92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1250 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1250  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 		 345 aa  669    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.738804  normal  0.817659 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0843  TPR repeat-containing protein  33.12 
 
 		 330 aa  123  5e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0942  cytochrome c class I  31.49 
 
 		 329 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.240089 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  35.64 
 
 		 465 aa  56.2  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  31.34 
 
 		 878 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  24.27 
 
 		 1737 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.86 
 
 		 810 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0246  cytochrome c class I  38.67 
 
 		 251 aa  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0314  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  41.54 
 
 		 421 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0237  cytochrome c oxidase, subunit II  43.94 
 
 		 418 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0206186 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0261  cytochrome c oxidase subunit II  41.54 
 
 		 422 aa  51.2  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.814908 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0218  cytochrome c oxidase, subunit II  43.94 
 
 		 418 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2545  putative cytochrome c  37.66 
 
 		 350 aa  50.8  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3796  tetratricopeptide TPR_2  32.33 
 
 		 385 aa  50.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.367432  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0362  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor (cytochrome AA3 subunit 2) transmembrane protein  50.98 
 
 		 390 aa  51.2  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.934147 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2351  hypothetical protein  27.78 
 
 		 395 aa  50.4  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.212242  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.44 
 
 		 632 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0159  cytochrome c class I  33.04 
 
 		 120 aa  50.4  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  27.87 
 
 		 729 aa  49.7  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3134  cytochrome c class I  35.8 
 
 		 311 aa  48.9  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  31.09 
 
 		 567 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04013  Cytochrome c oxidase, subunit II  44.07 
 
 		 387 aa  48.5  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.94805  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0544  cytochrome c oxidase, subunit II  39.39 
 
 		 544 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0856  sugar transporter superfamily protein  29.23 
 
 		 198 aa  48.5  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  29.87 
 
 		 1276 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2187  TPR repeat-containing protein  31.2 
 
 		 571 aa  47.8  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4390  hypothetical protein  36.49 
 
 		 110 aa  47.8  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828991 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2704  Quinoprotein glucose dehydrogenase  34.21 
 
 		 731 aa  47  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0276  cytochrome c oxidase, subunit II  39.44 
 
 		 557 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.79 
 
 		 364 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1903  hypothetical protein  43.94 
 
 		 110 aa  47  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.172183  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5322  cytochrome c class I  28.05 
 
 		 346 aa  47  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0021785  normal  0.0885214 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  35.19 
 
 		 739 aa  47  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3190  cytochrome c class I  41.67 
 
 		 111 aa  46.6  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  37.37 
 
 		 703 aa  46.2  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3172  nitrite reductase protein N  41.1 
 
 		 517 aa  46.2  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.854794 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2356  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.58 
 
 		 359 aa  46.2  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.337618  normal  0.0354802 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4171  putative cytochrome c oxidase  37.88 
 
 		 538 aa  46.2  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.82291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.83 
 
 		 836 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0311  Pyrrolo-quinoline quinone  40.85 
 
 		 705 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.394174 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0178  cytochrome c oxidase, subunit II  43.48 
 
 		 513 aa  45.8  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4615  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.68 
 
 		 1402 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2450  PQQ-dependent enzyme-like protein  39.13 
 
 		 718 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  32.35 
 
 		 892 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 4079 aa  45.4  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  26.45 
 
 		 1979 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4580  photosystem I assembly protein Ycf3  33.33 
 
 		 182 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4246  cytochrome c oxidase, subunit II  40.58 
 
 		 384 aa  45.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  25.49 
 
 		 366 aa  45.8  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1021  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c subunit  29.66 
 
 		 307 aa  45.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.121328  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  24.62 
 
 		 1421 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1633  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.52 
 
 		 358 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000383939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0995  tetratricopeptide TPR_2  27.18 
 
 		 614 aa  45.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129848  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1940  cytochrome c oxidase, subunit II  34.62 
 
 		 385 aa  45.1  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0684443  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5000  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.45 
 
 		 749 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.652472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1132  PQQ-dependent enzyme-like protein  37.68 
 
 		 701 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0946665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  22.61 
 
 		 311 aa  44.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0659  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 2651 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3005  cytochrome c class I  44.68 
 
 		 110 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000505825  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1422  hypothetical protein  33.33 
 
 		 177 aa  44.3  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000667886  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2393  TPR repeat-containing protein  30.46 
 
 		 293 aa  44.3  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00681412  hitchhiker  0.000021772 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  35.19 
 
 		 739 aa  44.3  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16849  predicted protein  30.58 
 
 		 483 aa  44.3  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.27107  normal  0.13635 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.97 
 
 		 557 aa  44.3  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.45 
 
 		 363 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0317  cytochrome c, class I  37.04 
 
 		 285 aa  43.9  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00320646 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3662  cytochrome c class I  30.23 
 
 		 124 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  26.9 
 
 		 1297 aa  43.9  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.45 
 
 		 363 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  30.7 
 
 		 708 aa  43.9  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  32.24 
 
 		 615 aa  43.9  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1125  TPR domain-containing protein  31.68 
 
 		 457 aa  43.9  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1583  cytochrome c class I  31.11 
 
 		 152 aa  43.5  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.889837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0258  cytochrome c oxidase, subunit II  38.16 
 
 		 528 aa  43.5  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  30.17 
 
 		 265 aa  43.9  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2961  cytochrome c, class I  38.46 
 
 		 108 aa  43.5  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.428474  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  26.28 
 
 		 808 aa  43.1  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3483  cytochrome c oxidase, subunit II  39.13 
 
 		 520 aa  43.1  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.243767 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1645  cytochrome c oxidase, subunit II  31.71 
 
 		 385 aa  43.5  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.856042  normal  0.904416 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5895  beta-lactamase  31.34 
 
 		 496 aa  43.1  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3999  cytochrome c oxidase subunit II  40.58 
 
 		 524 aa  43.1  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3814  TPR repeat-containing protein  26.45 
 
 		 615 aa  42.7  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  37.25 
 
 		 620 aa  43.1  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1478  cytochrome CytM  30.67 
 
 		 145 aa  43.1  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.611234 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  30.16 
 
 		 550 aa  42.7  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1093  cytochrome c, class I  40 
 
 		 98 aa  42.7  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.364636 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2717  cytochrome c oxidase, subunit II  32.97 
 
 		 523 aa  42.7  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.977219  normal  0.293993 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  38.78 
 
 		 662 aa  42.7  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  30.85 
 
 		 1085 aa  42.7  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2847  cytochrome c oxidase, subunit II  35.38 
 
 		 532 aa  42.7  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0219  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  36.46 
 
 		 964 aa  42.7  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.205054 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2858  cytochrome c oxidase, subunit II  35.38 
 
 		 532 aa  42.7  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.760436 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>