69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3031 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3031  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 205 aa  422  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3415  transcriptional regulator, TetR family  74.13 
 
 		 209 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52107  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0875  transcriptional regulator, TetR family  73.13 
 
 		 209 aa  307  6.999999999999999e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4739  TetR family transcriptional regulator  66.34 
 
 		 217 aa  273  1.0000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0210  TetR family transcriptional regulator  65.5 
 
 		 221 aa  267  7e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0546  TetR family transcriptional regulator  63.77 
 
 		 228 aa  266  1e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.62495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4006  TetR family transcriptional regulator  63.77 
 
 		 228 aa  266  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1654  hypothetical protein  53.68 
 
 		 338 aa  207  8e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.900303  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0699  hypothetical protein  53.68 
 
 		 338 aa  207  8e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.299256  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0589  hypothetical protein  53.68 
 
 		 341 aa  207  8e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.684153  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0516  TetR family transcriptional regulator  53.68 
 
 		 378 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.477479  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2007  TetR family transcriptional regulator  53.68 
 
 		 341 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.820101  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2102  TetR family transcriptional regulator  53.68 
 
 		 333 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0307267  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0758.1  hypothetical protein  53.68 
 
 		 773 aa  205  5e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0885  TetR family transcriptional regulator  53.51 
 
 		 340 aa  202  4e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4990  transcriptional regulator, TetR family  48.97 
 
 		 212 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.613992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5857  TetR family transcriptional regulator  52.6 
 
 		 220 aa  180  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2789  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.384058 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3112  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1922  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0515657  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2537  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 87 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 231 aa  49.3  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 181 aa  47.8  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5092  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.193405 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3481  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 189 aa  46.2  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.148181  normal  0.311825 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1772  TetR family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 202 aa  45.8  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.706828  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2776  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 206 aa  45.4  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 242 aa  45.1  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5083  putative transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 189 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 497 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  37.08 
 
 		 264 aa  43.9  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2186  regulatory protein, TetR  42.86 
 
 		 237 aa  44.7  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1994  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 173 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.187018  normal  0.996586 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2004  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2013  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 173 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2059  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 173 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.045167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5999  transcriptional regulator, TetR family  39.51 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2182  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 207 aa  43.1  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1492  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 200 aa  43.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 188 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 221 aa  42.7  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 226 aa  42.7  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 235 aa  42.7  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 193 aa  42.4  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 220 aa  42.4  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 236 aa  42.4  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 214 aa  42  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  38.46 
 
 		 190 aa  42  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 		 207 aa  42  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4400  regulatory protein TetR  31.94 
 
 		 184 aa  42  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37010  transcriptional regulator  40.35 
 
 		 195 aa  42  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 199 aa  42  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3745  transcriptional regulator, TetR family  28.46 
 
 		 201 aa  42  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 245 aa  41.6  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6234  transcriptional regulator, TetR family  23.3 
 
 		 214 aa  42  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.662077  normal  0.711722 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3645  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 199 aa  41.6  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.529358  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 247 aa  41.6  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 173 aa  41.6  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 203 aa  41.6  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 225 aa  41.6  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2479  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 230 aa  41.6  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  41.18 
 
 		 197 aa  41.6  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 208 aa  41.6  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  24.61 
 
 		 205 aa  41.6  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  25.89 
 
 		 194 aa  41.6  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0202  putative transcriptional regulator, TetR family  26.49 
 
 		 195 aa  41.6  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0928  transcriptional regulator, TetR family  35.65 
 
 		 184 aa  41.2  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312785  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>