More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2833 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2833  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2771  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  53.33 
 
 		 203 aa  188  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.56 
 
 		 204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29100  hypothetical protein  38.34 
 
 		 204 aa  123  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136638 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0717  lysine exporter protein LysE/YggA  34.31 
 
 		 204 aa  121  6e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3987  hypothetical protein  37.82 
 
 		 204 aa  122  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.71 
 
 		 204 aa  121  9e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3644  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.97 
 
 		 204 aa  119  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0596  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.76 
 
 		 230 aa  118  7e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0782  LysE family translocator protein  36.41 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.492943  normal  0.203666 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3581  lysine exporter protein LysE/YggA  35.87 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3452  LysE family translocator protein  35.87 
 
 		 204 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2069  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.42 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0732  lysine exporter protein LysE/YggA  33.49 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831174 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2833  amino acid transporter LysE  36.31 
 
 		 208 aa  97.8  9e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.318432  normal  0.661514 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0962  lysine exporter protein LysE/YggA  38.31 
 
 		 204 aa  97.4  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.55802  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3692  lysine exporter protein (LysE/YggA)  33.65 
 
 		 218 aa  95.9  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3076  lysine exporter protein LysE/YggA  38.41 
 
 		 204 aa  95.1  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1064  lysine exporter protein LysE/YggA  37.66 
 
 		 204 aa  95.5  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150207  normal  0.873963 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1031  lysine exporter protein LysE/YggA  37.66 
 
 		 204 aa  95.5  6e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0778058  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2495  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.71 
 
 		 211 aa  95.1  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000331121  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  29.53 
 
 		 209 aa  95.1  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6528  lysine exporter protein LysE/YggA  33.73 
 
 		 205 aa  94.7  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1060  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.42 
 
 		 209 aa  95.1  8e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.741251  normal  0.078929 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3328  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.01 
 
 		 204 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.740014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3991  lysine exporter protein LysE/YggA  35.8 
 
 		 204 aa  93.6  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.1147  normal  0.39027 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5352  lysine exporter protein LysE/YggA  32.86 
 
 		 204 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1110  RhtB family transporter  27.54 
 
 		 209 aa  92  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0890  lysine exporter protein LysE/YggA  35.71 
 
 		 204 aa  91.7  7e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3132  lysine exporter protein LysE/YggA  35.71 
 
 		 204 aa  91.7  7e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0792555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3224  lysine exporter protein LysE/YggA  35.71 
 
 		 204 aa  91.7  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0632575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7469  lysine exporter protein LysE/YggA  32.16 
 
 		 205 aa  90.5  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.67 
 
 		 205 aa  90.5  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0391  hypothetical protein  32.2 
 
 		 204 aa  90.1  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2230  hypothetical protein  33.5 
 
 		 204 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5694  lysine exporter protein LysE/YggA  32.75 
 
 		 205 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1435  amino acid transporter LysE  28.43 
 
 		 210 aa  89.7  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.410501  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3657  amino acid transporter LysE  35.06 
 
 		 229 aa  89.4  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0699  amino acid transporter LysE  31.58 
 
 		 204 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0691811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000550  putative threonine efflux protein  33.33 
 
 		 204 aa  89.4  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1256  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.54 
 
 		 205 aa  89  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  30.43 
 
 		 203 aa  89  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.955446 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3488  lysine exporter protein LysE/YggA  33.15 
 
 		 223 aa  88.6  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3344  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.09 
 
 		 210 aa  88.2  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240621 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26160  hypothetical protein  32.06 
 
 		 204 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.519724  normal  0.19854 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02483  hypothetical protein  31.63 
 
 		 209 aa  87  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2500  lysine exporter protein LysE/YggA  34.13 
 
 		 213 aa  87.4  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106725  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2828  lysine exporter protein LysE/YggA  34.45 
 
 		 202 aa  86.7  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.192947  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4719  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.12 
 
 		 212 aa  86.3  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3404  lysine exporter protein LysE/YggA  31.55 
 
 		 211 aa  86.3  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  37.96 
 
 		 210 aa  86.3  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1798  amino acid transport protein, LysE type  33.08 
 
 		 213 aa  85.5  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2796  lysine exporter protein LysE/YggA  26.77 
 
 		 214 aa  85.9  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1800  threonine efflux protein, putative  25.5 
 
 		 212 aa  85.1  8e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2183  lysine exporter protein LysE/YggA  35.48 
 
 		 200 aa  84.7  9e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1071  putative RhtB protein  32.12 
 
 		 212 aa  84.7  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  39.13 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  37.96 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0936  lysine exporter protein LysE/YggA  30.15 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.950459  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  36.96 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5674  lysine exporter protein LysE/YggA  31.01 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3094  lysine exporter protein LysE/YggA  35.66 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  36.96 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6038  lysine exporter protein LysE/YggA  31.01 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2276  amino acid transporter  34.19 
 
 		 220 aa  83.6  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1757  lysine exporter protein LysE/YggA  25.96 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.290271  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3318  lysine exporter protein LysE/YggA  39.74 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.3253  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  38.64 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0372  lysine exporter protein LysE/YggA  32.8 
 
 		 217 aa  82.8  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.83228  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4224  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.29 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.59284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1462  lysine exporter protein LysE/YggA  31.88 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0974  lysine exporter protein LysE/YggA  35.57 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.253527  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2572  hypothetical protein  28.49 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1641  lysine exporter protein LysE/YggA  31.67 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.950543  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.55 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0078  amino acid efflux protein  25.13 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0243  threonine efflux system  30.92 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.569169  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2930  lysine exporter protein LysE/YggA  35.66 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000123984  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.64 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3551  lysine exporter protein LysE/YggA  36.99 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2416  RhtB family transporter  36.36 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2059  lysine exporter protein LysE/YggA  33.92 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1920  amino acid transporter LysE  30.2 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1213  hypothetical protein  30 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1219  hypothetical protein  29.17 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1849  amino acid transporter LysE  30.2 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.402974  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.85 
 
 		 208 aa  81.3  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1925  putative homoserine/threonine efflux protein  28.8 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82308e-38 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1150  amino acid transporter LysE  32.89 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2977  amino acid transporter LysE  27.8 
 
 		 228 aa  80.1  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2194  homoserine/threonine efflux protein  29.7 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2131  homoserine/threonine efflux protein  29.7 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000187844  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2117  homoserine/threonine efflux protein  29.7 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.045272  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4247  putative homoserine/threonine efflux protein  28.5 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000239469 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3142  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.05 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0269907  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2355  homoserine/threonine efflux protein  29.7 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  36.76 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2374  putative homoserine/threonine efflux protein  29.7 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2939  lysine exporter protein LysE/YggA  30.73 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2459  lysine exporter protein LysE/YggA  29.3 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.593208  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>