138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0737 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0737  reductive dehalogenase  100 
 
 
445 aa  935    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0132568  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0713  reductive dehalogenase  60.63 
 
 
458 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0711  reductive dehalogenase  56.24 
 
 
488 aa  532  1e-150  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.189708  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0689  reductive dehalogenase  56.7 
 
 
463 aa  513  1e-144  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3578  reductive dehalogenase  37.07 
 
 
1070 aa  189  5.999999999999999e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.960062  normal  0.192167 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3974  reductive dehalogenase  37.78 
 
 
1069 aa  186  5e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0180  reductive dehalogenase, putative  29.69 
 
 
455 aa  153  7e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_169  reductive dehalogenase  30.16 
 
 
455 aa  152  1e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.764081  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0173  reductive dehalogenase  30.07 
 
 
455 aa  147  3e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1349  reductive dehalogenase  29.65 
 
 
461 aa  139  7e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0355  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  41.18 
 
 
474 aa  130  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0343  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  40.64 
 
 
484 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0331  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  38.22 
 
 
491 aa  126  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0329  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  29.74 
 
 
640 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.48075  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2620  reductive dehalogenase  34.25 
 
 
345 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0341  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  29.89 
 
 
640 aa  120  6e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0353  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  29.89 
 
 
640 aa  120  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.200551  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1729  tetrachloroethene dehalogenase  31.75 
 
 
472 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000209595 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0696  reductive dehalogenase  36 
 
 
550 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000940573  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3769  hypothetical protein  33.89 
 
 
468 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1171  reductive dehalogenase, putative  37.65 
 
 
532 aa  113  6e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0464828  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1360  reductive dehalogenase  37.65 
 
 
532 aa  113  6e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2103  hypothetical protein  30.65 
 
 
507 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66471  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2100  tetrachloroethene dehalogenase  34.82 
 
 
474 aa  111  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0988  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.42 
 
 
532 aa  107  4e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0302  reductive dehalogenase, putative  28.21 
 
 
514 aa  107  5e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0924005  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0121  reductive dehalogenase  27.07 
 
 
514 aa  107  5e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1353  reductive dehalogenase  27.27 
 
 
514 aa  107  6e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0693  reductive dehalogenase  30.38 
 
 
352 aa  106  8e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0276  reductive dehalogenase  30.12 
 
 
523 aa  105  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_104  reductive dehalogenase  30.12 
 
 
523 aa  105  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1340  reductive dehalogenase  28.02 
 
 
480 aa  102  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2872  reductive dehalogenase  33.18 
 
 
514 aa  100  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.111424  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1314  reductive dehalogenase  26.19 
 
 
481 aa  100  7e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2870  reductive dehalogenase  33.18 
 
 
514 aa  99.8  8e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0453791  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1968  reductive dehalogenase  26.78 
 
 
399 aa  99.4  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.821094  normal  0.460125 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1263  reductive dehalogenase  25.07 
 
 
497 aa  97.8  4e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1545  reductive dehalogenase, putative  25.37 
 
 
500 aa  96.3  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0318  reductive dehalogenase, putative  29.6 
 
 
495 aa  94.7  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.82363  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4120  hypothetical protein  32.89 
 
 
489 aa  94.4  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00634153  normal  0.015035 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1387  reductive dehalogenase  31.03 
 
 
491 aa  93.6  7e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.54917  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0112  reductive dehalogenase  32.5 
 
 
506 aa  92.4  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0173  reductive dehalogenase, putative  25.42 
 
 
510 aa  92  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0306  reductive dehalogenase, putative  29.61 
 
 
505 aa  91.3  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00204473  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0876  reductive dehalogenase, putative  28.57 
 
 
510 aa  91.3  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.177849  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1538  reductive dehalogenase, putative  28.97 
 
 
492 aa  90.9  4e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.308887  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1436  reductive dehalogenase  25.6 
 
 
523 aa  90.5  6e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1393  reductive dehalogenase  29.6 
 
 
495 aa  90.1  7e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00328103  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1430  reductive dehalogenase  29.44 
 
 
492 aa  90.1  8e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0296  reductive dehalogenase  28.57 
 
 
512 aa  89.7  9e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0794176  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1344  reductive dehalogenase  29.77 
 
 
488 aa  89.4  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_88  reductive dehalogenase  28.57 
 
 
512 aa  89.7  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0079  trichloroethene reductive dehalogenase  32.12 
 
 
554 aa  87.8  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00164109  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_82  reductive dehalogenase  28.29 
 
 
474 aa  88.2  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1559  reductive dehalogenase, putative  29.96 
 
 
482 aa  87.8  4e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.206091  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1327  reductive dehalogenase  28.64 
 
 
499 aa  87  7e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1427  reductive dehalogenase  28.26 
 
 
496 aa  85.9  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1260  reductive dehalogenase  28.26 
 
 
509 aa  85.9  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1291  vinyl chloride reductive dehalogenase  28.38 
 
 
519 aa  86.3  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1522  reductive dehalogenase, putative  29.79 
 
 
507 aa  85.1  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.664066  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1402  reductive dehalogenase  27.65 
 
 
499 aa  84.3  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00204674  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1421  reductive dehalogenase  28.19 
 
 
475 aa  83.2  0.000000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.809751  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1324  reductive dehalogenase  22.87 
 
 
493 aa  81.6  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0687887  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1399  reductive dehalogenase  26.29 
 
 
494 aa  81.3  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0618677  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1528  reductive dehalogenase, putative  28.85 
 
 
469 aa  80.1  0.00000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.636917  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1316  reductive dehalogenase  25.77 
 
 
494 aa  80.1  0.00000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1535  reductive dehalogenase, putative  24.23 
 
 
494 aa  79.7  0.00000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0185962  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1329  reductive dehalogenase  28.18 
 
 
473 aa  79  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0284  reductive dehalogenase  25.32 
 
 
496 aa  75.9  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0235  reductive dehalogenase, putative  27.98 
 
 
490 aa  75.9  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0311  reductive dehalogenase, putative  27.86 
 
 
515 aa  75.5  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_96  reductive dehalogenase  25.6 
 
 
496 aa  75.5  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0104  reductive dehalogenase  27.88 
 
 
515 aa  75.1  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1336  reductive dehalogenase  25.6 
 
 
496 aa  75.5  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1378  reductive dehalogenase  28.8 
 
 
508 aa  74.7  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1364  reductive dehalogenase  28.33 
 
 
518 aa  74.3  0.000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1320  reductive dehalogenase  27.8 
 
 
509 aa  72.4  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1371  reductive dehalogenase  30.08 
 
 
505 aa  72  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1383  reductive dehalogenase  29.55 
 
 
505 aa  72  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1375  reductive dehalogenase  28.07 
 
 
505 aa  70.5  0.00000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0119  reductive dehalogenase  26.46 
 
 
480 aa  68.9  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0281  reductive dehalogenase  27.84 
 
 
470 aa  66.6  0.0000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1519  reductive dehalogenase, putative  26.94 
 
 
505 aa  66.6  0.0000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.639229  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1342  reductive dehalogenase  27.45 
 
 
473 aa  65.9  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_99  reductive dehalogenase  26.32 
 
 
470 aa  64.7  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1308  reductive dehalogenase  30.15 
 
 
149 aa  65.1  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1347  reductive dehalogenase  30 
 
 
429 aa  63.5  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0088  reductive dehalogenase domain-containing protein  27.69 
 
 
153 aa  63.5  0.000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0721794  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0117  hypothetical protein  36.36 
 
 
105 aa  61.2  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1046  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 
263 aa  60.8  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0847  reductive dehalogenase  24.27 
 
 
516 aa  58.2  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1302  iron-sulfur cluster binding protein, putative  27.1 
 
 
373 aa  53.5  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1910  putative iron-sulfur cluster binding protein  33.33 
 
 
375 aa  50.1  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263925  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1944  putative iron-sulfur cluster binding protein  33.33 
 
 
375 aa  50.1  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.331429  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1404  iron-sulfur cluster-binding protein  27.63 
 
 
308 aa  50.1  0.00008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1327  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.64 
 
 
227 aa  50.1  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2530  4Fe-4S cluster binding  26.57 
 
 
385 aa  49.3  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0304  iron-sulfur cluster binding protein  26.83 
 
 
326 aa  49.3  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000115389  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1520  4Fe-4S ferredoxin protein  26.71 
 
 
438 aa  48.5  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0107493  normal  0.24299 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4033  iron-sulfur cluster binding protein  30.09 
 
 
306 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.941411 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>