212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3991 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3991  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 264 aa  548  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0793051  normal  0.868422 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5639  alpha/beta hydrolase fold protein  38.52 
 
 		 269 aa  177  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 267 aa  123  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2805  alpha/beta fold family hydrolase  29.03 
 
 		 278 aa  108  6e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.698693 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  36.02 
 
 		 350 aa  67.8  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  38.33 
 
 		 340 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  38.36 
 
 		 341 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 		 350 aa  65.5  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  25.81 
 
 		 314 aa  65.1  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  37.07 
 
 		 340 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  37.07 
 
 		 340 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  37.07 
 
 		 340 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  30.54 
 
 		 361 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  36.21 
 
 		 340 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.4 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3939  Alpha/beta hydrolase fold  24.63 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  35.45 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  23.35 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0200  alpha/beta hydrolase fold protein  22.95 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3372  alpha/beta hydrolase fold protein  30.28 
 
 		 287 aa  55.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000420005  normal  0.0275463 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  25.57 
 
 		 279 aa  53.9  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  33.93 
 
 		 322 aa  53.1  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  28.69 
 
 		 290 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  31.25 
 
 		 333 aa  52.8  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2149  alpha/beta hydrolase fold  25.11 
 
 		 227 aa  53.1  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 		 295 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  25.79 
 
 		 278 aa  52.4  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  29.17 
 
 		 298 aa  52.4  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0538  alpha/beta hydrolase fold  32.71 
 
 		 299 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.282885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3816  alpha/beta hydrolase fold  31.86 
 
 		 257 aa  52.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.75 
 
 		 369 aa  51.6  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0309  alpha/beta hydrolase fold  30.53 
 
 		 262 aa  51.6  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3368  alpha/beta hydrolase fold protein  30.36 
 
 		 326 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 		 316 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1109  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 248 aa  51.2  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00126644  hitchhiker  0.00394602 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1679  alpha/beta hydrolase fold  31.78 
 
 		 299 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5609  alpha/beta hydrolase fold  31.78 
 
 		 299 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1708  alpha/beta hydrolase fold  31.78 
 
 		 299 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0456043  normal  0.790109 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1652  alpha/beta hydrolase fold  31.78 
 
 		 299 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0545  alpha/beta hydrolase fold  31.78 
 
 		 299 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0627  alpha/beta hydrolase fold  31.78 
 
 		 299 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2455  3-oxoadipate enol-lactonase  24.9 
 
 		 270 aa  50.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.2187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1788  alpha/beta hydrolase fold protein  24.74 
 
 		 279 aa  50.4  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0842408  hitchhiker  0.00140329 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 272 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.7 
 
 		 372 aa  50.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2062  3-oxoadipate enol-lactonase  24.24 
 
 		 270 aa  50.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  34.38 
 
 		 271 aa  49.7  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8659  alpha/beta hydrolase fold protein  23.05 
 
 		 266 aa  49.7  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6084  hydrolase  28.44 
 
 		 278 aa  49.7  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  25.62 
 
 		 250 aa  49.7  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  32.94 
 
 		 284 aa  49.3  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9504  alpha/beta hydrolase protein  35.14 
 
 		 272 aa  49.3  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.932687  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  28.32 
 
 		 266 aa  49.3  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  32.94 
 
 		 284 aa  49.3  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54974  hydrolase  27.27 
 
 		 494 aa  49.3  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  24.34 
 
 		 265 aa  48.9  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2479  alpha/beta hydrolase fold  31.68 
 
 		 277 aa  48.9  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  32.94 
 
 		 284 aa  48.9  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0646  alpha/beta hydrolase fold protein  32.63 
 
 		 265 aa  48.5  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.67 
 
 		 370 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  29.66 
 
 		 322 aa  48.5  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  27.12 
 
 		 380 aa  48.5  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  23.72 
 
 		 275 aa  48.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0351  alpha/beta hydrolase fold  22.35 
 
 		 275 aa  48.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.347807 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2314  alpha/beta hydrolase fold  26.51 
 
 		 270 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.75454  normal  0.0695894 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  19.84 
 
 		 287 aa  48.5  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2120  alpha/beta hydrolase fold protein  28.33 
 
 		 437 aa  48.1  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  32.71 
 
 		 339 aa  48.5  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5045  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 325 aa  47.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6879  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  28.78 
 
 		 328 aa  47.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  21.3 
 
 		 280 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3210  alpha/beta hydrolase fold protein  23.75 
 
 		 271 aa  47.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.45774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  23.28 
 
 		 276 aa  47.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  28.83 
 
 		 226 aa  47  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3293  alpha/beta hydrolase fold  28.7 
 
 		 323 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104393  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8642  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  26.27 
 
 		 321 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3177  Alpha/beta hydrolase fold-1  28.57 
 
 		 272 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.97494  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3567  alpha/beta hydrolase fold  28.44 
 
 		 328 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253365  hitchhiker  0.00645223 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5440  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 		 299 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.341918 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5837  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 		 316 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3987  alpha/beta hydrolase fold  29.81 
 
 		 298 aa  47  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136743  normal  0.0524037 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03823  Alpha/beta hydrolase fold protein  23.84 
 
 		 310 aa  47  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3207  alpha/beta fold family hydrolase  25.68 
 
 		 271 aa  46.6  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.39974  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  20.91 
 
 		 263 aa  46.6  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  23.71 
 
 		 287 aa  47  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3606  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 265 aa  46.6  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 		 311 aa  46.6  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1163  alpha/beta hydrolase fold protein  23.39 
 
 		 296 aa  46.6  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0831  alpha/beta hydrolase fold  28.81 
 
 		 269 aa  46.6  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.37854  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2524  alpha/beta hydrolase fold  31.36 
 
 		 298 aa  46.2  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3841  alpha/beta hydrolase fold  27.88 
 
 		 267 aa  46.6  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.819174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  27.93 
 
 		 323 aa  46.2  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3768  alpha/beta hydrolase fold  30.1 
 
 		 267 aa  45.8  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2194  alpha/beta hydrolase fold  31.78 
 
 		 258 aa  45.8  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000635452  unclonable  0.000004336 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.83 
 
 		 370 aa  46.2  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5411  alpha/beta hydrolase fold  29.36 
 
 		 328 aa  45.8  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.33 
 
 		 371 aa  45.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2740  alpha/beta hydrolase fold  25.22 
 
 		 294 aa  45.8  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3966  alpha/beta hydrolase fold  32.93 
 
 		 267 aa  45.8  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0919  alpha/beta hydrolase fold  24.64 
 
 		 320 aa  45.8  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.495242  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>