232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5639 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5639  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 269 aa  550  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3991  alpha/beta hydrolase fold protein  38.52 
 
 		 264 aa  177  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0793051  normal  0.868422 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  33.46 
 
 		 267 aa  142  8e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2805  alpha/beta fold family hydrolase  27.13 
 
 		 278 aa  122  6e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.698693 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  33.08 
 
 		 340 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 		 340 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 		 340 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 		 340 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  30.5 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.17 
 
 		 369 aa  62.4  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  32.79 
 
 		 341 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 		 340 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  36.44 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  28.88 
 
 		 350 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  31.71 
 
 		 361 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  29.7 
 
 		 314 aa  57  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  24.62 
 
 		 372 aa  56.2  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  28.95 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  27.11 
 
 		 279 aa  55.5  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1679  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 		 299 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5609  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 		 299 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1708  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 		 299 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0456043  normal  0.790109 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  24.86 
 
 		 290 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1652  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 		 299 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0545  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 		 299 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0627  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 		 299 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 302 aa  53.9  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1079  alpha/beta hydrolase fold  26.05 
 
 		 283 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.622662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 		 295 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  29.66 
 
 		 281 aa  54.7  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_003296  RS01917  putative hydrolase protein  29.03 
 
 		 305 aa  53.5  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.602694  normal  0.0615168 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.19 
 
 		 370 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  29.57 
 
 		 272 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  29.73 
 
 		 277 aa  53.5  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 		 272 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5837  alpha/beta hydrolase fold  26.95 
 
 		 316 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0538  alpha/beta hydrolase fold  28.12 
 
 		 299 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.282885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22060  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  34.51 
 
 		 262 aa  52.8  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00549421  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5440  alpha/beta hydrolase fold  26.95 
 
 		 299 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.341918 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  32.38 
 
 		 309 aa  52.8  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 		 267 aa  52.8  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  29.37 
 
 		 350 aa  52.4  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1023  alpha/beta family hydrolase  29.17 
 
 		 287 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03823  Alpha/beta hydrolase fold protein  32.46 
 
 		 310 aa  52  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  24.19 
 
 		 291 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  24.19 
 
 		 291 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  24.19 
 
 		 291 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5552  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.48 
 
 		 370 aa  50.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.077135  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6488  Alpha/beta hydrolase  23.16 
 
 		 271 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04395  hydrolase, alpha/beta fold family protein  31.31 
 
 		 263 aa  50.8  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.681804  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0269  hypothetical protein  32.37 
 
 		 293 aa  50.8  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2165  alpha/beta hydrolase fold protein  25.27 
 
 		 255 aa  51.2  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0537  dihydrolipoamide acetyltransferase, putative  27.01 
 
 		 292 aa  50.4  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.169084  normal  0.40861 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.91 
 
 		 370 aa  50.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0351  alpha/beta hydrolase fold  25.2 
 
 		 275 aa  50.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.347807 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  25.99 
 
 		 302 aa  50.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  30.33 
 
 		 333 aa  50.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  23.57 
 
 		 287 aa  50.1  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0871  alpha/beta fold family hydrolase  27 
 
 		 285 aa  50.1  0.00004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0195486  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 		 258 aa  50.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1579  alpha/beta fold family hydrolase  26.72 
 
 		 265 aa  49.7  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  27.41 
 
 		 288 aa  49.7  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.2 
 
 		 371 aa  49.7  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  29.52 
 
 		 312 aa  49.7  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  31.43 
 
 		 226 aa  49.7  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  30.23 
 
 		 280 aa  49.7  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  28.93 
 
 		 312 aa  49.3  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3972  alpha/beta hydrolase fold  35.04 
 
 		 261 aa  49.3  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3762  alpha/beta hydrolase fold  26.96 
 
 		 260 aa  49.3  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.543729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 		 311 aa  49.3  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  29.91 
 
 		 300 aa  48.9  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  29.91 
 
 		 300 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  29.91 
 
 		 300 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  29.91 
 
 		 300 aa  48.9  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  31.86 
 
 		 259 aa  48.9  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  30.08 
 
 		 275 aa  48.9  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  30.77 
 
 		 300 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 		 298 aa  48.5  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2433  hypothetical protein  31.5 
 
 		 306 aa  48.5  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.94 
 
 		 371 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4195  alpha/beta hydrolase fold protein  29.75 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.94 
 
 		 371 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4241  hydrolase, alpha/beta fold family  29.06 
 
 		 290 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0213697  hitchhiker  0.0000000245564 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  30.91 
 
 		 273 aa  47.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3368  alpha/beta hydrolase fold protein  29.82 
 
 		 326 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  29.06 
 
 		 300 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  27.85 
 
 		 309 aa  47.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5471  alpha/beta hydrolase fold protein  29.82 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3313  3-Oxoadipate enol-lactonase  29.06 
 
 		 300 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  25.15 
 
 		 286 aa  47.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  28.79 
 
 		 273 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0471  alpha/beta hydrolase fold protein  32.48 
 
 		 267 aa  47.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3372  alpha/beta hydrolase fold protein  31.19 
 
 		 287 aa  47.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000420005  normal  0.0275463 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 		 283 aa  47.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1808  hypothetical protein  33.33 
 
 		 219 aa  47  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1057  hydrolase, alpha/beta fold family  29.06 
 
 		 290 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000161202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>