232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2956 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2956  carbon starvation protein CstA  100 
 
 		 479 aa  952    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.029089  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0741  carbon starvation protein CstA  57.14 
 
 		 483 aa  540  9.999999999999999e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.230376  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0725  carbon starvation protein CstA  57.58 
 
 		 483 aa  539  9.999999999999999e-153  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0012  carbon starvation protein CstA, putative  58.28 
 
 		 484 aa  523  1e-147  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2399  carbon starvation protein CstA  60.74 
 
 		 486 aa  519  1e-146  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2433  carbon starvation protein CstA  55.32 
 
 		 482 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0181801  hitchhiker  0.00240517 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2503  carbon starvation protein CstA  55.32 
 
 		 482 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.068155  normal  0.0168974 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1478  carbon starvation protein CstA  55.72 
 
 		 479 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0606674  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2595  carbon starvation protein CstA  58.22 
 
 		 484 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.147178  hitchhiker  0.00215078 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1547  carbon starvation protein CstA  54.94 
 
 		 482 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.115845  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1764  carbon starvation protein CstA  58.22 
 
 		 478 aa  514  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.468167  hitchhiker  0.00720784 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2330  carbon starvation protein CstA  54.62 
 
 		 478 aa  510  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0840034  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1687  carbon starvation protein A  56.08 
 
 		 480 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1822  carbon starvation protein A  56.08 
 
 		 480 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1867  putative carbon starvation protein A  56.08 
 
 		 480 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0679400000000002e-34 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1280  carbon starvation protein  58.96 
 
 		 477 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.513544  hitchhiker  0.00159846 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1657  carbon starvation protein CstA  54.62 
 
 		 486 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0002875  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2686  carbon starvation protein CstA  54.62 
 
 		 487 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0888448  hitchhiker  0.000480532 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1694  carbon starvation protein CstA  54.62 
 
 		 487 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000103268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004412  carbon starvation protein A  52.86 
 
 		 494 aa  502  1e-141  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1667  carbon starvation protein A  56.5 
 
 		 480 aa  500  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.267258  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3340  carbon starvation protein CstA  52.21 
 
 		 499 aa  501  1e-140  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.724244 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1944  putative carbon starvation protein A  56.5 
 
 		 480 aa  498  1e-140  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00862817  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2884  carbon starvation protein CstA  56.85 
 
 		 478 aa  500  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00820008  hitchhiker  0.00000000141998 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1325  carbon starvation protein CstA  54.57 
 
 		 472 aa  498  1e-139  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0227  carbon starvation protein A, putative  57.59 
 
 		 489 aa  495  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00986  hypothetical protein  52.65 
 
 		 494 aa  495  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2435  carbon starvation protein CstA  55.86 
 
 		 486 aa  495  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.338097  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2354  carbon starvation protein CstA  56.12 
 
 		 473 aa  498  1e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.322622  normal  0.0377797 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4235  carbon starvation protein CstA  54.73 
 
 		 480 aa  492  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2353  carbon starvation protein CstA  56.34 
 
 		 470 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4761  normal  0.0387762 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0348  carbon starvation protein A  52.67 
 
 		 527 aa  483  1e-135  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000180552  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0218  putative carbon starvation protein A  50.82 
 
 		 494 aa  484  1e-135  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.737228  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1229  carbon starvation protein CstA  56.4 
 
 		 472 aa  480  1e-134  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0438651 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1015  carbon starvation protein CstA, putative  49.58 
 
 		 494 aa  465  9.999999999999999e-131  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00237627  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1326  carbon starvation protein CstA  56.39 
 
 		 472 aa  467  9.999999999999999e-131  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1226  carbon starvation protein CstA  54.02 
 
 		 467 aa  443  1e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.200815 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2823.1  carbon starvation protein A  57.43 
 
 		 392 aa  445  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3047  carbon starvation protein CstA  46.2 
 
 		 491 aa  412  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000178589  normal  0.0660711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0925  carbon starvation protein CstA  46.2 
 
 		 491 aa  412  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0439371  normal  0.811666 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0888  carbon starvation protein CstA  46.2 
 
 		 491 aa  412  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228832  normal  0.272877 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3490  carbon starvation protein CstA  46.2 
 
 		 490 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.26898  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3415  carbon starvation protein CstA  46.2 
 
 		 490 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0874  carbon starvation protein CstA  46.2 
 
 		 490 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.390469  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3613  carbon starvation protein CstA  46.2 
 
 		 490 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3022  carbon starvation protein CstA  46.2 
 
 		 490 aa  410  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.939377  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0951  carbon starvation protein CstA  47.1 
 
 		 490 aa  405  1.0000000000000001e-112  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0924305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1109  cold-shock regulated carbon starvation protein A  45.19 
 
 		 487 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0159914  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0772  carbon starvation protein CstA  46.2 
 
 		 489 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0907  carbon starvation protein CstA  45.78 
 
 		 490 aa  402  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.695183  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0605  carbon starvation protein CstA  43.42 
 
 		 484 aa  348  1e-94  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000190307  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1546  carbon starvation protein CstA  28.23 
 
 		 537 aa  149  8e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000304878 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0113  carbon starvation protein CstA  28.12 
 
 		 564 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.885531  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10430  carbon starvation protein CstA  29.48 
 
 		 554 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000165578  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1295  carbon starvation protein CstA  26.89 
 
 		 559 aa  129  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0909  carbon starvation protein CstA  31.25 
 
 		 546 aa  127  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000299613  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1123  carbon starvation protein A  27.1 
 
 		 559 aa  126  8.000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.15869  normal  0.492518 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1208  carbon starvation protein CstA  26.16 
 
 		 555 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1445  carbon starvation-induced protein  27.38 
 
 		 537 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.126725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03070  carbon starvation protein, predicted membrane protein  25.1 
 
 		 573 aa  109  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03566  Carbon starvation regulatory protein  25 
 
 		 561 aa  108  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1348  carbon starvation protein A  25.73 
 
 		 701 aa  105  2e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.401846  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3417  carbon starvation protein CstA  25.86 
 
 		 690 aa  104  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3982  carbon starvation protein CstA  30.5 
 
 		 688 aa  102  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2942  carbon starvation protein CstA  30.05 
 
 		 696 aa  100  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.627155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3574  carbon starvation protein CstA  29.79 
 
 		 691 aa  100  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0613  carbon starvation protein CstA  23.5 
 
 		 539 aa  100  7e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000204279  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0022  carbon starvation A transmembrane protein  24.51 
 
 		 686 aa  99.4  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0699392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1551  carbon starvation protein CstA  26.7 
 
 		 696 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3644  carbon starvation protein CstA  26.8 
 
 		 603 aa  97.4  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3948  carbon starvation protein CstA  26.8 
 
 		 603 aa  97.4  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.813593  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0268  carbon starvation protein CstA  26.8 
 
 		 603 aa  97.1  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07540  carbon starvation protein, predicted membrane protein  39.04 
 
 		 599 aa  95.9  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.620318  normal  0.553558 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0575  carbon starvation protein A  25.93 
 
 		 642 aa  94.4  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2948  carbon starvation protein CstA  25.14 
 
 		 642 aa  94  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0669407 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08610  carbon starvation protein, predicted membrane protein  29.2 
 
 		 753 aa  93.2  8e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1963  carbon starvation protein CstA  26.63 
 
 		 606 aa  92.8  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.929114 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4884  carbon starvation protein CstA  24.59 
 
 		 692 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393748  normal  0.287345 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6471  carbon starvation protein CstA  27.41 
 
 		 692 aa  92  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.333661 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5434  carbon starvation protein CstA  24.59 
 
 		 692 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4710  carbon starvation protein CstA  24.32 
 
 		 692 aa  91.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5298  carbon starvation protein CstA  24.32 
 
 		 692 aa  91.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.884841  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5561  carbon starvation protein CstA  24.32 
 
 		 692 aa  91.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.528361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4167  carbon starvation protein CstA  28.88 
 
 		 742 aa  90.9  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.586353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7759  carbon starvation protein CstA  24.29 
 
 		 692 aa  90.9  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0097  carbon starvation protein CstA  24.95 
 
 		 692 aa  90.5  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.457953 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3619  carbon starvation protein CstA  28.07 
 
 		 681 aa  89.7  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186111  normal  0.595383 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1572  carbon starvation protein CstA  27.46 
 
 		 723 aa  89.4  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.487074  normal  0.864906 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1294  carbon starvation protein A  23.96 
 
 		 692 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.712641  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3065  carbon starvation protein CstA  23.96 
 
 		 692 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2939  carbon starvation protein CstA  23.96 
 
 		 692 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4641  carbon starvation protein CstA  25.66 
 
 		 688 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.91453 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2942  carbon starvation protein CstA  25.66 
 
 		 687 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.727344  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3001  carbon starvation protein CstA  29.61 
 
 		 603 aa  89  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2252  carbon starvation protein A  23.96 
 
 		 692 aa  89  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0681  carbon starvation protein CstA  28.02 
 
 		 766 aa  88.6  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4503  carbon starvation protein CstA  25.66 
 
 		 688 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.818376  normal  0.614972 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2095  carbon starvation protein CstA  25.49 
 
 		 604 aa  88.2  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.497716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2696  carbon starvation protein CstA  25.28 
 
 		 615 aa  88.2  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1227  carbon starvation protein CstA  26.11 
 
 		 603 aa  87.8  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.454995 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>