More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1302 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1302  polysaccharide biosynthesis protein CapD  100 
 
 		 355 aa  727    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.454328  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2184  polysaccharide biosynthesis protein CapD  55.26 
 
 		 404 aa  367  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0428  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45 
 
 		 343 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0374599  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2232  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.59 
 
 		 332 aa  301  9e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1591  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.75 
 
 		 344 aa  297  2e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.49643  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0501  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.05 
 
 		 330 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.153832  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0147  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.71 
 
 		 340 aa  284  2.0000000000000002e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.886918  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1471  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.59 
 
 		 341 aa  276  3e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0227  polysaccharide biosynthesis protein CapD  48.8 
 
 		 337 aa  272  7e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.377971  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1718  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.69 
 
 		 341 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.910405  hitchhiker  0.0000000304233 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3221  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.77 
 
 		 335 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3520  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.34 
 
 		 328 aa  241  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0580  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.59 
 
 		 333 aa  236  4e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.174594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1447  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  41.58 
 
 		 328 aa  235  8e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000193449 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2629  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.23 
 
 		 331 aa  233  5e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3851  FlmA  40.21 
 
 		 328 aa  231  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3271  polysaccharide biosynthesis protein  37.13 
 
 		 331 aa  229  4e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0778  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.83 
 
 		 325 aa  229  5e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1318  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.96 
 
 		 332 aa  229  6e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.914837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1778  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.49 
 
 		 350 aa  229  7e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0117  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.51 
 
 		 335 aa  229  7e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000592797 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1373  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.57 
 
 		 344 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.45387  hitchhiker  0.00458395 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1872  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.96 
 
 		 336 aa  228  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0528646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1302  polysaccharide biosynthesis protein  37.95 
 
 		 331 aa  227  2e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.112616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0020  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.61 
 
 		 353 aa  226  4e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3711  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.07 
 
 		 333 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.724189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1980  polysaccharide biosynthesis protein  36.08 
 
 		 344 aa  226  7e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2967  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.62 
 
 		 331 aa  225  9e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1396  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.62 
 
 		 331 aa  225  9e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.709485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2334  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.74 
 
 		 614 aa  224  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000027  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3090  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.34 
 
 		 326 aa  224  2e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.196445  normal  0.352446 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1298  UDP-GlcNAc C6-dehydratase/C4-reductase  36.63 
 
 		 335 aa  223  3e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3801  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.96 
 
 		 348 aa  222  9e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0726  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  38.28 
 
 		 337 aa  220  1.9999999999999999e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3511  UDP-glucose 4-epimerase  40.91 
 
 		 336 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000024389 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1485  polysaccharide biosynthesis protein  36.3 
 
 		 334 aa  220  3e-56  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.317262  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2208  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  35.76 
 
 		 329 aa  219  5e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0535487  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1621  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.42 
 
 		 338 aa  219  7e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1310  polysaccharide biosynthesis protein  36.3 
 
 		 334 aa  219  7.999999999999999e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.573218  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1286  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.01 
 
 		 331 aa  218  1e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1536  polysaccharide biosynthesis protein  44.56 
 
 		 647 aa  217  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2322  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.83 
 
 		 332 aa  218  2e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10733  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.24 
 
 		 653 aa  216  4e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0139  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.72 
 
 		 342 aa  216  5e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0144  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.72 
 
 		 342 aa  216  5e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0429  polysaccharide biosynthesis protein  35.97 
 
 		 334 aa  216  5.9999999999999996e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1957  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.14 
 
 		 357 aa  216  5.9999999999999996e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.540068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3268  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.23 
 
 		 629 aa  215  7e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2246  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  37.86 
 
 		 336 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0093  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.75 
 
 		 333 aa  215  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.403582 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3558  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.75 
 
 		 333 aa  215  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.437109  normal  0.427053 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1199  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.8 
 
 		 327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.530201 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0128  hypothetical protein  43.69 
 
 		 635 aa  214  1.9999999999999998e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0458  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.89 
 
 		 342 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0765  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.68 
 
 		 630 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.932307  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4753  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.63 
 
 		 345 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.447789  normal  0.0884742 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1633  FlmA  35.96 
 
 		 331 aa  213  3.9999999999999995e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1518  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.42 
 
 		 333 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.280588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1142  nucleoside-diphosphate sugar epimerase  38.46 
 
 		 356 aa  212  7.999999999999999e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02896  polysaccharide biosynthesis protein  37.42 
 
 		 332 aa  212  9e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2421  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.6 
 
 		 340 aa  211  1e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0039  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.46 
 
 		 620 aa  212  1e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1193  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.59 
 
 		 333 aa  211  1e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.965289  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0776  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.68 
 
 		 627 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.905737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3560  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.53 
 
 		 331 aa  212  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.423862 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3994  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.08 
 
 		 612 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.460388 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2504  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.68 
 
 		 628 aa  211  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.288119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0560  polysaccharide biosynthesis protein  37.33 
 
 		 328 aa  211  2e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4081  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.27 
 
 		 612 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3026  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.52 
 
 		 350 aa  211  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1480  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.91 
 
 		 345 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0141626  normal  0.282035 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01570  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  38.1 
 
 		 327 aa  210  3e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0782999 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1672  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.12 
 
 		 346 aa  210  4e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3715  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.61 
 
 		 344 aa  209  5e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.722931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0609  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  36.84 
 
 		 333 aa  209  6e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.812779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05820  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  44.03 
 
 		 613 aa  209  7e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0718639  hitchhiker  0.00116651 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1283  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.21 
 
 		 350 aa  209  9e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3090  capsular polysaccharide biosynthesis protein  43.97 
 
 		 637 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1976  polysaccharide synthase family protein  43.97 
 
 		 637 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113139  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3127  capsular polysaccharide biosynthesis protein  43.97 
 
 		 637 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0937  polysaccharide synthase family protein  43.97 
 
 		 637 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.217913  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0643  Short-chain dehydrogenase/reductase  39.74 
 
 		 333 aa  208  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.132994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3150  polysaccharide biosynthesis protein  43.97 
 
 		 637 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1838  polysaccharide synthase family protein  43.97 
 
 		 637 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1483  capsular polysaccharide biosynthesis  43.97 
 
 		 656 aa  208  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2767  polysaccharide synthase family protein  43.97 
 
 		 637 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.149651  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1997  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.85 
 
 		 650 aa  208  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.521686 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3033  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.57 
 
 		 340 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0138  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.01 
 
 		 336 aa  207  2e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749249  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5444  FlmA  37.28 
 
 		 345 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3984  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.33 
 
 		 627 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.430813 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3011  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.99 
 
 		 331 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3050  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.08 
 
 		 613 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0408  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.13 
 
 		 627 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0887  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.13 
 
 		 627 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0857  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.13 
 
 		 627 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2741  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.22 
 
 		 355 aa  206  7e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0748  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.8 
 
 		 336 aa  206  7e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2497  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.9 
 
 		 613 aa  205  8e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.495773  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13073  capsular polysaccharide biosynthesis protein  38.23 
 
 		 336 aa  205  1e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>