98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1444 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1444  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 243 aa  497  1e-140  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0102884  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1311  MerR family transcriptional regulator  84.77 
 
 		 243 aa  431  1e-120  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1566  MerR family transcriptional regulator  55.09 
 
 		 229 aa  244  9e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000201032  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1547  MerR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 242 aa  78.2  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1596  transcriptional regulator, MerR family  46.15 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3230  transcriptional regulator, MerR family  25.32 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129557  normal  0.789887 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0186  MerR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0070729  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1547  transcriptional regulator, MerR family  36.71 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2692  regulatory protein, MerR  38.57 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0457116  normal  0.169515 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0189  MerR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000528069  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1430  transcriptional regulator, MerR family  34.74 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130007  normal  0.485128 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1415  transcriptional regulator, MerR family  42.67 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000599633  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2080  transcriptional regulator, MerR family  40.28 
 
 		 256 aa  53.1  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.632784  hitchhiker  0.000000000732695 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1885  transcriptional regulator, MerR family  25 
 
 		 246 aa  53.5  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0149  transcriptional regulator, MerR family  25.95 
 
 		 248 aa  52.8  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 146 aa  52.4  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0210  putative transcriptional regulator, MerR family  36.76 
 
 		 215 aa  52.4  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.024863  hitchhiker  0.00385009 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2381  regulatory protein, MerR  29.51 
 
 		 249 aa  52  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.426132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 288 aa  51.2  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  32.95 
 
 		 148 aa  48.9  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  32.95 
 
 		 148 aa  48.9  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1667  regulatory protein, MerR  29.81 
 
 		 136 aa  48.5  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4917  MerR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 186 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475602 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23510  predicted transcriptional regulator  30.26 
 
 		 138 aa  48.1  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.719058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0303  transcriptional regulator, MerR family  38.16 
 
 		 154 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00540997  normal  0.988288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2041  putative transcriptional regulator, MerR family  38.36 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0073  hypothetical protein  38.89 
 
 		 314 aa  47.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0572864  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  37.5 
 
 		 159 aa  47  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4350  transcriptional regulator, MerR family  37.1 
 
 		 131 aa  47  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3466  transcriptional regulator, MerR family  34.67 
 
 		 210 aa  46.2  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0193337  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05447  transcription regulator protein  35.71 
 
 		 170 aa  46.6  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.015587 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1255  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  30.23 
 
 		 130 aa  46.2  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3179  MerR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 235 aa  46.6  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.531372  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1413  hypothetical protein  35.63 
 
 		 315 aa  46.2  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1336  MerR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 146 aa  46.2  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.200551  normal  0.195494 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2170  transcriptional regulator, MerR family  27.73 
 
 		 133 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000807108 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2024  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  30.23 
 
 		 130 aa  45.8  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1388  transcriptional regulator, MerR family  34.29 
 
 		 221 aa  45.8  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902771  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 141 aa  45.8  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3401  MerR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 248 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.144453  normal  0.535635 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1225  MerR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 245 aa  45.4  0.0008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.786651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1798  hypothetical protein  27.98 
 
 		 269 aa  45.4  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1479  MerR family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 237 aa  45.4  0.0009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.342575  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3763  transcriptional regulator, MerR family  38.81 
 
 		 132 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.503955  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2519  MerR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 249 aa  45.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.94441  hitchhiker  0.00949223 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0557  MerR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 224 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000848982 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  32.56 
 
 		 135 aa  44.7  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0802  MerR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 165 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0285806 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1961  MerR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 134 aa  45.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.778807  normal  0.944936 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3005  MerR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 144 aa  45.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44472  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2780  MerR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 144 aa  44.3  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.891963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3925  MerR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 147 aa  43.9  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.847498  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1581  hypothetical protein  34.48 
 
 		 315 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2071  MerR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 177 aa  43.9  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.776641  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05650  predicted transcriptional regulator  33.82 
 
 		 217 aa  44.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0419  MerR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 146 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000107138  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 131 aa  44.3  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3216  transcriptional regulator, MerR family  29.09 
 
 		 155 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  31.91 
 
 		 129 aa  44.3  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02196  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  40.35 
 
 		 148 aa  43.9  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02024  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  31.51 
 
 		 138 aa  43.9  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.675487  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0920  MerR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 141 aa  43.9  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.320526  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 147 aa  43.5  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18270  predicted transcriptional regulator  26.59 
 
 		 258 aa  43.5  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.437483 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 297 aa  43.5  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4307  transcriptional regulator, MerR family  37.29 
 
 		 141 aa  43.5  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00729055  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1189  MerR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 156 aa  43.5  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0275  transcriptional regulator, MerR family  35.94 
 
 		 107 aa  43.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.524855  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2399  transcriptional regulator, MerR family  35.71 
 
 		 209 aa  43.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000562399  decreased coverage  0.00011903 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0754  transcriptional regulator, MerR family  39.73 
 
 		 287 aa  43.1  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00066154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  36.62 
 
 		 244 aa  43.1  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4808  transcriptional regulator, MerR family  34.55 
 
 		 160 aa  43.1  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.820733 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3731  transcriptional regulator, MerR family  34.55 
 
 		 160 aa  43.1  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1199  MerR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 138 aa  43.1  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00877844  normal  0.661473 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  34.78 
 
 		 141 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  33.8 
 
 		 251 aa  43.1  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4009  transcriptional regulator, MerR family  26.88 
 
 		 246 aa  42.7  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.57553  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3788  MerR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 144 aa  42.7  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.318416  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13367  MerR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 146 aa  42.7  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 161 aa  42.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3828  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 122 aa  42.4  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1739  transcriptional regulator, MerR family  24.86 
 
 		 264 aa  42.7  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174089  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1642  transcriptional regulator, MerR family  33.8 
 
 		 143 aa  42.4  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349097  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3486  transcriptional regulator, MerR family  35.71 
 
 		 135 aa  42.4  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5283  transcriptional regulator, MerR family  33.8 
 
 		 143 aa  42.4  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2122  MerR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 131 aa  42.4  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392854  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2189  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 213 aa  42.4  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0218623 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3972  MerR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 149 aa  42.4  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0926  transcriptional regulator, MerR family  32.81 
 
 		 144 aa  42.4  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.129238  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5351  transcriptional regulator, MerR family  33.8 
 
 		 144 aa  42.4  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3134  MerR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 244 aa  42  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0691359 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1773  transcriptional regulator, MerR family  36.26 
 
 		 142 aa  42.4  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1241  MerR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 144 aa  42  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3105  transcriptional regulator, MerR family  33.78 
 
 		 255 aa  42  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0154295  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3675  MerR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 270 aa  41.6  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3639  putative transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 139 aa  42  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1351  transcriptional regulator MerR family CueR domain protein  41.43 
 
 		 142 aa  41.6  0.01  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1655  MerR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 237 aa  42  0.01  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>