More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0851 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1865  transketolase  66.51 
 
 		 657 aa  895    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0851  transketolase  100 
 
 		 660 aa  1362    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0149061  normal  0.206532 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  45.65 
 
 		 666 aa  567  1e-160  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  45.65 
 
 		 666 aa  566  1e-160  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3742  transketolase  45.65 
 
 		 666 aa  566  1e-160  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000620958  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1241  transketolase  46.2 
 
 		 668 aa  567  1e-160  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000546415  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1524  transketolase  45.65 
 
 		 680 aa  566  1e-160  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000346626  normal  0.0243149 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  45.65 
 
 		 666 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  45.5 
 
 		 666 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3699  transketolase  45.35 
 
 		 680 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000172901 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2808  transketolase  46.1 
 
 		 665 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000368556  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  45.65 
 
 		 666 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2122  transketolase  46.43 
 
 		 668 aa  559  1e-158  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2336  transketolase  44.59 
 
 		 666 aa  560  1e-158  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000657537  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1042  transketolase  47.81 
 
 		 668 aa  561  1e-158  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3790  transketolase  45.35 
 
 		 666 aa  557  1e-157  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258353  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03290  transketolase  45.44 
 
 		 661 aa  556  1e-157  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3369  transketolase  45.2 
 
 		 666 aa  556  1e-157  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00015872  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14410  transketolase  45.72 
 
 		 660 aa  556  1e-157  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2390  transketolase  44.48 
 
 		 666 aa  553  1e-156  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0781466 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2853  transketolase  45.92 
 
 		 665 aa  552  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3040  transketolase  45.55 
 
 		 670 aa  549  1e-155  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0242601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3046  transketolase  45.32 
 
 		 670 aa  549  1e-155  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.590988  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0565  transketolase  44.65 
 
 		 680 aa  551  1e-155  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3252  transketolase  45.92 
 
 		 663 aa  551  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0026  transketolase  44.49 
 
 		 694 aa  549  1e-155  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0910343  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1828  transketolase  47.93 
 
 		 653 aa  551  1e-155  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.208586  normal  0.379943 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0409  transketolase  45.05 
 
 		 662 aa  549  1e-155  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.148616  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0384  transketolase  44.68 
 
 		 663 aa  550  1e-155  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0554  transketolase  43.82 
 
 		 665 aa  548  1e-154  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0487  transketolase  45.94 
 
 		 667 aa  546  1e-154  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2893  transketolase  43.41 
 
 		 665 aa  542  1e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0551  transketolase  43.41 
 
 		 662 aa  539  9.999999999999999e-153  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0385  transketolase  45.48 
 
 		 665 aa  535  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0458  transketolase  45.65 
 
 		 666 aa  538  1e-151  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4499  transketolase  44.85 
 
 		 688 aa  536  1e-151  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0520  transketolase  43.5 
 
 		 663 aa  536  1e-151  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2903  transketolase  46.95 
 
 		 711 aa  536  1e-151  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000161618 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0472  transketolase  47.37 
 
 		 682 aa  537  1e-151  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1904  transketolase  43.74 
 
 		 668 aa  538  1e-151  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2261  transketolase  46.86 
 
 		 666 aa  538  1e-151  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2841  transketolase  46.94 
 
 		 665 aa  537  1e-151  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1379  transketolase  46.64 
 
 		 711 aa  535  1e-150  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356531  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1430  transketolase  44.01 
 
 		 662 aa  533  1e-150  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0752  transketolase  43.1 
 
 		 664 aa  535  1e-150  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394111  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0552  transketolase  44.48 
 
 		 664 aa  533  1e-150  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06257  transketolase  44.96 
 
 		 668 aa  533  1e-150  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0651  transketolase  44.89 
 
 		 723 aa  533  1e-150  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1403  transketolase  44.01 
 
 		 662 aa  533  1e-150  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.194488  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0616  transketolase  44.49 
 
 		 666 aa  532  1e-150  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  44.74 
 
 		 665 aa  534  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4965  transketolase  44.74 
 
 		 665 aa  529  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0912  transketolase  44.08 
 
 		 662 aa  531  1e-149  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.240506  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4614  transketolase  46.22 
 
 		 674 aa  529  1e-149  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3872  transketolase  43.64 
 
 		 662 aa  531  1e-149  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0946  transketolase  44.63 
 
 		 665 aa  529  1e-149  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0220  transketolase  44.94 
 
 		 681 aa  529  1e-149  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103383 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4792  transketolase  45.18 
 
 		 665 aa  531  1e-149  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646987 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0472  transketolase  45.08 
 
 		 667 aa  531  1e-149  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0841196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3415  transketolase  42.58 
 
 		 662 aa  531  1e-149  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2594  transketolase  45.48 
 
 		 681 aa  529  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1538  transketolase  43.77 
 
 		 666 aa  531  1e-149  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0168278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1734  transketolase  46.5 
 
 		 658 aa  530  1e-149  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.901909  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4838  transketolase  44.89 
 
 		 665 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02356  transketolase 2, thiamin-binding  43.81 
 
 		 667 aa  526  1e-148  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5014  transketolase  44.74 
 
 		 665 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16096 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1205  transketolase  43.81 
 
 		 667 aa  526  1e-148  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0841  transketolase  45.05 
 
 		 679 aa  526  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000495  transketolase  44.38 
 
 		 663 aa  526  1e-148  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2733  transketolase  44.24 
 
 		 666 aa  528  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2611  transketolase  43.81 
 
 		 667 aa  526  1e-148  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0339  transketolase  43.81 
 
 		 667 aa  525  1e-148  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1883  transketolase  46.03 
 
 		 672 aa  528  1e-148  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.768149  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3263  hypothetical protein  46.87 
 
 		 663 aa  527  1e-148  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.415108 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5267  transketolase  45.5 
 
 		 681 aa  527  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2840  transketolase  44.24 
 
 		 666 aa  528  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2023  transketolase  47.24 
 
 		 655 aa  526  1e-148  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.98963  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02318  hypothetical protein  43.81 
 
 		 667 aa  526  1e-148  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0259  transketolase  45.8 
 
 		 680 aa  526  1e-148  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.336202 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1980  transketolase  45.47 
 
 		 701 aa  528  1e-148  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.543283  normal  0.89929 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2707  transketolase  44.24 
 
 		 666 aa  527  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2667  transketolase  44.11 
 
 		 666 aa  528  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.562864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1212  transketolase  43.81 
 
 		 667 aa  526  1e-148  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2618  transketolase  44.24 
 
 		 666 aa  528  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  43.83 
 
 		 666 aa  523  1e-147  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  43.83 
 
 		 666 aa  523  1e-147  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3317  transketolase  45.28 
 
 		 675 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2469  transketolase  45.28 
 
 		 690 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0139  transketolase  44.19 
 
 		 668 aa  525  1e-147  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03567  transketolase  44.1 
 
 		 675 aa  525  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1249  transketolase  45.28 
 
 		 690 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.47821  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2743  transketolase  43.66 
 
 		 667 aa  525  1e-147  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03160  transketolase 1 (TK 1)  43.48 
 
 		 663 aa  525  1e-147  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0227  transketolase  43.91 
 
 		 657 aa  523  1e-147  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05570  transketolase  44.63 
 
 		 665 aa  525  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0874  transketolase  41.95 
 
 		 663 aa  523  1e-147  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000542021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3468  transketolase  45.28 
 
 		 690 aa  524  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0876  transketolase  42.47 
 
 		 663 aa  524  1e-147  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3250  transketolase  43.37 
 
 		 664 aa  523  1e-147  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.456833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0538  transketolase  45.31 
 
 		 690 aa  525  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.242033  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>