127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4095 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4095  response regulator receiver protein  100 
 
 		 136 aa  283  5e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000187533  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2217  response regulator receiver protein  88.24 
 
 		 136 aa  254  4e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000010228  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2353  response regulator receiver protein  76.23 
 
 		 131 aa  194  5.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0699449  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0512  response regulator receiver and SARP domain protein  43.2 
 
 		 128 aa  96.3  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0216244  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1752  LytTr family DNA-binding response regulator  35.45 
 
 		 236 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000046925  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1482  LytTr family DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00010327  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1167  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.78 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1697  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.88 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.325505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1600  LytTR family two component transcriptional regulator  34.82 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2345  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.34 
 
 		 240 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.681344 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3118  LytTR family two component transcriptional regulator  29.51 
 
 		 236 aa  52.4  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00259319  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0033  DNA-binding response regulator  29.75 
 
 		 239 aa  52  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00150761  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2646  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.93 
 
 		 252 aa  49.7  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0468  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.27 
 
 		 244 aa  48.9  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3542  PAS sensor protein  28.91 
 
 		 656 aa  47.8  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.11869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.91 
 
 		 717 aa  47  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1714  two component LuxR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 213 aa  47  0.00009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.975164  hitchhiker  0.000785935 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0486  DNA-binding response regulator  29.36 
 
 		 238 aa  46.2  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0347807  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4754  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.03 
 
 		 852 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.16465  normal  0.0663611 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5991  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.64 
 
 		 642 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0659  response regulator receiver  28.46 
 
 		 265 aa  45.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0498  DNA-binding response regulator  29.67 
 
 		 238 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000000794566  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0448  response regulator receiver  32.43 
 
 		 224 aa  46.2  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000838603  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6245  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.99 
 
 		 857 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2180  DNA-binding response regulator  36.71 
 
 		 223 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0299585  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1891  DNA-binding response regulator  36.71 
 
 		 223 aa  45.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4352  response regulator receiver protein  27.42 
 
 		 265 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0478  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.09 
 
 		 422 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.60604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1813  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  23.16 
 
 		 542 aa  44.3  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.41 
 
 		 1820 aa  44.3  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0203  response regulator receiver  32.38 
 
 		 231 aa  44.3  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.359659 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2011  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.32 
 
 		 814 aa  43.9  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.866808 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2006  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  26.77 
 
 		 852 aa  43.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000507491  normal  0.0782006 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 303 aa  43.9  0.0008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1957  response regulator  34.04 
 
 		 250 aa  43.5  0.0009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5047  response regulator receiver protein  36.05 
 
 		 521 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2505  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.91 
 
 		 331 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1381  response regulator receiver protein  28.7 
 
 		 265 aa  43.5  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2942  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.11 
 
 		 451 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2394  response regulator receiver protein  26.98 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08151  response regulator  35.44 
 
 		 516 aa  43.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.51 
 
 		 1548 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2425  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.87 
 
 		 242 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2270  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.58 
 
 		 234 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0127  alginate biosynthesis regulatory protein AlgR  32.54 
 
 		 248 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0602  nitrate/nitrite response regulator  40.98 
 
 		 219 aa  42.7  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.790372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0223  PAS  26.98 
 
 		 1214 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0085  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.76 
 
 		 453 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3531  response regulator receiver protein  26.4 
 
 		 265 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4282  PglZ domain protein  30.11 
 
 		 518 aa  42.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.769544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3157  response regulator receiver protein  27.42 
 
 		 266 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5814  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.83 
 
 		 583 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.552615  normal  0.0161436 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0191  histidine kinase  26.45 
 
 		 531 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.363458 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1568  response regulator receiver and SARP domain protein  41.51 
 
 		 288 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0553389  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2205  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.89 
 
 		 887 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.188088 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0005  two component transcriptional regulator  25.81 
 
 		 238 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000487758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0363  response regulator receiver  30.3 
 
 		 228 aa  42  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3091  two component LuxR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 212 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0663  two component LuxR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 219 aa  42  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1933  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  25.26 
 
 		 411 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3450  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31 
 
 		 718 aa  41.6  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000325842 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2067  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.1 
 
 		 233 aa  42  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000016314  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1054  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 188 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3131  two component LuxR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 212 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33361 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0242  two component LuxR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 211 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000159114 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0057  putative membrane associated response regulator  29.25 
 
 		 741 aa  41.6  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0705  response regulator receiver  30.77 
 
 		 231 aa  42  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00025775  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1937  response regulator receiver protein  29.21 
 
 		 269 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2019  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.51 
 
 		 1016 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.25506  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1736  DNA-binding response regulator NarL  29.59 
 
 		 233 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1887  transmission sensor LetS  34.38 
 
 		 910 aa  41.6  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1323  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.34 
 
 		 237 aa  41.6  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0540721  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2764  DNA-binding response regulator NarL  29.59 
 
 		 233 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.922757  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1591  response regulator receiver protein  29.89 
 
 		 266 aa  41.6  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2943  two component LuxR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 215 aa  41.6  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2246  DNA-binding response regulator NarL  29.59 
 
 		 233 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3072  DNA-binding response regulator NarL  29.59 
 
 		 233 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2630  nitrate/nitrite response regulator protein NarL  29.59 
 
 		 233 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.14617  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2686  nitrate/nitrite response regulator protein NarL  29.59 
 
 		 233 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1519  DNA-binding response regulator NarL  29.59 
 
 		 233 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.281442  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0842  two component LuxR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 209 aa  41.6  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000336278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0036  two component LuxR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 221 aa  41.6  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0464925  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1285  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 		 1070 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.102629  normal  0.010179 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0364  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.1 
 
 		 1013 aa  41.6  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.33 
 
 		 1410 aa  41.2  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.38 
 
 		 237 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1669  two component LuxR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 221 aa  41.2  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1787  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.3 
 
 		 931 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10420  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.48 
 
 		 253 aa  41.2  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460621  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1794  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.27 
 
 		 795 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.477207 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0419  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.21 
 
 		 1260 aa  40.8  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.784662  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1876  transmission sensor LetS  55 
 
 		 910 aa  40.8  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00970  two-component sensor molecule, putative  34.48 
 
 		 1211 aa  40.8  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0063  response regulator receiver:LytTr DNA-binding region  31.75 
 
 		 248 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2946  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  27.78 
 
 		 777 aa  40.8  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2172  LytR/AlgR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 252 aa  40.8  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721488  normal  0.0255714 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2906  response regulator receiver protein  32.56 
 
 		 517 aa  40.8  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.568683  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0802  two component transcriptional regulator  39.66 
 
 		 220 aa  40.8  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0929  two component LuxR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 209 aa  40.8  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000567962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0677  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  27.78 
 
 		 343 aa  40.8  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.756866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>