More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2381 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2381  acriflavin resistance protein D  100 
 
 		 1092 aa  2205    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.422424  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6349  acriflavin resistance protein  42.02 
 
 		 1064 aa  803    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.945315 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0835  acriflavin resistance protein  63.99 
 
 		 1042 aa  1352    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.181435  normal  0.546259 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0917  acriflavin resistance protein  45.09 
 
 		 1054 aa  799    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2405  acriflavin resistance protein  36.84 
 
 		 1051 aa  625  1e-177  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4375  acriflavin resistance protein  33.72 
 
 		 1038 aa  589  1e-166  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000150121  normal  0.679218 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4767  acriflavin resistance protein  33.53 
 
 		 1037 aa  586  1e-166  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.300742  unclonable  0.0000000523741 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0044  acriflavin resistance protein  34.11 
 
 		 1036 aa  580  1e-164  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1961  AcrB/AcrD/AcrF family protein  35.78 
 
 		 1038 aa  578  1.0000000000000001e-163  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0104  acriflavin resistance protein  34.1 
 
 		 1056 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4289  acriflavin resistance protein  33.87 
 
 		 1055 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0140  acriflavin resistance protein  33.66 
 
 		 1026 aa  566  1.0000000000000001e-159  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4429  acriflavin resistance protein  34.06 
 
 		 1059 aa  561  1e-158  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1475  acriflavin resistance protein  32.98 
 
 		 1027 aa  561  1e-158  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.521845  normal  0.0685081 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3726  acriflavin resistance protein  35.5 
 
 		 1061 aa  557  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.226552 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3672  acriflavin resistance protein  35.59 
 
 		 1061 aa  559  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3430  acriflavin resistance protein  34.2 
 
 		 1037 aa  558  1e-157  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0111  acriflavin resistance protein  34.71 
 
 		 1059 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2667  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.79 
 
 		 1035 aa  525  1e-147  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  30.64 
 
 		 1011 aa  431  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  29.59 
 
 		 1050 aa  418  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2382  acriflavin resistance protein  29.28 
 
 		 1083 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1648  acriflavin resistance protein  29.85 
 
 		 1082 aa  414  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  29.25 
 
 		 1034 aa  413  1e-114  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01735  RND family efflux transporter  29.22 
 
 		 1035 aa  409  1.0000000000000001e-112  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1829  acriflavin resistance protein  29.56 
 
 		 1086 aa  404  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0794172  normal  0.266022 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2193  acriflavin resistance protein  29.01 
 
 		 1095 aa  405  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  28.65 
 
 		 1043 aa  404  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2522  acriflavin resistance protein  29.37 
 
 		 1085 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1829  acriflavin resistance protein  29.46 
 
 		 1085 aa  403  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00817457  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2515  acriflavin resistance protein  29.37 
 
 		 1085 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0795793  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2635  acriflavin resistance protein  29.37 
 
 		 1085 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1882  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.3 
 
 		 1031 aa  397  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2337  acriflavin resistance protein  28.34 
 
 		 1031 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120926  hitchhiker  0.000298899 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2409  acriflavin resistance protein  28.34 
 
 		 1031 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677885  normal  0.0307662 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1703  acriflavin resistance protein  29.26 
 
 		 1087 aa  397  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  28.16 
 
 		 1048 aa  397  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1924  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.66 
 
 		 1091 aa  396  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1628  acriflavin resistance protein  29.4 
 
 		 1087 aa  396  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1703  acriflavin resistance protein  29.45 
 
 		 1087 aa  395  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1659  acriflavin resistance protein  28.34 
 
 		 1031 aa  396  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178159  normal  0.998047 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  28.48 
 
 		 1030 aa  396  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.56 
 
 		 1049 aa  390  1e-107  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.85 
 
 		 1024 aa  391  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2276  acriflavin resistance protein  28.89 
 
 		 1083 aa  392  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.440839  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  28.64 
 
 		 1023 aa  389  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2556  acriflavin resistance protein  29.09 
 
 		 1051 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2815  acriflavin resistance protein  28.81 
 
 		 1051 aa  389  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.874616  normal  0.995091 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2033  acriflavin resistance protein  28.83 
 
 		 1044 aa  385  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  27.03 
 
 		 1046 aa  385  1e-105  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1682  acriflavin resistance protein  27.39 
 
 		 1064 aa  385  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  28.23 
 
 		 1031 aa  386  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1037  acriflavin resistance protein  28.5 
 
 		 1036 aa  382  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1705  acriflavin resistance protein  28.05 
 
 		 1031 aa  383  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0236776  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  27.31 
 
 		 1034 aa  381  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  28.9 
 
 		 1036 aa  379  1e-103  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2094  acriflavin resistance protein  28.69 
 
 		 1037 aa  378  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2587  acriflavin resistance protein  28 
 
 		 1031 aa  379  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000412735  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2664  acriflavin resistance protein  27.91 
 
 		 1031 aa  380  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1797  acriflavin resistance protein  28 
 
 		 1031 aa  379  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0223723  hitchhiker  0.000000350495 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2549  acriflavin resistance protein  28 
 
 		 1031 aa  379  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0932297  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2283  acriflavin resistance protein  27.31 
 
 		 1051 aa  374  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2796  acriflavin resistance protein  29.31 
 
 		 1040 aa  375  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1020  acriflavin resistance protein  26.54 
 
 		 1037 aa  371  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000109455  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2109  acriflavin resistance protein  27.26 
 
 		 1044 aa  367  1e-100  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0175  acriflavin resistance protein  28.64 
 
 		 1046 aa  367  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.481543 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  28.53 
 
 		 1044 aa  370  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  28.2 
 
 		 1041 aa  368  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  27.54 
 
 		 1029 aa  367  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0778  acriflavin resistance protein  28.26 
 
 		 1040 aa  370  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.21707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1852  acriflavin resistance protein  28.38 
 
 		 1042 aa  370  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0174296  hitchhiker  0.000605557 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  27.25 
 
 		 1068 aa  367  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1816  acriflavin resistance protein  27.95 
 
 		 1023 aa  365  2e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.742902  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  28.32 
 
 		 1039 aa  366  2e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  26.98 
 
 		 1022 aa  365  3e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  26.48 
 
 		 1059 aa  365  3e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  28.88 
 
 		 1028 aa  364  4e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0277  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  28.49 
 
 		 1043 aa  364  5.0000000000000005e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0517386  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  28.02 
 
 		 1034 aa  363  7.0000000000000005e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1187  acriflavin resistance protein  27.71 
 
 		 1036 aa  363  7.0000000000000005e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.359485  normal  0.0265423 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3207  acriflavin resistance protein  26.65 
 
 		 1037 aa  363  7.0000000000000005e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0543905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  28.97 
 
 		 1036 aa  363  9e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2000  acriflavin resistance protein  28.71 
 
 		 1028 aa  362  2e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  27.36 
 
 		 1041 aa  362  2e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0291  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  28.39 
 
 		 1043 aa  362  3e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.601595  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  28.85 
 
 		 1470 aa  361  4e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  28.17 
 
 		 1044 aa  361  4e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  28.05 
 
 		 1055 aa  361  4e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2321  acriflavin resistance protein  29.24 
 
 		 1052 aa  361  5e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0273304 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  27.82 
 
 		 1496 aa  360  9.999999999999999e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  29.62 
 
 		 1039 aa  360  9.999999999999999e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  28.12 
 
 		 1028 aa  358  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1439  acriflavin resistance protein  28.1 
 
 		 1035 aa  358  2.9999999999999997e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.100841  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1611  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.37 
 
 		 1032 aa  357  6.999999999999999e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.651571  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  27.36 
 
 		 1041 aa  357  1e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1019  acriflavin resistance protein  27.04 
 
 		 1058 aa  356  1e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0342  acriflavin resistance protein  28.75 
 
 		 1050 aa  355  2e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.467499  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1029  acriflavin resistance protein  26.39 
 
 		 1034 aa  356  2e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.2741  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2000  acriflavin resistance protein  28.06 
 
 		 1024 aa  354  5e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.195138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  27.59 
 
 		 1038 aa  354  5.9999999999999994e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>