More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3811 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3811  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 		 629 aa  1304    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0481  DNA mismatch repair protein MutL  49.85 
 
 		 623 aa  635    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.324517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5569  DNA mismatch repair protein MutL  56.14 
 
 		 685 aa  763    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.590077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0014  DNA mismatch repair protein  52.04 
 
 		 610 aa  691    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1174  hypothetical protein  47.15 
 
 		 628 aa  587  1e-166  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0643431 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0821  DNA mismatch repair protein MutL  47.08 
 
 		 630 aa  580  1e-164  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000117941  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07070  putative DNA mismatch repair protein  44.71 
 
 		 617 aa  570  1e-161  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.748012  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  43.99 
 
 		 608 aa  558  1e-158  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0211  DNA mismatch repair protein MutL  42.94 
 
 		 644 aa  553  1e-156  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2145  DNA mismatch repair protein MutL  41.28 
 
 		 612 aa  501  1e-140  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000372508  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0412  DNA mismatch repair protein MutL  39.59 
 
 		 618 aa  460  9.999999999999999e-129  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0145  DNA mismatch repair protein  36.53 
 
 		 644 aa  444  1e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1981  DNA mismatch repair protein  36.12 
 
 		 626 aa  427  1e-118  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0172  DNA mismatch repair protein MutL  35.82 
 
 		 624 aa  422  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0267  DNA mismatch repair protein MutL  35.57 
 
 		 622 aa  414  1e-114  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000997696 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0302  DNA mismatch repair protein MutL  35.41 
 
 		 624 aa  414  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000565974  hitchhiker  0.00985332 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2701  DNA mismatch repair protein MutL  34.52 
 
 		 626 aa  412  1e-113  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00383046  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2328  DNA mismatch repair protein MutL  34.78 
 
 		 629 aa  412  1e-113  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1696  DNA mismatch repair protein MutL  32.68 
 
 		 665 aa  358  1.9999999999999998e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930861  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  33.07 
 
 		 632 aa  353  8e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1612  DNA mismatch repair protein  33.7 
 
 		 614 aa  347  5e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.235254  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  32.24 
 
 		 641 aa  345  2e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  33.49 
 
 		 628 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  33.43 
 
 		 647 aa  339  7e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  31.7 
 
 		 622 aa  335  1e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1838  DNA mismatch repair protein MutL  30.99 
 
 		 692 aa  335  1e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0019765  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2420  DNA mismatch repair protein  32.62 
 
 		 649 aa  334  3e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323655  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  31.91 
 
 		 639 aa  334  3e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  31.53 
 
 		 644 aa  334  3e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  33.17 
 
 		 615 aa  333  4e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  32.13 
 
 		 629 aa  333  5e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3802  DNA mismatch repair protein  32.25 
 
 		 647 aa  332  1e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.618994  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3282  DNA mismatch repair protein  33.54 
 
 		 650 aa  332  1e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3815  DNA mismatch repair protein  32.41 
 
 		 647 aa  332  1e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  32.64 
 
 		 606 aa  332  2e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3780  DNA mismatch repair protein  32.41 
 
 		 647 aa  332  2e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0217989 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1172  DNA mismatch repair protein  33.14 
 
 		 674 aa  331  2e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3867  DNA mismatch repair protein  32.41 
 
 		 647 aa  331  2e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3527  DNA mismatch repair protein  32.41 
 
 		 647 aa  330  3e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  32.59 
 
 		 559 aa  330  5.0000000000000004e-89  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  31.85 
 
 		 605 aa  330  6e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3853  DNA mismatch repair protein  32.61 
 
 		 661 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558268  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3539  DNA mismatch repair protein  31.64 
 
 		 644 aa  329  1.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3509  DNA mismatch repair protein  31.94 
 
 		 647 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  33.54 
 
 		 612 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1487  DNA mismatch repair protein MutL  32.97 
 
 		 622 aa  328  2.0000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.101291  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2098  DNA mismatch repair protein  32.22 
 
 		 659 aa  328  3e-88  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2380  DNA mismatch repair protein MutL  31.03 
 
 		 695 aa  327  3e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1432  DNA mismatch repair protein  32.25 
 
 		 647 aa  327  5e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.980701 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1823  DNA mismatch repair protein MutL  32.49 
 
 		 628 aa  327  5e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000270616  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3617  DNA mismatch repair protein  32.04 
 
 		 626 aa  326  6e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.552847  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3904  DNA mismatch repair protein  32.04 
 
 		 626 aa  326  6e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595251  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0660  DNA mismatch repair protein  32 
 
 		 661 aa  326  7e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0281  DNA mismatch repair protein  32.25 
 
 		 667 aa  326  9e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0765  DNA mismatch repair protein  32.25 
 
 		 667 aa  326  9e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  31.74 
 
 		 608 aa  325  1e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1884  DNA mismatch repair protein  32.88 
 
 		 640 aa  325  1e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2621  DNA mismatch repair protein  32.22 
 
 		 662 aa  325  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1320  DNA mismatch repair protein  32.46 
 
 		 705 aa  324  2e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1203  DNA mismatch repair protein  33.23 
 
 		 619 aa  325  2e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288753  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0685  DNA mismatch repair protein  31.69 
 
 		 661 aa  325  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  31.88 
 
 		 613 aa  324  3e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0072  DNA mismatch repair protein  32.14 
 
 		 647 aa  323  7e-87  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  32.02 
 
 		 632 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  31.85 
 
 		 632 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  31.85 
 
 		 633 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  30.96 
 
 		 630 aa  321  1.9999999999999998e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0750  DNA mismatch repair protein  31.33 
 
 		 687 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.536316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  31.65 
 
 		 602 aa  320  3.9999999999999996e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4044  DNA mismatch repair protein MutL  32.09 
 
 		 628 aa  320  3.9999999999999996e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816003  normal  0.310643 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2485  DNA mismatch repair protein  31.7 
 
 		 691 aa  320  5e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3934  DNA mismatch repair protein  31.47 
 
 		 688 aa  320  5e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000834702 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  32.56 
 
 		 631 aa  320  5e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  33.28 
 
 		 611 aa  320  6e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1924  DNA mismatch repair protein MutL  34.89 
 
 		 560 aa  320  6e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  31.8 
 
 		 616 aa  318  1e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  31.51 
 
 		 601 aa  318  2e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0023  DNA mismatch repair protein MutL  30.85 
 
 		 621 aa  317  3e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000493473  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0993  DNA mismatch repair protein  31.31 
 
 		 589 aa  317  3e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.139394  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  32.5 
 
 		 620 aa  317  3e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  30.84 
 
 		 647 aa  317  5e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1359  DNA mismatch repair protein  32.05 
 
 		 674 aa  316  6e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.52416  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  31.24 
 
 		 623 aa  316  9e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0864  DNA mismatch repair protein  30.69 
 
 		 645 aa  316  9.999999999999999e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23826  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3308  DNA mismatch repair protein  32.47 
 
 		 681 aa  316  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.554472  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  31.15 
 
 		 603 aa  316  9.999999999999999e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  31.65 
 
 		 602 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0571  DNA mismatch repair protein MutL  31.34 
 
 		 636 aa  315  1.9999999999999998e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.707368  hitchhiker  0.00000000963067 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  31.36 
 
 		 633 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  32.34 
 
 		 636 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3264  DNA mismatch repair protein  32.26 
 
 		 681 aa  314  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.815986  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0514  DNA mismatch repair protein  32.32 
 
 		 684 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2314  DNA mismatch repair protein  32.32 
 
 		 684 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1085  DNA mismatch repair protein  32.32 
 
 		 684 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2192  DNA mismatch repair protein  32.32 
 
 		 684 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3297  DNA mismatch repair protein  32.32 
 
 		 684 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.365803  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  31.2 
 
 		 633 aa  313  6.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2096  DNA mismatch repair protein  33.85 
 
 		 630 aa  312  1e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  31.71 
 
 		 645 aa  312  1e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  31.59 
 
 		 652 aa  311  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>