244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1470 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1470  LemA  100 
 
 		 188 aa  381  1e-105  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134272  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  98.4 
 
 		 188 aa  378  1e-104  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1586  hypothetical protein  97.87 
 
 		 188 aa  350  1e-95  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000121977  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0244  LemA family protein  57.92 
 
 		 199 aa  210  7.999999999999999e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  54.95 
 
 		 183 aa  206  2e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1528  LemA family protein  58.29 
 
 		 196 aa  200  9e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00267014  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2479  LemA family protein  55 
 
 		 201 aa  194  5.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146939  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  54.1 
 
 		 183 aa  192  3e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1740  LemA family protein  55 
 
 		 201 aa  189  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1468  LemA family protein  52.3 
 
 		 195 aa  189  2.9999999999999997e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.510116  normal  0.223754 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5170  LemA family protein  54.02 
 
 		 195 aa  188  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.212302 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3304  hypothetical protein  56.82 
 
 		 193 aa  187  8e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30627  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  51.65 
 
 		 181 aa  187  9e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  50 
 
 		 183 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  50.54 
 
 		 183 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0090  LemA family protein  55.95 
 
 		 184 aa  183  1.0000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  50.27 
 
 		 183 aa  183  1.0000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3383  LemA family protein  56 
 
 		 193 aa  182  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.796761  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0378  LemA family protein  54.65 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000407408  decreased coverage  1.42653e-16 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  53.8 
 
 		 184 aa  181  4.0000000000000006e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1607  LemA family protein  49.74 
 
 		 196 aa  181  5.0000000000000004e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  50 
 
 		 184 aa  180  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2025  LemA family protein  47.64 
 
 		 195 aa  178  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3447  LemA family protein  54.86 
 
 		 193 aa  178  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1832  hypothetical protein  52.91 
 
 		 198 aa  177  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0756  cytoplasmic membrane protein  55.42 
 
 		 186 aa  176  2e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  52.38 
 
 		 186 aa  176  3e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0070  LemA family protein  50.58 
 
 		 181 aa  174  8e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0639  hypothetical protein  51.76 
 
 		 182 aa  173  9.999999999999999e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1073  LemA family protein  47.89 
 
 		 194 aa  171  5.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  46.81 
 
 		 192 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  48.37 
 
 		 184 aa  170  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0076  hypothetical protein  50 
 
 		 185 aa  169  1e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.071632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3150  divalent cation transporter  52.2 
 
 		 196 aa  169  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  48.91 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3638  LemA family protein  46.73 
 
 		 197 aa  169  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0753155 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0513  LemA family protein  47.95 
 
 		 184 aa  168  5e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2974  LemA family protein  49.71 
 
 		 189 aa  167  7e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2687  LemA family protein  52.23 
 
 		 189 aa  167  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.487448 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1068  hypothetical protein  50.87 
 
 		 192 aa  167  1e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4440  hypothetical protein  46.73 
 
 		 197 aa  165  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3645  LemA family protein  47.95 
 
 		 249 aa  164  8e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0165  LemA family protein  47.78 
 
 		 182 aa  163  1.0000000000000001e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.743151 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1788  LemA family protein  52.41 
 
 		 208 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1831  LemA family protein  51.81 
 
 		 187 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00691191  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  44.86 
 
 		 186 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  47.12 
 
 		 183 aa  161  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3528  LemA-like protein  43.92 
 
 		 187 aa  161  4.0000000000000004e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000294  LemA protein  48.33 
 
 		 196 aa  161  6e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0155737  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  45.65 
 
 		 186 aa  160  8.000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0874  LemA family protein  45.7 
 
 		 185 aa  160  9e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938199  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  47.12 
 
 		 183 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0033  LemA family protein  45.35 
 
 		 189 aa  159  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1437  hypothetical protein  51.59 
 
 		 198 aa  159  2e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.323013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1707  LemA family protein  48.85 
 
 		 192 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  45.79 
 
 		 183 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0344  hypothetical protein  54.25 
 
 		 186 aa  159  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5847  LemA family protein  44.33 
 
 		 193 aa  159  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.871032 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0241  LemA family protein  47.06 
 
 		 189 aa  157  8e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1702  LemA protein  50.89 
 
 		 187 aa  155  2e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.159811  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0464  LemA family protein  47.78 
 
 		 182 aa  155  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.415614 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3704  LemA protein  46.75 
 
 		 192 aa  155  3e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0429675 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1185  hypothetical protein  42.37 
 
 		 185 aa  154  5.0000000000000005e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0911033  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21021  hypothetical protein  44.02 
 
 		 188 aa  153  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.617296 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4520  LemA family protein  42.55 
 
 		 188 aa  153  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0360  hypothetical protein  45.36 
 
 		 196 aa  152  2e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.193957 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4336  LemA family protein  43.3 
 
 		 193 aa  153  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.54593 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0955  LemA family protein  40.51 
 
 		 202 aa  152  2.9999999999999998e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1670  LemA family protein  45.93 
 
 		 186 aa  152  2.9999999999999998e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0320592  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1739  LemA family protein  49.7 
 
 		 187 aa  152  2.9999999999999998e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.572678  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2260  LemA family protein  46.39 
 
 		 180 aa  150  8e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000506129 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0577  hypothetical protein  42.02 
 
 		 184 aa  149  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0316568  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2124  LemA family protein  44.94 
 
 		 185 aa  149  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2159  LemA family protein  44.1 
 
 		 197 aa  149  2e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1210  LemA family protein  43.43 
 
 		 187 aa  149  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0634  LemA protein  46.39 
 
 		 187 aa  148  4e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1519  hypothetical protein  43.92 
 
 		 201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.268793 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3226  hypothetical protein  43.52 
 
 		 208 aa  144  5e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.969393  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3602  LemA family protein  42.11 
 
 		 217 aa  144  5e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1403  LemA family protein  43.01 
 
 		 196 aa  144  7.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0276  LemA family protein  41.49 
 
 		 187 aa  144  8.000000000000001e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0665  hypothetical protein  43.59 
 
 		 200 aa  144  9e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.510927  normal  0.615683 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2626  hypothetical protein  44.62 
 
 		 208 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2286  LemA family protein  45.78 
 
 		 185 aa  142  3e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0607  LemA family protein  45.76 
 
 		 208 aa  141  6e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0811  hypothetical protein  41.12 
 
 		 210 aa  140  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0555  LemA family protein  45.2 
 
 		 208 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.556411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0089  hypothetical protein  41.11 
 
 		 188 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2027  LemA family protein  40.31 
 
 		 195 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.90664  normal  0.597952 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0659  LemA family protein  48.32 
 
 		 192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1824  LemA family protein  42.19 
 
 		 198 aa  139  3e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0438485  normal  0.915056 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1518  LemA  48.32 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.639052  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3965  LemA family protein  50.32 
 
 		 187 aa  139  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47030  Conserved hypothetical protein, LemA family  43.3 
 
 		 204 aa  138  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1371  hypothetical protein  42.19 
 
 		 194 aa  138  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000117075  hitchhiker  0.000133503 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35290  hypothetical protein  40.35 
 
 		 195 aa  138  4.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.448083 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2798  LemA family protein  40.8 
 
 		 190 aa  138  6e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56810  putative lemA-like protein  41.95 
 
 		 190 aa  137  6e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04653  LemA family protein  44.57 
 
 		 212 aa  137  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0176024  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1494  LemA family protein  39.57 
 
 		 180 aa  136  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>