More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2128 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  100 
 
 		 639 aa  1296    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1884  DNA mismatch repair protein  43.05 
 
 		 640 aa  509  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  43.44 
 
 		 620 aa  486  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1203  DNA mismatch repair protein  41.22 
 
 		 619 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288753  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0554  DNA mismatch repair protein MutL  41.03 
 
 		 565 aa  471  1.0000000000000001e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3539  DNA mismatch repair protein  39.05 
 
 		 644 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3802  DNA mismatch repair protein  38.72 
 
 		 647 aa  458  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.618994  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1432  DNA mismatch repair protein  39.05 
 
 		 647 aa  456  1e-127  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.980701 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2420  DNA mismatch repair protein  38.05 
 
 		 649 aa  457  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323655  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3617  DNA mismatch repair protein  38.39 
 
 		 626 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.552847  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3509  DNA mismatch repair protein  38.81 
 
 		 647 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3904  DNA mismatch repair protein  38.39 
 
 		 626 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595251  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3780  DNA mismatch repair protein  38.72 
 
 		 647 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0217989 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3867  DNA mismatch repair protein  38.72 
 
 		 647 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3815  DNA mismatch repair protein  38.23 
 
 		 647 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3527  DNA mismatch repair protein  38.66 
 
 		 647 aa  452  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  37.46 
 
 		 644 aa  436  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2096  DNA mismatch repair protein  40.09 
 
 		 630 aa  434  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1696  DNA mismatch repair protein MutL  36.09 
 
 		 665 aa  426  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930861  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  38.03 
 
 		 603 aa  428  1e-118  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1494  DNA mismatch repair protein MutL  37.87 
 
 		 692 aa  424  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0526  DNA mismatch repair protein  37.12 
 
 		 668 aa  424  1e-117  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2098  DNA mismatch repair protein  37.17 
 
 		 659 aa  419  1e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2380  DNA mismatch repair protein MutL  37.12 
 
 		 695 aa  418  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1951  DNA mismatch repair protein  38.34 
 
 		 585 aa  414  1e-114  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448925  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1487  DNA mismatch repair protein MutL  38.31 
 
 		 622 aa  414  1e-114  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.101291  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2517  DNA mismatch repair protein  37.29 
 
 		 656 aa  414  1e-114  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  37.17 
 
 		 647 aa  409  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0072  DNA mismatch repair protein  35.44 
 
 		 647 aa  405  1.0000000000000001e-112  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0864  DNA mismatch repair protein  34.7 
 
 		 645 aa  403  1e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23826  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1497  DNA mismatch repair protein MutL  34.99 
 
 		 680 aa  405  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.997649  hitchhiker  0.00000153643 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  37.31 
 
 		 628 aa  404  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1359  DNA mismatch repair protein  36.31 
 
 		 674 aa  404  1e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.52416  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1172  DNA mismatch repair protein  36.89 
 
 		 674 aa  403  1e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1612  DNA mismatch repair protein  36.88 
 
 		 614 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.235254  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1217  DNA mismatch repair protein  38.89 
 
 		 612 aa  401  9.999999999999999e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469734  normal  0.0661873 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  36.29 
 
 		 606 aa  395  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  37.48 
 
 		 612 aa  396  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  35.7 
 
 		 631 aa  399  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1382  DNA mismatch repair protein  34.98 
 
 		 669 aa  397  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0932721  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1575  DNA mismatch repair protein MutL  36.42 
 
 		 648 aa  398  1e-109  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  37.9 
 
 		 647 aa  392  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3282  DNA mismatch repair protein  36.79 
 
 		 650 aa  394  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1924  DNA mismatch repair protein MutL  38.16 
 
 		 560 aa  389  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  37.72 
 
 		 622 aa  388  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  36.6 
 
 		 605 aa  387  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  36.38 
 
 		 602 aa  381  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0172  DNA mismatch repair protein MutL  35.29 
 
 		 624 aa  380  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  36 
 
 		 632 aa  381  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  35.48 
 
 		 605 aa  378  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  35.02 
 
 		 641 aa  373  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1981  DNA mismatch repair protein  35.09 
 
 		 626 aa  369  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2701  DNA mismatch repair protein MutL  33.75 
 
 		 626 aa  368  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00383046  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0014  DNA mismatch repair protein  34.26 
 
 		 610 aa  365  1e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0145  DNA mismatch repair protein  33.44 
 
 		 644 aa  365  2e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  36.11 
 
 		 600 aa  363  6e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4044  DNA mismatch repair protein MutL  35.91 
 
 		 628 aa  363  6e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816003  normal  0.310643 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1168  DNA mismatch repair protein  36.2 
 
 		 588 aa  362  1e-98  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.985109  normal  0.444607 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  33.9 
 
 		 608 aa  362  2e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1174  hypothetical protein  35.03 
 
 		 628 aa  360  5e-98  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0643431 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  36.17 
 
 		 608 aa  359  9e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  36.12 
 
 		 607 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  35.81 
 
 		 607 aa  358  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  35.49 
 
 		 611 aa  356  5.999999999999999e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  35.69 
 
 		 600 aa  355  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0302  DNA mismatch repair protein MutL  31.91 
 
 		 624 aa  354  2e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000565974  hitchhiker  0.00985332 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  37.4 
 
 		 617 aa  353  4e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  34.98 
 
 		 633 aa  353  5e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0481  DNA mismatch repair protein MutL  33.95 
 
 		 623 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.324517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0821  DNA mismatch repair protein MutL  33.89 
 
 		 630 aa  353  5.9999999999999994e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000117941  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  34.96 
 
 		 632 aa  351  2e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  34.78 
 
 		 605 aa  351  2e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  34.51 
 
 		 632 aa  349  8e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  34.62 
 
 		 633 aa  349  1e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0267  DNA mismatch repair protein MutL  32.3 
 
 		 622 aa  348  1e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000997696 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3225  DNA mismatch repair protein MutL  34.37 
 
 		 599 aa  349  1e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  34.3 
 
 		 630 aa  348  2e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  34.97 
 
 		 641 aa  347  5e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  34.86 
 
 		 629 aa  347  5e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2328  DNA mismatch repair protein MutL  32.81 
 
 		 629 aa  346  1e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  34.84 
 
 		 623 aa  345  2e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  35.21 
 
 		 643 aa  345  2e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  34.84 
 
 		 623 aa  345  2e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3811  DNA mismatch repair protein MutL  31.91 
 
 		 629 aa  344  2.9999999999999997e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07070  putative DNA mismatch repair protein  34.37 
 
 		 617 aa  343  5.999999999999999e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.748012  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  34.29 
 
 		 635 aa  342  1e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  34.31 
 
 		 615 aa  341  2e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  34.1 
 
 		 645 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4062  DNA mismatch repair protein  35.39 
 
 		 643 aa  340  4e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  34.98 
 
 		 626 aa  339  7e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  34.05 
 
 		 648 aa  337  5e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2732  DNA mismatch repair protein MutL  47.8 
 
 		 730 aa  336  9e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0867295  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  34.47 
 
 		 616 aa  335  1e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  34.8 
 
 		 611 aa  334  2e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  35.21 
 
 		 612 aa  332  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  34.12 
 
 		 575 aa  332  1e-89  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  33.96 
 
 		 574 aa  331  2e-89  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0413  DNA mismatch repair protein  34.86 
 
 		 630 aa  331  2e-89  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  35.27 
 
 		 632 aa  329  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  35.62 
 
 		 616 aa  329  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>