ family protein  44.82 
 
 		 358 aa  317  1e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0266045  normal  0.200906 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1803  permease YjgP/YjgQ family protein  42.38 
 
 		 360 aa  276  3e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  27.62 
 
 		 359 aa  126  7e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  25.53 
 
 		 362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0188  permease YjgP/YjgQ family protein  24.86 
 
 		 360 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258028  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  26.26 
 
 		 358 aa  104  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  23.16 
 
 		 356 aa  100  4e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  25.58 
 
 		 359 aa  93.6  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  21.08 
 
 		 359 aa  89.7  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  21.08 
 
 		 391 aa  89  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3906  permease YjgP/YjgQ family protein  25.36 
 
 		 364 aa  85.9  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  24.51 
 
 		 360 aa  84.3  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  24.54 
 
 		 356 aa  82  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  24.44 
 
 		 360 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  21.89 
 
 		 391 aa  78.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  20.78 
 
 		 359 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2209  permease YjgP/YjgQ family protein  27.03 
 
 		 377 aa  77.4  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.145759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  22.74 
 
 		 365 aa  77.4  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2177  permease YjgP/YjgQ  26.21 
 
 		 366 aa  76.3  0.0000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  22.64 
 
 		 360 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1639  permease YjgP/YjgQ family protein  23.73 
 
 		 359 aa  76.3  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000266176  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1407  permease YjgP/YjgQ family protein  25.27 
 
 		 378 aa  72.8  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.185064 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  24.22 
 
 		 389 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  21.82 
 
 		 388 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0044  permease YjgP/YjgQ family protein  19.89 
 
 		 362 aa  65.1  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.484166  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  25.96 
 
 		 391 aa  64.7  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5837  permease YjgP/YjgQ family protein  26.69 
 
 		 362 aa  62.8  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2785  permease YjgP/YjgQ family protein  23.73 
 
 		 358 aa  62.8  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661197  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  21.33 
 
 		 392 aa  61.6  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1120  permease YjgP/YjgQ family protein  25.87 
 
 		 364 aa  62  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.187975 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1395  permease YjgP/YjgQ family protein  28.29 
 
 		 360 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1984  permease YjgP/YjgQ family protein  19.5 
 
 		 358 aa  61.2  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  23.18 
 
 		 393 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  23.18 
 
 		 393 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  20.91 
 
 		 386 aa  60.5  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1510  permease YjgP/YjgQ family protein  22.02 
 
 		 396 aa  60.5  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161428 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  20.06 
 
 		 360 aa  60.5  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5099  permease YjgP/YjgQ family protein  27.52 
 
 		 362 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.624296  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1491  permease YjgP/YjgQ family protein  27.25 
 
 		 360 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.269853  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2464  permease YjgP/YjgQ  26.97 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0984614  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  22.9 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1189  permease YjgP/YjgQ family protein  26.3 
 
 		 365 aa  58.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.216183  normal  0.433432 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1909  permease YjgP/YjgQ  23.49 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0495  permease YjgP/YjgQ  22.7 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3932  permease YjgP/YjgQ family protein  23.53 
 
 		 362 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2026  permease YjgP/YjgQ family protein  21.29 
 
 		 358 aa  57  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.507643  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1545  permease YjgP/YjgQ family protein  25.34 
 
 		 364 aa  57.4  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1429  permease YjgP/YjgQ family protein  19.55 
 
 		 367 aa  57.4  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.398459  normal  0.880258 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  22.61 
 
 		 395 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  19.45 
 
 		 1040 aa  57  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2901  putative permease  25.34 
 
 		 364 aa  57  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220999  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  21.74 
 
 		 401 aa  56.2  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  20.98 
 
 		 792 aa  55.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3649  permease YjgP/YjgQ family protein  23.53 
 
 		 362 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3942  permease YjgP/YjgQ family protein  23.53 
 
 		 362 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  22.56 
 
 		 379 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  22.52 
 
 		 399 aa  54.3  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  23.26 
 
 		 380 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0555  permease YjgP/YjgQ family protein  22.49 
 
 		 363 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0678448 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3830  putative permease  24.58 
 
 		 365 aa  53.9  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.105268 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  20.95 
 
 		 360 aa  52.8  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  22.4 
 
 		 418 aa  52.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2312  permease YjgP/YjgQ  23.78 
 
 		 362 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0220  permease YjgP/YjgQ  19.93 
 
 		 356 aa  52  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.633981 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3472  permease YjgP/YjgQ family protein  23.74 
 
 		 362 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0678  hypothetical protein  24.93 
 
 		 362 aa  51.6  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4195  permease YjgP/YjgQ family protein  24.44 
 
 		 358 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0112  permease YjgP/YjgQ family protein  21.57 
 
 		 370 aa  52  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.378963  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1211  permease YjgP/YjgQ family protein  23.59 
 
 		 362 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000556533 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0148  permease YjgP/YjgQ family protein  18.92 
 
 		 364 aa  52  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.496142  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0686  hypothetical protein  25.21 
 
 		 362 aa  50.8  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0507  YjgP/YjgQ permease  23.25 
 
 		 363 aa  50.8  0.00003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  20.18 
 
 		 401 aa  51.2  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0764  permease YjgP/YjgQ family protein  24.22 
 
 		 360 aa  51.2  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.27721 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1067  permease YjgP/YjgQ family protein  22.56 
 
 		 362 aa  50.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000183228 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  20.51 
 
 		 400 aa  50.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2479  permease YjgP/YjgQ  23.81 
 
 		 361 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2602  permease YjgP/YjgQ family protein  24.36 
 
 		 362 aa  50.4  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193291  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  18.21 
 
 		 359 aa  50.1  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4679  permease YjgP/YjgQ family protein  20.11 
 
 		 360 aa  50.1  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  21.29 
 
 		 359 aa  50.1  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2101  hypothetical protein  23.28 
 
 		 356 aa  49.7  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  19.13 
 
 		 360 aa  48.9  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0743  putative permease  23.17 
 
 		 355 aa  49.3  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0528  putative permease  25.59 
 
 		 358 aa  48.9  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0041624  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1678  permease YjgP/YjgQ  22.26 
 
 		 365 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.626554 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  20.6 
 
 		 394 aa  48.5  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2967  permease YjgP/YjgQ  23.36 
 
 		 361 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0631438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  20.05 
 
 		 401 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  21.88 
 
 		 434 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  22.78 
 
 		 374 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0106  permease YjgP/YjgQ family protein  18.18 
 
 		 356 aa  47.8  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  20.47 
 
 		 1061 aa  47.8  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  23.36 
 
 		 371 aa  47  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  20.47 
 
 		 1061 aa  46.6  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0679  permease YjgP/YjgQ family protein  23.27 
 
 		 350 aa  45.8  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2138  permease YjgP/YjgQ  25 
 
 		 353 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>