145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2217 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2217  response regulator receiver protein  100 
 
 		 136 aa  282  9e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000010228  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4095  response regulator receiver protein  88.24 
 
 		 136 aa  254  4e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000187533  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2353  response regulator receiver protein  71.54 
 
 		 131 aa  195  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0699449  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0512  response regulator receiver and SARP domain protein  44 
 
 		 128 aa  93.6  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0216244  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1752  LytTr family DNA-binding response regulator  35.45 
 
 		 236 aa  67  0.00000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000046925  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1482  LytTr family DNA-binding response regulator  32.56 
 
 		 236 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00010327  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1167  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.06 
 
 		 245 aa  61.6  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2345  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.48 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.681344 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1697  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.89 
 
 		 240 aa  58.5  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.325505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1600  LytTR family two component transcriptional regulator  34.82 
 
 		 245 aa  57.8  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3118  LytTR family two component transcriptional regulator  31.15 
 
 		 236 aa  53.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00259319  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0468  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.09 
 
 		 244 aa  50.8  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0033  DNA-binding response regulator  32.8 
 
 		 239 aa  50.4  0.000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00150761  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2067  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.32 
 
 		 233 aa  48.9  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000016314  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0498  DNA-binding response regulator  30 
 
 		 238 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000000794566  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5814  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.96 
 
 		 583 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.552615  normal  0.0161436 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0486  DNA-binding response regulator  30 
 
 		 238 aa  47.8  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0347807  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0364  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.97 
 
 		 1013 aa  47.8  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.12 
 
 		 717 aa  47.4  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0583  response regulator  27.27 
 
 		 236 aa  47.4  0.00007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08151  response regulator  36.71 
 
 		 516 aa  47.4  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2270  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.85 
 
 		 234 aa  47  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  30.11 
 
 		 1683 aa  46.6  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2011  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.88 
 
 		 814 aa  46.2  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.866808 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0659  response regulator receiver  30.89 
 
 		 265 aa  46.6  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2646  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.45 
 
 		 252 aa  46.6  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5991  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.46 
 
 		 642 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0394  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  32.26 
 
 		 352 aa  46.6  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000553759  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0602  nitrate/nitrite response regulator  37.8 
 
 		 219 aa  46.2  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.790372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0904  two component Fis family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 454 aa  45.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.629928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4282  PglZ domain protein  31.96 
 
 		 518 aa  45.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.769544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4754  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.19 
 
 		 852 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.16465  normal  0.0663611 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0663  two component LuxR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 219 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.03 
 
 		 2213 aa  45.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4352  response regulator receiver protein  28.72 
 
 		 265 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0802  two component transcriptional regulator  41.38 
 
 		 220 aa  45.1  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2205  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.13 
 
 		 887 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.188088 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0223  PAS  27.87 
 
 		 1214 aa  44.7  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1937  response regulator receiver protein  30.34 
 
 		 269 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1285  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.47 
 
 		 1070 aa  44.3  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.102629  normal  0.010179 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0677  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.8 
 
 		 343 aa  44.3  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.756866  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5047  response regulator receiver protein  33.72 
 
 		 521 aa  44.3  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4102  response regulator receiver  30 
 
 		 185 aa  44.3  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.668495 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.51 
 
 		 1548 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6245  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.27 
 
 		 857 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1714  two component LuxR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 213 aa  43.9  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.975164  hitchhiker  0.000785935 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2006  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.56 
 
 		 852 aa  43.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000507491  normal  0.0782006 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0191  histidine kinase  26.02 
 
 		 531 aa  43.9  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.363458 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1381  response regulator receiver protein  28.83 
 
 		 265 aa  43.5  0.0009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4522  response regulator receiver protein  30 
 
 		 185 aa  43.5  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.171395  decreased coverage  0.000607149 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1923  response regulator receiver domain-containing protein  26.83 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0400  response regulator receiver protein  34.44 
 
 		 210 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1787  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.19 
 
 		 931 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10420  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.33 
 
 		 253 aa  43.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460621  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1957  response regulator  32.98 
 
 		 250 aa  42.7  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  23.96 
 
 		 1765 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1736  DNA-binding response regulator NarL  30.61 
 
 		 233 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2764  DNA-binding response regulator NarL  30.61 
 
 		 233 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.922757  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2172  LytR/AlgR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 252 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721488  normal  0.0255714 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2180  DNA-binding response regulator  31.68 
 
 		 223 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0299585  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1891  DNA-binding response regulator  31.68 
 
 		 223 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2246  DNA-binding response regulator NarL  30.61 
 
 		 233 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3072  DNA-binding response regulator NarL  30.61 
 
 		 233 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0508  response regulator receiver protein  28.89 
 
 		 265 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0266508  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2630  nitrate/nitrite response regulator protein NarL  30.61 
 
 		 233 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.14617  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2686  nitrate/nitrite response regulator protein NarL  30.61 
 
 		 233 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1519  DNA-binding response regulator NarL  30.61 
 
 		 233 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.281442  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2075  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  31.91 
 
 		 572 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1948  aerobic respiration control sensor protein ArcB  28.74 
 
 		 785 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000151303  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1994  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.89 
 
 		 236 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3816  response regulator receiver protein  28.89 
 
 		 265 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0586034  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3760  response regulator receiver protein  28.89 
 
 		 265 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.860481 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3942  response regulator receiver protein  28.89 
 
 		 265 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.395841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03853  transcriptional regulator NarL  32.63 
 
 		 217 aa  42.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000020037  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00970  two-component sensor molecule, putative  36.21 
 
 		 1211 aa  42  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2312  response regulator receiver domain-containing protein  28.8 
 
 		 121 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1669  two component LuxR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 221 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3157  response regulator receiver protein  24.59 
 
 		 266 aa  41.6  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3324  response regulator receiver protein  30 
 
 		 265 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0601  response regulator  23.93 
 
 		 121 aa  41.6  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1423  response regulator receiver protein  45.1 
 
 		 116 aa  42  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0601  response regulator receiver protein  27.64 
 
 		 265 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3730  response regulator receiver protein  27.05 
 
 		 265 aa  42  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2225  histidine kinase  36.46 
 
 		 845 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0086849  normal  0.197777 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2425  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.77 
 
 		 242 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1469  response regulator receiver protein  45.1 
 
 		 116 aa  42  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  34.29 
 
 		 227 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0005  two component transcriptional regulator  24.73 
 
 		 238 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000487758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  34.29 
 
 		 227 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1849  DNA-binding response regulator NarL  29.59 
 
 		 233 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3007  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.05 
 
 		 507 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.738719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  34.29 
 
 		 227 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2942  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28.21 
 
 		 451 aa  41.2  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1977  DNA-binding response regulator  35.94 
 
 		 229 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.166768  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3925  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.23 
 
 		 662 aa  41.6  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.150145  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3017  RcsC  31.58 
 
 		 1083 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0203  response regulator receiver  32.38 
 
 		 231 aa  41.6  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.359659 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1259  response regulator receiver protein  32.58 
 
 		 252 aa  41.6  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0242  two component LuxR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 211 aa  41.6  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000159114 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00475  two-component system sensor histidine kinase-response regulator hybridprotein  30.3 
 
 		 1364 aa  41.2  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.679058  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>