More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1497 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3340  molydopterin dinucleotide-binding region  46.48 
 
 		 702 aa  656    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1613  putative oxidoreductase  45.43 
 
 		 702 aa  640    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03498  Anaerobic dehydrogenase  45.25 
 
 		 729 aa  637    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1497  molydopterin dinucleotide-binding region  100 
 
 		 713 aa  1482    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0167  molydopterin dinucleotide-binding region  44.07 
 
 		 741 aa  640    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1074  molybdopterin oxidoreductase  45.69 
 
 		 717 aa  657    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18640  putative oxidoreductase  45.71 
 
 		 702 aa  638    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0882727 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2925  molydopterin dinucleotide-binding region  46.88 
 
 		 691 aa  684    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0643  formate dehydrogenase  43.62 
 
 		 764 aa  642    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2059  molybdopterin oxidoreductase  45.79 
 
 		 704 aa  628  1e-179  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4162  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  45.45 
 
 		 732 aa  624  1e-177  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3899  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region  45.43 
 
 		 702 aa  624  1e-177  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.945677 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2405  molydopterin dinucleotide-binding region  42.92 
 
 		 1299 aa  619  1e-176  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.598133  hitchhiker  0.00155962 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1109  molydopterin dinucleotide-binding region  44.37 
 
 		 702 aa  616  1e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4525  molybdopterin oxidoreductase  44.19 
 
 		 701 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840542 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2236  formate dehydrogenase  41.59 
 
 		 726 aa  600  1e-170  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1121  molydopterin dinucleotide-binding region  43.94 
 
 		 702 aa  596  1e-169  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.103516  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1080  molydopterin dinucleotide-binding region  44.08 
 
 		 702 aa  594  1e-168  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4332  molydopterin dinucleotide-binding region  43.44 
 
 		 702 aa  588  1e-167  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4810  molybdopterin dinucleotide-binding region  43.76 
 
 		 739 aa  585  1e-166  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2947  molydopterin dinucleotide-binding region  43.81 
 
 		 731 aa  582  1.0000000000000001e-165  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.975721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3848  molybdopterin oxidoreductase  41.78 
 
 		 738 aa  569  1e-161  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6518  molybdopterin dinucleotide-binding region  40.18 
 
 		 773 aa  563  1.0000000000000001e-159  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2565  molybdopterin oxidoreductase  41.57 
 
 		 747 aa  551  1e-155  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0260966 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5376  molydopterin dinucleotide-binding region  41.13 
 
 		 739 aa  550  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550563 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2776  molydopterin dinucleotide-binding region  43.26 
 
 		 687 aa  543  1e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0816  molybdopterin dinucleotide-binding region  40 
 
 		 732 aa  540  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0515  molybdopterin dinucleotide-binding region  41.25 
 
 		 721 aa  538  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1413  molydopterin dinucleotide-binding region  40.56 
 
 		 739 aa  537  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.395603  normal  0.324246 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3610  molybdopterin dinucleotide-binding region  41.02 
 
 		 733 aa  506  9.999999999999999e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.992314  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1721  molydopterin dinucleotide-binding region  37.78 
 
 		 753 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.54844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4457  molydopterin dinucleotide-binding region  36.93 
 
 		 757 aa  474  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2187  molybdopterin oxidoreductase  34.97 
 
 		 725 aa  432  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000199348  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2055  formate dehydrogenase  33.51 
 
 		 733 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1990  molybdopterin oxidoreductase  33.38 
 
 		 743 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2009  formate dehydrogenase  33.57 
 
 		 715 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5802  molybdopterin oxidoreductase  43.42 
 
 		 768 aa  379  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4342  molydopterin dinucleotide-binding region  32.32 
 
 		 727 aa  371  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.303774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2003  molybdopterin oxidoreductase  32.2 
 
 		 726 aa  362  9e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.447732 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3942  formate dehydrogenase  32.42 
 
 		 721 aa  362  1e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4016  formate dehydrogenase  32.42 
 
 		 721 aa  362  1e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3956  formate dehydrogenase  32.15 
 
 		 721 aa  361  2e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0923262  decreased coverage  0.00564803 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4442  molydopterin dinucleotide-binding region  31.88 
 
 		 720 aa  346  1e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.510451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2249  formate dehydrogenase  30.77 
 
 		 720 aa  331  3e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.404887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4198  formate dehydrogenase  28.02 
 
 		 679 aa  220  6e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.100839  normal  0.216188 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0588  molybdopterin oxidoreductase  25.66 
 
 		 671 aa  213  9e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1621  nitrate reductase  25.26 
 
 		 746 aa  207  7e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.161606  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2551  molybdopterin oxidoreductase  26.33 
 
 		 777 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.163664  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2497  molybdopterin oxidoreductase  26.33 
 
 		 804 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512402  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29050  putative molybdopterin oxidoreductase  26.13 
 
 		 769 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388245 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2639  molybdopterin oxidoreductase family protein  26.33 
 
 		 849 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2648  molybdopterin oxidoreductase  24.9 
 
 		 747 aa  201  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104156  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1778  molydopterin dinucleotide-binding region  26.36 
 
 		 738 aa  198  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1975  molybdopterin oxidoreductase family protein  28.46 
 
 		 769 aa  192  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595995  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  27.51 
 
 		 759 aa  187  5e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1612  molybdopterin oxidoreductase family protein  28.54 
 
 		 773 aa  187  6e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.915489  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1387  molybdopterin oxidoreductase family protein  28.54 
 
 		 804 aa  187  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.397965  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2114  molybdopterin oxidoreductase family protein  28.54 
 
 		 804 aa  187  6e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3201  molybdopterin oxidoreductase family protein  28.54 
 
 		 777 aa  187  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.938387  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  25.85 
 
 		 722 aa  186  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3010  formate dehydrogenase  27.08 
 
 		 754 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189553  normal  0.616096 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0031  molybdopterin dinucleotide-binding region  25 
 
 		 679 aa  179  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0090  molybdopterin oxidoreductase  26.4 
 
 		 697 aa  180  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0958221 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4542  molybdopterin oxidoreductase  25.38 
 
 		 703 aa  177  5e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.1046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10199  oxidoreductase  28.27 
 
 		 749 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.29998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2721  formate dehydrogenase  25 
 
 		 752 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.94379  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2765  formate dehydrogenase  25 
 
 		 752 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1091  molybdopterin oxidoreductase  26.5 
 
 		 712 aa  175  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0358526  hitchhiker  0.000876174 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3324  molybdopterin oxidoreductase  24.9 
 
 		 673 aa  174  5e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.54473 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.65 
 
 		 886 aa  172  3e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1466  molybdopterin oxidoreductase  25.48 
 
 		 731 aa  171  4e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  24.63 
 
 		 1143 aa  171  5e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.3 
 
 		 917 aa  171  6e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2751  formate dehydrogenase  24.74 
 
 		 752 aa  171  6e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.215233  normal  0.0781523 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2474  molybdopterin oxidoreductase  24.93 
 
 		 684 aa  171  6e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00135693  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.39 
 
 		 676 aa  170  7e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3287  molybdopterin oxidoreductase  24.86 
 
 		 695 aa  169  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3288  formate dehydrogenase  28.21 
 
 		 753 aa  169  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.138891  normal  0.334154 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1932  molybdopterin oxidoreductase  25.69 
 
 		 726 aa  169  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1166  formate dehydrogenase  27.29 
 
 		 750 aa  169  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2139  molybdopterin oxidoreductase  24.63 
 
 		 739 aa  168  2.9999999999999998e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.113571  normal  0.495973 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.39 
 
 		 676 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3041  molybdopterin oxidoreductase  23.73 
 
 		 674 aa  167  4e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.70523 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1073  molydopterin dinucleotide-binding region  25.3 
 
 		 835 aa  168  4e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  24.49 
 
 		 1139 aa  167  5e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1823  molybdopterin oxidoreductase  25.21 
 
 		 726 aa  167  5e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320306  normal  0.908332 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2208  molybdopterin oxidoreductase  25.55 
 
 		 726 aa  167  8e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.26 
 
 		 685 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.46 
 
 		 688 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1237  Nitrate reductase  27.22 
 
 		 734 aa  164  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0895339  hitchhiker  0.000112023 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2597  molybdopterin oxidoreductase  24.62 
 
 		 688 aa  163  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.95 
 
 		 676 aa  163  1e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1003  molybdopterin oxidoreductase  26.18 
 
 		 700 aa  163  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1565  reductase  25.54 
 
 		 704 aa  163  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  23.66 
 
 		 899 aa  162  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.26 
 
 		 900 aa  161  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2414  molybdopterin oxidoreductase  26.64 
 
 		 706 aa  160  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00180215  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1886  molybdopterin oxidoreductase  24.58 
 
 		 747 aa  159  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1580  molybdopterin oxidoreductase  25.07 
 
 		 694 aa  160  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8953  reductase  24.72 
 
 		 674 aa  160  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>