101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2162 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2162  hypothetical protein  100 
 
 		 414 aa  862    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4090  hypothetical protein  58.15 
 
 		 414 aa  499  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.572464  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4142  hypothetical protein  58.15 
 
 		 414 aa  498  1e-140  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.16964  normal  0.023954 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0072  hypothetical protein  58.15 
 
 		 414 aa  498  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0416  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.27 
 
 		 726 aa  322  9.999999999999999e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0147603  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1007  hypothetical protein  33.82 
 
 		 427 aa  225  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0344  phosphoribosylglycinamide synthetase  32.94 
 
 		 424 aa  197  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37283  predicted protein  33.41 
 
 		 1033 aa  196  6e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2432  hypothetical protein  32.94 
 
 		 430 aa  194  2e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5515  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.66 
 
 		 422 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.330375  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5879  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.66 
 
 		 422 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521142  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6388  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.41 
 
 		 422 aa  186  9e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.357309  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0996  phosphoribosylglycinamide synthetase  30.73 
 
 		 541 aa  184  2.0000000000000003e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037072 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0875  hypothetical protein  31.08 
 
 		 420 aa  165  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0240  hypothetical protein  28.85 
 
 		 410 aa  151  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0240  hypothetical protein  28.61 
 
 		 410 aa  151  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2135  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.47 
 
 		 412 aa  151  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165665  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44930  predicted protein  25.41 
 
 		 575 aa  108  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.541672  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0912  biotin carboxylase-like protein  25.18 
 
 		 410 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.527326 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  31.68 
 
 		 407 aa  77.8  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  25.66 
 
 		 407 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  25.66 
 
 		 407 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  24.14 
 
 		 411 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.02 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2668  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.24 
 
 		 415 aa  69.7  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2144  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.61 
 
 		 416 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4500  Cysteine synthase  26.8 
 
 		 756 aa  64.7  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.632569  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6150  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  28.92 
 
 		 410 aa  62.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.639194 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2663  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  24.42 
 
 		 413 aa  62  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1514  hypothetical protein  25.12 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2428  protein of unknown function DUF201  22.25 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.281403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  25.73 
 
 		 924 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1432  hypothetical protein  27.1 
 
 		 424 aa  59.7  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  26.36 
 
 		 437 aa  59.7  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  25.51 
 
 		 926 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2440  biotin carboxylase-like  25.16 
 
 		 424 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  25.1 
 
 		 904 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  25.1 
 
 		 904 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  29.03 
 
 		 896 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  29.03 
 
 		 894 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2507  argininosuccinate lyase  29.03 
 
 		 912 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.3 
 
 		 418 aa  57.4  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0730  hypothetical protein  22.22 
 
 		 436 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  25.73 
 
 		 891 aa  56.2  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1518  protein of unknown function DUF201  26.75 
 
 		 424 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  24.87 
 
 		 399 aa  55.8  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1423  protein of unknown function DUF201  26.75 
 
 		 424 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2595  putative carbamoyl-phosphate-synthetase  25.64 
 
 		 398 aa  54.7  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.605395  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0418  hypothetical protein  28.57 
 
 		 411 aa  54.3  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2438  hypothetical protein  31.45 
 
 		 410 aa  53.9  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7724  putative biotin carboxylase  25.99 
 
 		 430 aa  53.5  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0619  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.64 
 
 		 410 aa  53.9  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241949  hitchhiker  0.00233057 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3242  hypothetical protein  25.11 
 
 		 432 aa  52.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0194  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  24.18 
 
 		 419 aa  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  0.160479 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0200  hypothetical protein  21.11 
 
 		 405 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214933  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3093  hypothetical protein  28 
 
 		 440 aa  51.6  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2737  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  21.89 
 
 		 723 aa  51.2  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37420  biotin carboxylase  20.58 
 
 		 405 aa  50.8  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1913  phosphoribosylamine/glycine ligase  26.23 
 
 		 417 aa  50.4  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3626  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  25.2 
 
 		 432 aa  50.4  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4069  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  22.76 
 
 		 389 aa  50.1  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  25.52 
 
 		 425 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0754  protein of unknown function DUF201  18.78 
 
 		 409 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6148  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  23.81 
 
 		 408 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.631903 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6149  hypothetical protein  24.91 
 
 		 441 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.669475 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3552  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein  23.79 
 
 		 373 aa  48.9  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138111  normal  0.272734 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4856  protein of unknown function DUF201  26.45 
 
 		 396 aa  48.9  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09340  hypothetical protein  26.84 
 
 		 399 aa  48.5  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.035454  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33390  biotin carboxylase  22.52 
 
 		 428 aa  48.9  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1929  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  22.78 
 
 		 411 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0755  protein of unknown function DUF201  22.16 
 
 		 398 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2914  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.84 
 
 		 1070 aa  47.8  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2148  hypothetical protein  22.13 
 
 		 414 aa  47.4  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1775  phosphoribosylamine--glycine ligase  25.68 
 
 		 412 aa  47.4  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2523  phosphoribosylamine--glycine ligase  26.4 
 
 		 422 aa  46.6  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5090  hypothetical protein  21.4 
 
 		 453 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5770  hypothetical protein  21.4 
 
 		 453 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0282385 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0784  phosphoribosylamine--glycine ligase  25 
 
 		 422 aa  46.2  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110869  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5518  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.14 
 
 		 403 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.398662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5882  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.14 
 
 		 403 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.47867 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0421  hypothetical protein  22.36 
 
 		 321 aa  45.8  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1588  D-alanyl-alanine synthetase A  25 
 
 		 316 aa  46.2  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000341303  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0449  putative glycolate oxidase  25.97 
 
 		 404 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.55 
 
 		 420 aa  45.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4648  protein of unknown function DUF201  24.89 
 
 		 404 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.896666  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1238  phosphoribosylamine--glycine ligase  27.21 
 
 		 425 aa  44.7  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01931  vibrioferrin biosynthesis protein PvsA  26.5 
 
 		 399 aa  45.1  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0021  hypothetical protein  24.37 
 
 		 382 aa  44.3  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14410  carbamoylphosphate synthase large subunit  26.36 
 
 		 423 aa  44.3  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4068  hypothetical protein  26.49 
 
 		 413 aa  43.9  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6391  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.84 
 
 		 403 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.782672  normal  0.167257 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  25.45 
 
 		 425 aa  44.3  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1498  biotin carboxylase-like  28.5 
 
 		 428 aa  43.5  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0127  phosphoribosylamine/glycine ligase  26.7 
 
 		 413 aa  43.5  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2969  hypothetical protein  25.53 
 
 		 402 aa  43.9  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0202  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  22.76 
 
 		 388 aa  43.5  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1388  hypothetical protein  21.97 
 
 		 395 aa  43.1  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0177  hypothetical protein  24.6 
 
 		 411 aa  43.1  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1444  phosphoribosylamine/glycine ligase  29.63 
 
 		 420 aa  43.5  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0010  hypothetical protein  26.67 
 
 		 392 aa  43.1  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  decreased coverage  0.00788782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>