More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0262 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0262  Serine--pyruvate transaminase  100 
 
 		 376 aa  745    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0641  Alanine--glyoxylate transaminase  43.55 
 
 		 370 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.322561  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2509  alanine-glyoxylate aminotransferase  42.78 
 
 		 377 aa  300  3e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1789  Serine--pyruvate transaminase  44.92 
 
 		 367 aa  296  4e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.825864 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002358  serine--pyruvate aminotransferase/L-alanine:glyoxylate aminotransferase  44.17 
 
 		 373 aa  295  9e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5312  Serine--pyruvate transaminase  46.94 
 
 		 371 aa  294  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.295521 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03710  aminotransferase  43.33 
 
 		 382 aa  290  3e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2538  Serine--pyruvate transaminase  41.13 
 
 		 413 aa  288  1e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102161  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3277  Serine--pyruvate transaminase  43.89 
 
 		 376 aa  287  2e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0445  aminotransferase class-V  42.06 
 
 		 369 aa  286  4e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2043  Serine--pyruvate transaminase  41.78 
 
 		 375 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2810  aminotransferase, class V  43.82 
 
 		 372 aa  285  1.0000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0426  alanine--glyoxylate transaminase  42.05 
 
 		 380 aa  281  1e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2994  alanine-glyoxylate aminotransferase  43.82 
 
 		 395 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0447  Serine--pyruvate transaminase  42.15 
 
 		 380 aa  281  2e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3093  aminotransferase class V  43.82 
 
 		 396 aa  279  6e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3194  aminotransferase class V  43.82 
 
 		 396 aa  279  6e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0294  alanine--glyoxylate transaminase  42.58 
 
 		 380 aa  278  8e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4343  aminotransferase, class V  42.11 
 
 		 378 aa  276  4e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4027  Serine--pyruvate transaminase  41.83 
 
 		 377 aa  275  7e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.710058  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0350  Serine--pyruvate transaminase  41.71 
 
 		 378 aa  275  8e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0404  Serine--pyruvate transaminase  41.99 
 
 		 379 aa  275  8e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3930  Serine--pyruvate transaminase  41.55 
 
 		 377 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4160  Serine--pyruvate transaminase  41.6 
 
 		 380 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0360  alanine-glyoxylate aminotransferase  42.11 
 
 		 377 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4124  Serine--pyruvate transaminase  41.83 
 
 		 377 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1551  Alanine--glyoxylate transaminase  41.69 
 
 		 393 aa  273  3e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3660  alanine-glyoxylate aminotransferase  42.11 
 
 		 377 aa  273  3e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0366  alanine-glyoxylate aminotransferase  41.83 
 
 		 377 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4005  Serine--pyruvate transaminase  41.55 
 
 		 377 aa  272  6e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2128  aminotransferase, class V  39.78 
 
 		 391 aa  272  8.000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3610  alanine--glyoxylate transaminase  42.11 
 
 		 377 aa  271  2e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4878  aminotransferase, class V  40 
 
 		 373 aa  269  5.9999999999999995e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0765505  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2190  aminotransferase, class V  41.27 
 
 		 373 aa  268  1e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0995229  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5094  aminotransferase class V  41.53 
 
 		 381 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3795  aminotransferase class V  41.45 
 
 		 375 aa  262  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1895  Serine--pyruvate transaminase  41.5 
 
 		 393 aa  262  8e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3847  aminotransferase class V  41.16 
 
 		 375 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.15565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2957  aminotransferase class V  43.06 
 
 		 392 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.351742 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01996  putative serine-pyruvate aminotransferase  40.52 
 
 		 344 aa  260  3e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.033045  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0552  aminotransferase, class V  43.77 
 
 		 312 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10021  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  36.75 
 
 		 394 aa  249  4e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09411  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  36.47 
 
 		 394 aa  248  8e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.427075  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09401  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  36.18 
 
 		 394 aa  246  3e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5058  alanine-glyoxylate aminotransferase  38.4 
 
 		 381 aa  246  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0881  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  36.18 
 
 		 394 aa  247  3e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.933241  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2160  alanine-glyoxylate aminotransferase  39.15 
 
 		 384 aa  242  1e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0644335 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16451  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  38.48 
 
 		 394 aa  240  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.204159 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1207  alanine-glyoxylate aminotransferase  37.4 
 
 		 394 aa  236  5.0000000000000005e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.811059 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07741  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  35.33 
 
 		 412 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.280804  normal  0.110591 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10251  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  37.5 
 
 		 366 aa  235  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.656234  normal  0.261279 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0142  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  35.23 
 
 		 412 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1263  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  37.4 
 
 		 394 aa  232  9e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1765  aminotransferase class V  39.72 
 
 		 388 aa  227  2e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.333913  normal  0.0106496 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0127  alanine-glyoxylate aminotransferase  37.43 
 
 		 380 aa  224  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.791837  normal  0.0695554 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0163  Alanine--glyoxylate transaminase  34.82 
 
 		 396 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0217  Serine--pyruvate transaminase  35.56 
 
 		 415 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0378021 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1862  aminotransferase class V  38.27 
 
 		 401 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0019  aminotransferase class V  37.15 
 
 		 404 aa  218  1e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2078  Serine--pyruvate transaminase  35.98 
 
 		 455 aa  217  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2424  Serine--pyruvate transaminase  31.82 
 
 		 410 aa  212  7e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102293 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2785  aminotransferase class V  35.81 
 
 		 412 aa  205  9e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000830032 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0914  Serine--pyruvate transaminase  35.29 
 
 		 411 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0199987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2052  aminotransferase, class V  30.48 
 
 		 406 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02497  aminotransferase, class V  32.38 
 
 		 426 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.242157  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3274  alanine-glyoxylate aminotransferase  37.98 
 
 		 389 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0628031  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0454  aminotransferase class V  31.35 
 
 		 406 aa  196  5.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0977  aminotransferase class V  36.11 
 
 		 379 aa  196  5.000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.300897 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0738  aminotransferase class V  36.11 
 
 		 371 aa  193  3e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.873716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3706  Serine--pyruvate transaminase  32.65 
 
 		 436 aa  192  5e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.873168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1114  Serine--pyruvate transaminase  39.44 
 
 		 384 aa  191  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0516564  decreased coverage  0.00189491 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  31.36 
 
 		 384 aa  191  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0881  aminotransferase class V  31.47 
 
 		 414 aa  189  5e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0865  aminotransferase class V  30.87 
 
 		 409 aa  188  1e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.065762  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  35.59 
 
 		 384 aa  187  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03786  purine catabolism protein PucG  34.49 
 
 		 418 aa  187  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  31.55 
 
 		 382 aa  187  3e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3186  aminotransferase, class V  30.08 
 
 		 451 aa  187  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  31.27 
 
 		 382 aa  186  4e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  31.46 
 
 		 382 aa  187  4e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0936  aminotransferase class V  30.61 
 
 		 413 aa  186  8e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.26669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0911  aminotransferase class V  31.2 
 
 		 414 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.345537  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3465  aminotransferase class V  30.67 
 
 		 414 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.637118  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3309  aminotransferase class V  30.93 
 
 		 414 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3325  aminotransferase class V  29.82 
 
 		 441 aa  184  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  30.99 
 
 		 382 aa  184  3e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  30.73 
 
 		 387 aa  181  2e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4850  Alanine--glyoxylate transaminase  33.51 
 
 		 390 aa  180  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  30.49 
 
 		 384 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  30.49 
 
 		 384 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  32.46 
 
 		 385 aa  176  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  32.95 
 
 		 383 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  30.88 
 
 		 382 aa  173  5e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  32.17 
 
 		 384 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  31.43 
 
 		 383 aa  171  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  28.96 
 
 		 387 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  30.54 
 
 		 385 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1547  aminotransferase class V  31.22 
 
 		 381 aa  170  4e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000755241 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  28.88 
 
 		 387 aa  169  5e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  34.82 
 
 		 397 aa  169  6e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>