More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3271 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_3271  response regulator receiver protein  100 
 
 		 120 aa  241  3e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2789  response regulator receiver domain-containing protein  58.33 
 
 		 122 aa  149  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2690  response regulator receiver domain-containing protein  58.33 
 
 		 124 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0818688 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1368  response regulator receiver protein  59.66 
 
 		 125 aa  139  9e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.136056  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2535  response regulator receiver protein  53.57 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1548  response regulator receiver protein  49.11 
 
 		 124 aa  112  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4117  GAF sensor hybrid histidine kinase  47.9 
 
 		 1588 aa  110  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0887298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7418  response regulator receiver protein  42.5 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.149776  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0612  polar differentiation response regulator  40.83 
 
 		 123 aa  107  6e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6680  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 126 aa  107  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0576  polar differentiation response regulator  40.83 
 
 		 134 aa  107  6e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1347  response regulator receiver protein  40 
 
 		 123 aa  107  6e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.57835  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0925  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3678  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.716343  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1749  two component response regulator  40.83 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.417168  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1381  response regulator receiver protein  40 
 
 		 123 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.427616 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1289  response regulator receiver protein  40 
 
 		 123 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0254052  hitchhiker  0.00394342 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3542  response regulator receiver protein  40 
 
 		 121 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4176  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 128 aa  104  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1943  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.32 
 
 		 1468 aa  103  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0185  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.17 
 
 		 1214 aa  103  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467777  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1865  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 123 aa  103  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.111325  normal  0.212824 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0593  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.1 
 
 		 397 aa  103  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.177467  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0046  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 125 aa  103  9e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4747  putative response regulator in two-component regulatory system (CheY-like protein)  38.33 
 
 		 121 aa  102  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229347  normal  0.575549 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0401  sensor histidine kinase/response regulator  39.32 
 
 		 1392 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0930  response regulator receiver protein  40 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.177566 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1212  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3309  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0966  response regulator receiver  40 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.734958  normal  0.0218415 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0906  response regulator receiver protein  40 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0687715  normal  0.223091 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2412  response regulator receiver domain-containing protein  39.17 
 
 		 121 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3039  response regulator receiver  39.17 
 
 		 121 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.403093  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1219  response regulator receiver protein  48.08 
 
 		 126 aa  101  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1276  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 144 aa  101  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.107336  normal  0.0271474 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0248  response regulator receiver protein  40.16 
 
 		 128 aa  101  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3859  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 124 aa  100  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2443  response regulator receiver domain-containing protein  38.33 
 
 		 121 aa  100  9e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377248  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1431  response regulator receiver  38.33 
 
 		 121 aa  99.8  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3206  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.901142  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0423  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 123 aa  99.8  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.89687 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2814  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 124 aa  99.8  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212392  normal  0.180632 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1496  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 127 aa  100  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.270703 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1097  response regulator receiver protein  37.17 
 
 		 131 aa  98.6  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00801176  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0144  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.17 
 
 		 1119 aa  98.2  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1997  response regulator receiver  50 
 
 		 106 aa  97.8  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0903  cell division response regulator DivK  37.5 
 
 		 121 aa  98.2  4e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.91869  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4316  sensor histidine kinase  40.34 
 
 		 1695 aa  97.1  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.946527 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.86 
 
 		 1358 aa  97.1  8e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.117306 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1646  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.88 
 
 		 391 aa  96.3  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.930467  normal  0.0178265 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.68 
 
 		 1954 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5565  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 126 aa  96.3  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00725459 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1136  GAF sensor hybrid histidine kinase  42.37 
 
 		 1896 aa  96.7  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270239  normal  0.51439 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4779  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.17 
 
 		 1195 aa  95.9  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.133558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1817  response regulator receiver domain-containing protein  39.29 
 
 		 121 aa  95.5  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.202035 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.79 
 
 		 1222 aa  94.7  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1035  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 1201 aa  95.1  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6353  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.83 
 
 		 1839 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5109  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 2099 aa  94.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0669819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6993  GAF sensor hybrid histidine kinase  42.02 
 
 		 1159 aa  94.4  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.922616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5393  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 2099 aa  94  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0480029  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1342  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.05 
 
 		 944 aa  94  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.24 
 
 		 1044 aa  94  7e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227424  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1307  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.8 
 
 		 391 aa  93.6  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5171  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.83 
 
 		 1857 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472035  normal  0.0675906 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3786  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.84 
 
 		 1155 aa  92.8  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3763  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 121 aa  92.8  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.67 
 
 		 1964 aa  92.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.370442 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  39.84 
 
 		 1137 aa  92.8  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3328  GAF sensor hybrid histidine kinase  42.11 
 
 		 1482 aa  93.2  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.84 
 
 		 1137 aa  92.8  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4386  histidine kinase  43.12 
 
 		 411 aa  92  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2107  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 123 aa  92.8  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4000  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 125 aa  92  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5390  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.02 
 
 		 1195 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.596605  hitchhiker  0.00757911 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3526  Hpt sensor hybrid histidine kinase  40.17 
 
 		 920 aa  92.4  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 229 aa  92  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4248  ATP-binding region ATPase domain protein  35.54 
 
 		 1196 aa  91.7  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.02 
 
 		 230 aa  91.7  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1216  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.18 
 
 		 1194 aa  92  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.469894 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1527  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 119 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2180  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 		 922 aa  91.7  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.238731  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2296  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.83 
 
 		 394 aa  91.3  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3996  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.21 
 
 		 1159 aa  90.9  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0287  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.34 
 
 		 1160 aa  90.9  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0260  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.98 
 
 		 1287 aa  90.5  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.579693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.52 
 
 		 1352 aa  90.1  9e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4696  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.14 
 
 		 1917 aa  90.1  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4908  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 130 aa  90.1  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00100675  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1099  response regulator receiver  41.75 
 
 		 129 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  40.52 
 
 		 929 aa  90.1  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0335  response regulator receiver/GGDEF/EAL domain-containing protein  37.5 
 
 		 980 aa  89.7  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.376364  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1134  two-component sensor  38.46 
 
 		 795 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0980947  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0080  response regulator receiver domain-containing protein  35.96 
 
 		 124 aa  89.4  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2473  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 		 1792 aa  89.7  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.443525 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1031  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.44 
 
 		 1131 aa  89.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.768055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0393  histidine kinase  36.36 
 
 		 1200 aa  90.1  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.564913 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0540  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.07 
 
 		 1816 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.46685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2068  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.32 
 
 		 948 aa  89  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3548  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.79 
 
 		 1942 aa  88.6  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>