71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0675 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0675  glycoside hydrolase family 57  100 
 
 
1042 aa  2103    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0770  glycoside hydrolase family 57  42.48 
 
 
829 aa  520  1e-146  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3035  glycoside hydrolase family protein  36.99 
 
 
744 aa  504  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3440  family 57 glycoside hydrolase  37.28 
 
 
744 aa  499  1e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4047  glycoside hydrolase family 57  36.39 
 
 
747 aa  489  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.422577 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2965  glycoside hydrolase family 57  34.19 
 
 
749 aa  476  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.993077  normal  0.662325 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4927  glycoside hydrolase family 57  36.56 
 
 
743 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.269999  normal  0.543005 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3153  glycoside hydrolase family 57  34.19 
 
 
749 aa  475  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0856  glycoside hydrolase family protein  37.85 
 
 
732 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  32.23 
 
 
1162 aa  458  1e-127  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3464  glycoside hydrolase family 57  37.72 
 
 
728 aa  459  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3401  glycoside hydrolase family 57  37.42 
 
 
728 aa  457  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3255  hypothetical protein  34.12 
 
 
729 aa  458  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3177  glycoside hydrolase family protein  37.64 
 
 
734 aa  457  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.392002 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0027  glycoside hydrolase family protein  36.01 
 
 
731 aa  430  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0131  glycoside hydrolase family protein  31.32 
 
 
726 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0840945  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0408  glycoside hydrolase family 57  34.28 
 
 
729 aa  424  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0149  glycoside hydrolase family 57  31.45 
 
 
726 aa  422  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00221085  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1516  glycoside hydrolase family protein  36.96 
 
 
759 aa  420  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.757577  normal  0.533903 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0138  glycoside hydrolase family 57  31.58 
 
 
726 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.806114  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0135  glycoside hydrolase family protein  35.04 
 
 
722 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000920685  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0999  glycoside hydrolase family 57  37.9 
 
 
674 aa  413  1e-113  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2957  alpha-mannosidase  33.69 
 
 
695 aa  377  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1369  glycoside hydrolase family protein  34.9 
 
 
582 aa  343  9e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1616  glycoside hydrolase family protein  27.41 
 
 
1006 aa  336  1e-90  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0719  glycoside hydrolase family protein  34.95 
 
 
566 aa  330  9e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1432  glycoside hydrolase family protein  35.06 
 
 
570 aa  325  3e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2839  glycosyl hydrolase, family 57  33.69 
 
 
568 aa  322  1.9999999999999998e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2460  glycoside hydrolase family 57  33.69 
 
 
568 aa  322  1.9999999999999998e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2072  glycoside hydrolase, family 57  31.79 
 
 
577 aa  312  2e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0509  glycoside hydrolase family protein  33.22 
 
 
575 aa  306  1.0000000000000001e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0584  glycoside hydrolase family protein  32.75 
 
 
551 aa  301  5e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0777  glycoside hydrolase family 57  32.2 
 
 
566 aa  301  5e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0960  glycoside hydrolase family protein  31.27 
 
 
584 aa  299  2e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.285068 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2060  glycosy hydrolase family protein  31.87 
 
 
574 aa  297  6e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.725097  normal  0.224311 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0734  glycoside hydrolase family protein  35.79 
 
 
1022 aa  297  7e-79  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.983175  normal  0.257164 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1107  glycoside hydrolase family protein  30.43 
 
 
580 aa  296  2e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.185203  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1528  glycoside hydrolase family 57  30.09 
 
 
580 aa  286  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000278955 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1866  glycoside hydrolase family protein  32.1 
 
 
1000 aa  272  2e-71  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0985  glycoside hydrolase family protein  30.86 
 
 
994 aa  266  2e-69  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.369995  normal  0.376092 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0676  pullulanase  45.45 
 
 
267 aa  177  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1616  glycoside hydrolase family 13 protein  27.09 
 
 
663 aa  127  1e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2138  glycoside hydrolase family 57  27.93 
 
 
902 aa  111  5e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.205932  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4286  membrane-anchored protein  35.44 
 
 
267 aa  108  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4264  membrane-anchored protein  34.95 
 
 
267 aa  108  7e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4133  membrane-anchored protein  34.47 
 
 
267 aa  104  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16030  Membrane-anchored protein predicted to be involved in regulation of amylopullulanase  30.83 
 
 
313 aa  85.9  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2734  glycoside hydrolase family protein  23.35 
 
 
394 aa  84  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0210  glycoside hydrolase family protein  26.62 
 
 
609 aa  69.7  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.044129  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0932  glycoside hydrolase family protein  23.78 
 
 
1187 aa  68.2  0.0000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.26895  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0976  pullulanase  27.24 
 
 
379 aa  63.9  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.853358 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1460  Protein of unknown function DUF2223  25.52 
 
 
1255 aa  61.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2960  Membrane-anchored protein predicted to be involved in regulation of amylopullulanase  36.45 
 
 
228 aa  59.7  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1899  pullulanase  26.42 
 
 
390 aa  58.9  0.0000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2118  hypothetical protein  21.65 
 
 
407 aa  55.1  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2093  glycoside hydrolase family 57  22.82 
 
 
812 aa  54.3  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  25.23 
 
 
814 aa  53.1  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0915  pullulanase  24.39 
 
 
386 aa  52  0.00006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.521806  normal  0.517446 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3268  glycoside hydrolase family protein  19.4 
 
 
817 aa  50.8  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7156  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  24.35 
 
 
1132 aa  50.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0565327  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0327  Protein of unknown function DUF2223  29.46 
 
 
273 aa  50.1  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.590308 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2765  glycoside hydrolase family 57  23.41 
 
 
766 aa  48.1  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000129952  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1300  hypothetical protein  32.5 
 
 
249 aa  46.6  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0099  glycoside hydrolase family protein  25.22 
 
 
533 aa  46.6  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  25.6 
 
 
836 aa  46.2  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0038  glycoside hydrolase family 57  20.5 
 
 
807 aa  45.8  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0021  glycoside hydrolase family protein  20.9 
 
 
786 aa  45.8  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2359  hypothetical protein  18.72 
 
 
794 aa  45.1  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.780918  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1416  pullulanase  40.26 
 
 
386 aa  44.7  0.008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0895  glycoside hydrolase family 57  21.62 
 
 
520 aa  44.7  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.195973  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2350  glycoside hydrolase family protein  19.12 
 
 
807 aa  44.7  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>