More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1908 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1908  hypothetical protein  100 
 
 		 328 aa  661    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.865584  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1820  hypothetical protein  99.39 
 
 		 328 aa  657    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.939306 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3390  hypothetical protein  84.88 
 
 		 330 aa  509  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.254723  normal  0.0522505 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0715  hypothetical protein  83.78 
 
 		 327 aa  488  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2763  hypothetical protein  67 
 
 		 322 aa  431  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.246319  normal  0.0763345 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2042  hypothetical protein  70.63 
 
 		 323 aa  434  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5400  hypothetical protein  65.23 
 
 		 322 aa  414  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5882  extra-cytoplasmic solute receptor  65.2 
 
 		 328 aa  409  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3234  hypothetical protein  61.49 
 
 		 308 aa  357  1.9999999999999998e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.746028  normal  0.0817302 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4714  hypothetical protein  48.3 
 
 		 337 aa  294  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  47.57 
 
 		 325 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4520  hypothetical protein  47.4 
 
 		 326 aa  285  8e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  49.16 
 
 		 327 aa  279  6e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4457  extra-cytoplasmic solute receptor  45.97 
 
 		 327 aa  278  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00706561  normal  0.0529107 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  47.16 
 
 		 328 aa  275  8e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  44.88 
 
 		 330 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  46.32 
 
 		 326 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4707  hypothetical protein  74.47 
 
 		 216 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.836415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  44.97 
 
 		 330 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  46.6 
 
 		 339 aa  273  4.0000000000000004e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  46.82 
 
 		 330 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  46.82 
 
 		 330 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  46.78 
 
 		 349 aa  269  4e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  47.35 
 
 		 324 aa  268  5.9999999999999995e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  43.41 
 
 		 333 aa  268  7e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  43.73 
 
 		 327 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  45.06 
 
 		 328 aa  266  5e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4169  hypothetical protein  46.62 
 
 		 319 aa  263  3e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.719911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3789  extra-cytoplasmic solute receptor  43.3 
 
 		 326 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  45.82 
 
 		 328 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1198  hypothetical protein  44.76 
 
 		 322 aa  260  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.667586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  44.04 
 
 		 330 aa  259  5.0000000000000005e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  43.79 
 
 		 335 aa  258  9e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  45.82 
 
 		 328 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  43.71 
 
 		 325 aa  258  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  44.31 
 
 		 328 aa  257  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  45.15 
 
 		 331 aa  256  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  44.07 
 
 		 358 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1840  hypothetical protein  45.36 
 
 		 326 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0526902  normal  0.401977 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  45.3 
 
 		 325 aa  251  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  45.89 
 
 		 324 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4598  hypothetical protein  46.94 
 
 		 332 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  42.95 
 
 		 336 aa  250  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  45.3 
 
 		 327 aa  251  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  45.36 
 
 		 304 aa  250  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3672  hypothetical protein  41.93 
 
 		 327 aa  249  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.423242  normal  0.0951882 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  41.82 
 
 		 336 aa  249  5e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  45.36 
 
 		 325 aa  249  6e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3135  hypothetical protein  45.3 
 
 		 326 aa  248  8e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82433  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  42.37 
 
 		 331 aa  248  9e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0449  hypothetical protein  42.76 
 
 		 327 aa  248  1e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203149  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  42.72 
 
 		 325 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0180  hypothetical protein  44.11 
 
 		 327 aa  246  3e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3063 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0255  hypothetical protein  48.83 
 
 		 332 aa  245  8e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  44.48 
 
 		 324 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  43.59 
 
 		 337 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1797  hypothetical protein  47.02 
 
 		 334 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0211033  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  40.91 
 
 		 328 aa  245  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  43.29 
 
 		 338 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  44.17 
 
 		 330 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  42.81 
 
 		 348 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  44.38 
 
 		 334 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  42.64 
 
 		 341 aa  241  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  40.43 
 
 		 339 aa  241  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  40.88 
 
 		 318 aa  240  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  43.83 
 
 		 331 aa  240  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  42.81 
 
 		 326 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1672  hypothetical protein  41.36 
 
 		 326 aa  239  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669762  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  40.56 
 
 		 356 aa  239  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  40.82 
 
 		 328 aa  239  4e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  43.63 
 
 		 332 aa  239  5e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1997  hypothetical protein  47.02 
 
 		 334 aa  239  5e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.02937  normal  0.517294 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  39.39 
 
 		 327 aa  238  6.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  41.44 
 
 		 331 aa  238  6.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5356  extra-cytoplasmic solute receptor  42.06 
 
 		 321 aa  238  6.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.018742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  43.37 
 
 		 336 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  45.3 
 
 		 322 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4673  hypothetical protein  41.8 
 
 		 344 aa  237  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  42.15 
 
 		 328 aa  237  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  42.15 
 
 		 328 aa  237  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  41.21 
 
 		 314 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  38.86 
 
 		 344 aa  237  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1136  hypothetical protein  39.25 
 
 		 332 aa  236  4e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.573559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  40.43 
 
 		 335 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  43.09 
 
 		 335 aa  236  5.0000000000000005e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  41.61 
 
 		 330 aa  236  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  42.55 
 
 		 332 aa  236  6e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  40.43 
 
 		 330 aa  236  6e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  41.41 
 
 		 325 aa  235  7e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  40.07 
 
 		 337 aa  235  7e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  42.09 
 
 		 327 aa  235  8e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  40.2 
 
 		 337 aa  234  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4242  extra-cytoplasmic solute receptor  41.23 
 
 		 330 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.289881 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  41.27 
 
 		 318 aa  234  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3122  hypothetical protein  41.02 
 
 		 343 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00641753  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2774  hypothetical protein  38.91 
 
 		 333 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555634  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5108  hypothetical protein  40.07 
 
 		 324 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031393  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5149  extra-cytoplasmic solute receptor  39.62 
 
 		 328 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79218  normal  0.807931 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  37.58 
 
 		 325 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3406  hypothetical protein  41.37 
 
 		 322 aa  233  4.0000000000000004e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.88077 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>