More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0704 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0704  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  100 
 
 
797 aa  1615    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1713  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  30.67 
 
 
867 aa  255  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0623992  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  28.77 
 
 
873 aa  246  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1622  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  25.5 
 
 
891 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1117  phosphoenolpyruvate synthase  25.59 
 
 
891 aa  213  7.999999999999999e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5062  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  28.44 
 
 
840 aa  205  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2728  phosphoenolpyruvate synthase  25.9 
 
 
874 aa  196  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.336193 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1951  phosphoenolpyruvate synthase  27.24 
 
 
871 aa  192  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0623  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  27.13 
 
 
971 aa  177  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252366  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0607  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  26.97 
 
 
971 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2649  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  25.43 
 
 
884 aa  154  5e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5551  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  38.43 
 
 
826 aa  151  6e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0952263  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0644  phosphoenolpyruvate synthase  24.29 
 
 
870 aa  149  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0824821 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3844  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  25.85 
 
 
889 aa  140  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193358  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0493  pyruvate, water dikinase  36.43 
 
 
791 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1894  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  32.88 
 
 
971 aa  133  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0384  phosphoenolpyruvate synthase  32 
 
 
907 aa  132  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  29.3 
 
 
769 aa  128  3e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3580  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  31.74 
 
 
887 aa  127  8.000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0605  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  35.34 
 
 
950 aa  126  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206316 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  29.49 
 
 
758 aa  125  2e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  33.23 
 
 
760 aa  126  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  29.17 
 
 
758 aa  125  3e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  28.85 
 
 
758 aa  125  4e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1949  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  32.07 
 
 
868 aa  124  5e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1069  Pyruvate, water dikinase  39.3 
 
 
835 aa  124  7e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.486381  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0508  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  31.97 
 
 
903 aa  123  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.93502  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0620  phosphoenolpyruvate synthase  34.52 
 
 
842 aa  121  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  30 
 
 
761 aa  120  9e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  27.51 
 
 
781 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0474  pyruvate, water dikinase  35.92 
 
 
906 aa  119  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.247096  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  38.54 
 
 
821 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  28.76 
 
 
757 aa  119  3e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  30.28 
 
 
809 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1818  pyruvate, water dikinase  31.01 
 
 
788 aa  117  7.999999999999999e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0545713 
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  27.16 
 
 
758 aa  117  8.999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2899  phosphoenolpyruvate synthase  28.57 
 
 
868 aa  117  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.407068  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  27.56 
 
 
782 aa  117  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  29.57 
 
 
887 aa  117  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3116  phosphoenolpyruvate synthase  28.57 
 
 
868 aa  117  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  30.55 
 
 
762 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1157  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  30.91 
 
 
869 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4939  phosphoenolpyruvate synthase  28.95 
 
 
865 aa  116  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0930681 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3140  phosphoenolpyruvate synthase  28.18 
 
 
868 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103594  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  28.06 
 
 
758 aa  115  3e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  28.76 
 
 
809 aa  115  3e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  30.72 
 
 
810 aa  114  5e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3615  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  33.33 
 
 
902 aa  114  6e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  29.91 
 
 
799 aa  114  6e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  28.16 
 
 
758 aa  114  8.000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3137  phosphoenolpyruvate synthase  27.89 
 
 
868 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2825  phosphoenolpyruvate synthase  27.49 
 
 
869 aa  114  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3264  phosphoenolpyruvate synthase  26.5 
 
 
890 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000174113  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3119  phosphoenolpyruvate synthase  27.55 
 
 
869 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  29.45 
 
 
788 aa  114  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  27.71 
 
 
758 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0349  phosphoenolpyruvate synthase, putative  28.06 
 
 
825 aa  112  2.0000000000000002e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  29.6 
 
 
780 aa  113  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2868  phosphoenolpyruvate synthase  28.23 
 
 
868 aa  112  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.424665  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2043  PEP-utilising protein mobile region  34.67 
 
 
725 aa  112  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.80006  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2412  phosphoenolpyruvate-utilizing enzyme mobile domain protein  34.67 
 
 
708 aa  112  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3294  phosphoenolpyruvate synthase  38.02 
 
 
837 aa  112  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4726  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  32.98 
 
 
959 aa  111  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0267018  normal  0.466648 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4990  phosphoenolpyruvate synthase  35.11 
 
 
765 aa  111  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.82613  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  28.16 
 
 
764 aa  111  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  29.34 
 
 
785 aa  111  7.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2130  phosphoenolpyruvate synthase  27.18 
 
 
868 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1185  pyruvate, water dikinase  33.59 
 
 
275 aa  110  8.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3057  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  28.28 
 
 
811 aa  110  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0118124  decreased coverage  0.000000211627 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3108  phosphoenolpyruvate synthase  26.86 
 
 
868 aa  110  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.721717  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  28.24 
 
 
762 aa  110  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2960  phosphoenolpyruvate synthase  32.02 
 
 
866 aa  109  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000180391 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  30.12 
 
 
785 aa  109  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  26.76 
 
 
794 aa  108  3e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  27.39 
 
 
779 aa  108  3e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  27.42 
 
 
824 aa  108  4e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  31.9 
 
 
812 aa  107  6e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2894  phosphoenolpyruvate synthase  25.84 
 
 
868 aa  107  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.497322  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  31.65 
 
 
975 aa  107  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4143  phosphoenolpyruvate synthase  37 
 
 
885 aa  107  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.917793  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2857  phosphoenolpyruvate synthase  33.58 
 
 
892 aa  106  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3009  phosphoenolpyruvate synthase  34.62 
 
 
885 aa  106  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.963609  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4547  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  32.47 
 
 
386 aa  105  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.529657  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3593  PEP-utilising enzyme, mobile region  30.94 
 
 
1097 aa  106  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  33.62 
 
 
754 aa  106  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  30.33 
 
 
761 aa  105  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2632  pyruvate, water dikinase  31.21 
 
 
886 aa  106  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514233  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2689  phosphoenolpyruvate synthase  29.5 
 
 
871 aa  105  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.769187 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2573  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  34.91 
 
 
835 aa  104  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0510  pyruvate, water dikinase  28.31 
 
 
334 aa  103  1e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.749276  normal  0.163777 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0133  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  29.82 
 
 
956 aa  102  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.967311  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4240  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  29.23 
 
 
302 aa  102  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2435  phosphoenolpyruvate synthase  31.8 
 
 
798 aa  102  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0604  pyruvate,water dikinase  34.15 
 
 
828 aa  102  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.722423  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1988  Pyruvate, water dikinase  31.94 
 
 
817 aa  102  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  29.18 
 
 
810 aa  100  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3610  PEP-utilising enzyme, mobile region  32.79 
 
 
1240 aa  99.4  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66232  normal  0.099174 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3011  phosphoenolpyruvate synthase  32.48 
 
 
726 aa  98.6  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000544209  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0441  PEP-utilising enzyme, mobile region  31.09 
 
 
963 aa  98.2  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.299176 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2428  phosphoenolpyruvate synthase  32.61 
 
 
786 aa  98.2  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>