More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1042 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1042  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  238  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3248  hypothetical protein  51.85 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1104  prepilin-type cleavage/methylation  44.93 
 
 		 176 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.945124  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  40 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  45.76 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17770  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein  54.39 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.775526 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3388  methylation  55.32 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0552  MSHA pilin protein MshA  36.36 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00386307  normal  0.526597 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0567  methylation site containing protein  33.33 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468703  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  52.83 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  46.43 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  38.1 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3340  methylation  36.08 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000827612  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  43.18 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  44.12 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_002936  DET1360  general secretion family protein  40.51 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000388019  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1036  hypothetical protein  44.64 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  38.1 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3762  methylation site containing protein  42.86 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000262752  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0566  MSHA pilin protein MshB  41.67 
 
 		 205 aa  54.3  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.571105  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  36.14 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  50 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2153  competence protein  30.43 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0605499  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3074  pilin, putative  34.23 
 
 		 178 aa  54.3  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  44.26 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4536  fimbrial protein pilin  68.75 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0634  fimbrial protein pilin  68.75 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0675  fimbrial protein pilin  68.75 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357739 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0680  fimbrial protein pilin  57.14 
 
 		 136 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0314  general secretion pathway protein  55.81 
 
 		 147 aa  53.5  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0395  methylation site containing protein  38.46 
 
 		 211 aa  52.8  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0635812  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4106  MSHA pilin protein MshB  40 
 
 		 205 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4782  Tfp pilus assembly protein  59.46 
 
 		 179 aa  53.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1088  hypothetical protein  37.35 
 
 		 338 aa  53.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0514  MSHA pilin protein MshB  40 
 
 		 205 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00061527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0250  fimbrial subunit  67.65 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0333044  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4411  methylation site containing protein  38.71 
 
 		 219 aa  52.8  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000316241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.58 
 
 		 168 aa  52.8  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0472  methylation site containing protein  40 
 
 		 205 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000795599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0511  MSHA pilin protein MshB  40 
 
 		 205 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000086206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0534  hypothetical protein  38.36 
 
 		 140 aa  52.8  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002546  type IV pilin PilA  39.02 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.790868  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3657  methylation site containing protein  40 
 
 		 205 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000205665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3829  MSHA pilin protein MshB  40 
 
 		 205 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000175672  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0490  MSHA pilin protein MshB  40 
 
 		 205 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000965015  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0477  prepilin-type cleavage/methylation  58.97 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0414  methylation site containing protein  60.53 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  74.19 
 
 		 167 aa  52  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3326  pilin, putative  44.64 
 
 		 187 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0266287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  65.71 
 
 		 169 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1956  hypothetical protein  32.5 
 
 		 189 aa  52.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0620526  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0550  methylation site containing protein  39.34 
 
 		 218 aa  52.4  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000424061  normal  0.764365 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3745  methylation site containing protein  42.86 
 
 		 201 aa  52.8  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0403042  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  36.14 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3946  fimbrial protein pilin  63.41 
 
 		 169 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129399 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  59.46 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0464  hypothetical protein  39.66 
 
 		 191 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1141  MSHA pilin protein MshB  41.79 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3479  methylation site containing protein  31.62 
 
 		 169 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000294883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0728  hypothetical protein  51.85 
 
 		 174 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0435  methylation site containing protein  41.38 
 
 		 201 aa  51.6  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0364  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  42.86 
 
 		 163 aa  51.6  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0735599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0126  Tfp pilus assembly protein PilE-like  60.53 
 
 		 151 aa  51.6  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0148502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0421  methylation site containing protein  60.53 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000175547  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3656  methylation site containing protein  31.62 
 
 		 169 aa  52  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00406084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3698  methylation site containing protein  41.38 
 
 		 192 aa  52  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.452925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  42.86 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  59.52 
 
 		 162 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  45.28 
 
 		 158 aa  51.2  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  62.16 
 
 		 168 aa  51.6  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4159  hypothetical protein  39.66 
 
 		 193 aa  51.2  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2151  membrane protein  37.93 
 
 		 186 aa  51.2  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3480  methylation site containing protein  38.33 
 
 		 205 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000493749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2096  pilin domain protein  70 
 
 		 70 aa  51.2  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000511675  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0530  hypothetical protein  39.66 
 
 		 192 aa  51.6  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2680  fimbrial protein pilin  58.54 
 
 		 169 aa  51.2  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0726827  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  62.86 
 
 		 168 aa  51.6  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3945  fimbrial protein pilin  60.98 
 
 		 166 aa  51.6  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  hitchhiker  0.00130999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0964  pilin, putative  44.44 
 
 		 187 aa  50.8  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0885526  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0448  hypothetical protein  39.66 
 
 		 191 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1066  pilin, putative  44.44 
 
 		 187 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2452  methylation site containing protein  38.89 
 
 		 197 aa  50.8  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00816638  normal  0.444869 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0852  methylation site containing protein  42.31 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.992733 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  45.1 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1033  pilin, putative  44.44 
 
 		 187 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0234716  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0557  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  58.54 
 
 		 173 aa  50.8  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00348  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  35.29 
 
 		 128 aa  50.8  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  40.91 
 
 		 153 aa  50.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  51.06 
 
 		 111 aa  50.8  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  51.02 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0478  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  62.16 
 
 		 169 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.322644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  41.07 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0417  pilin, putative  47.92 
 
 		 138 aa  50.4  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0551  MSHA pilin protein MshA  42.37 
 
 		 173 aa  50.4  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000258454  normal  0.542221 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2540  general secretion pathway protein H  60 
 
 		 147 aa  50.8  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.13206  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2913  hypothetical protein  40.68 
 
 		 182 aa  50.8  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0807  hypothetical protein  69.7 
 
 		 182 aa  50.8  0.000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000505152 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0476  methylation site containing protein  53.85 
 
 		 141 aa  50.8  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3944  fimbrial protein pilin  62.86 
 
 		 166 aa  50.8  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.736158  hitchhiker  0.00123211 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0799  fimbrial protein pilin  43.86 
 
 		 139 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744296  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>