More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1078 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1078  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 		 572 aa  1144    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  37.56 
 
 		 603 aa  373  1e-102  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1612  DNA mismatch repair protein  38.09 
 
 		 614 aa  372  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.235254  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1499  DNA mismatch repair protein MutL  36.41 
 
 		 589 aa  368  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0993  DNA mismatch repair protein  35.35 
 
 		 589 aa  363  7.0000000000000005e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.139394  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  35.52 
 
 		 612 aa  360  4e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  34.21 
 
 		 605 aa  360  5e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  35.07 
 
 		 622 aa  360  5e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  34.16 
 
 		 606 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  35.29 
 
 		 605 aa  357  3.9999999999999996e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  33.5 
 
 		 602 aa  355  1e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  34.3 
 
 		 620 aa  350  4e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  36.46 
 
 		 586 aa  350  6e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  34.83 
 
 		 605 aa  348  2e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  32.38 
 
 		 628 aa  346  7e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2701  DNA mismatch repair protein MutL  34.66 
 
 		 626 aa  346  8e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00383046  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  33.12 
 
 		 631 aa  345  1e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  39.3 
 
 		 559 aa  345  1e-93  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0977  DNA mismatch repair ATPase  35.62 
 
 		 584 aa  344  2e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0710055  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0554  DNA mismatch repair protein MutL  32.81 
 
 		 565 aa  341  2e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0023  DNA mismatch repair protein MutL  34.91 
 
 		 621 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000493473  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  32.15 
 
 		 647 aa  340  4e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1478  DNA mismatch repair protein MutL  36.76 
 
 		 557 aa  340  4e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.064699  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1006  DNA mismatch repair protein MutL  36.32 
 
 		 566 aa  340  4e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_978  DNA mismatch repair protein, MutL/HexB family  35.88 
 
 		 566 aa  339  8e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2328  DNA mismatch repair protein MutL  35.33 
 
 		 629 aa  338  9.999999999999999e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  34.4 
 
 		 608 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1487  DNA mismatch repair protein MutL  32.16 
 
 		 622 aa  336  5.999999999999999e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.101291  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1981  DNA mismatch repair protein  34.18 
 
 		 626 aa  336  7e-91  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0934  DNA mismatch repair protein  34.29 
 
 		 603 aa  336  7e-91  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  35.67 
 
 		 620 aa  335  1e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1195  MutL/HexB family DNA mismatch repair protein  35.93 
 
 		 566 aa  335  2e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0321912  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1041  DNA mismatch repair protein MutL  35.5 
 
 		 606 aa  335  2e-90  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  33.44 
 
 		 632 aa  334  3e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  33.23 
 
 		 617 aa  333  6e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1201  DNA mismatch repair protein  35.14 
 
 		 611 aa  332  9e-90  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.894444  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1924  DNA mismatch repair protein MutL  34.73 
 
 		 560 aa  332  1e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  32.72 
 
 		 606 aa  331  2e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4176  DNA mismatch repair protein  34.84 
 
 		 597 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1389  DNA mismatch repair protein  34.56 
 
 		 599 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41073  normal  0.777612 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3225  DNA mismatch repair protein MutL  33.11 
 
 		 599 aa  326  6e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4032  DNA mismatch repair protein  35.01 
 
 		 597 aa  325  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.733731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  33.77 
 
 		 602 aa  323  4e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4855  DNA mismatch repair protein  34.21 
 
 		 595 aa  323  7e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  30.67 
 
 		 607 aa  323  7e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  31.31 
 
 		 607 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  30.84 
 
 		 608 aa  322  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2548  DNA mismatch repair protein  34.05 
 
 		 603 aa  320  5e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  32.48 
 
 		 623 aa  319  7e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  32.48 
 
 		 623 aa  319  7e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1217  DNA mismatch repair protein  34 
 
 		 612 aa  319  7e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469734  normal  0.0661873 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1168  DNA mismatch repair protein  35.34 
 
 		 588 aa  319  7.999999999999999e-86  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.985109  normal  0.444607 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1575  DNA mismatch repair protein MutL  32.54 
 
 		 648 aa  317  5e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1951  DNA mismatch repair protein  32.65 
 
 		 585 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448925  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  31.86 
 
 		 612 aa  313  5.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  33.74 
 
 		 644 aa  311  1e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  31.82 
 
 		 632 aa  312  1e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0034  DNA mismatch repair protein MutL  32.55 
 
 		 590 aa  311  1e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07070  putative DNA mismatch repair protein  32 
 
 		 617 aa  310  2.9999999999999997e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.748012  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  32.15 
 
 		 616 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  33.11 
 
 		 600 aa  310  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1084  DNA mismatch repair protein MutL  32.15 
 
 		 630 aa  310  5e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.967595  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0628  DNA mismatch repair protein MutL  32.82 
 
 		 582 aa  306  5.0000000000000004e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100256  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  31.65 
 
 		 630 aa  306  7e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  31.25 
 
 		 601 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  32.03 
 
 		 644 aa  304  3.0000000000000004e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  32.34 
 
 		 600 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3811  DNA mismatch repair protein MutL  31.26 
 
 		 629 aa  302  1e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0491  DNA mismatch repair protein  31.53 
 
 		 594 aa  302  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0595243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  31.07 
 
 		 605 aa  301  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  34.42 
 
 		 575 aa  301  3e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  30.96 
 
 		 621 aa  300  4e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  31.82 
 
 		 619 aa  300  4e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0014  DNA mismatch repair protein  33.39 
 
 		 610 aa  300  4e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  30.27 
 
 		 625 aa  299  1e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4047  DNA mismatch repair protein  31.44 
 
 		 610 aa  299  1e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  34.25 
 
 		 574 aa  299  1e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4632  DNA mismatch repair protein MutL  30.06 
 
 		 661 aa  298  2e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.56362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  30.61 
 
 		 615 aa  297  4e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1517  DNA mismatch repair protein MutL  31.27 
 
 		 598 aa  296  6e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  31.48 
 
 		 611 aa  296  6e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  32.04 
 
 		 641 aa  295  1e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0616  DNA mismatch repair protein  32.91 
 
 		 633 aa  295  1e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0800065 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2127  DNA mismatch repair protein  31.11 
 
 		 603 aa  294  2e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  30.7 
 
 		 629 aa  293  6e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  31.36 
 
 		 643 aa  291  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4044  DNA mismatch repair protein MutL  31.22 
 
 		 628 aa  290  4e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816003  normal  0.310643 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1711  DNA mismatch repair protein MutL  34.38 
 
 		 588 aa  290  5.0000000000000004e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.619498  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1927  mismatch repair protein MutL  31.31 
 
 		 595 aa  289  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0215  DNA mismatch repair protein MutL  31.97 
 
 		 608 aa  288  1e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.137951 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1599  DNA mismatch repair protein MutL  31.31 
 
 		 595 aa  289  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.907039  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1087  DNA mismatch repair protein MutL  32.36 
 
 		 582 aa  288  2e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0917186  normal  0.0241297 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  30.54 
 
 		 611 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1306  DNA mismatch repair protein  33.55 
 
 		 608 aa  286  8e-76  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.66007  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  44.21 
 
 		 639 aa  286  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0363  DNA mismatch repair protein  31.03 
 
 		 621 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2517  DNA mismatch repair protein  43.05 
 
 		 656 aa  285  1.0000000000000001e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1466  DNA mismatch repair protein MutL  30.02 
 
 		 635 aa  281  3e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.643627  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  30.56 
 
 		 626 aa  280  6e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  30.22 
 
 		 632 aa  280  7e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>