89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3648 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3648  hypothetical protein  100 
 
 
265 aa  548  1e-155  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3520  hypothetical protein  70.04 
 
 
256 aa  346  3e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0409  hypothetical protein  63.88 
 
 
263 aa  342  2.9999999999999997e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0490  hypothetical protein  63.95 
 
 
260 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4781  putative restriction endonuclease  41.02 
 
 
255 aa  199  5e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0062  putative restriction endonuclease  39.04 
 
 
257 aa  185  7e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2006  hypothetical protein  43.51 
 
 
253 aa  167  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.398772  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4171  putative restriction endonuclease  36.25 
 
 
257 aa  159  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118239  normal  0.3128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5044  hypothetical protein  33.2 
 
 
257 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.899608 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1360  hypothetical protein  29.86 
 
 
298 aa  115  6e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0271  putative restriction endonuclease  39.1 
 
 
268 aa  85.5  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.788002  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6046  hypothetical protein  42.65 
 
 
313 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1104  hypothetical protein  42.17 
 
 
345 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1054  hypothetical protein  44.57 
 
 
375 aa  79.3  0.00000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.09564  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0209  hypothetical protein  37.82 
 
 
315 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.179579  hitchhiker  0.00000108217 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1677  hypothetical protein  37.4 
 
 
291 aa  77  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4900  HNH nuclease  34.78 
 
 
291 aa  77  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1523  putative restriction endonuclease  49.38 
 
 
258 aa  76.6  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.74121  normal  0.0967794 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3691  hypothetical protein  36.03 
 
 
290 aa  76.3  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.905474  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4825  HNH nuclease  33.54 
 
 
291 aa  75.5  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4613  hypothetical protein  39.44 
 
 
277 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000441366 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2664  hypothetical protein  36.25 
 
 
252 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.945475  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0358  putative restriction endonuclease  44.32 
 
 
265 aa  73.2  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3543  hypothetical protein  36.36 
 
 
462 aa  73.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1177  restriction endonuclease-like protein  30.06 
 
 
314 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03602  hypothetical protein  35.07 
 
 
256 aa  73.2  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0501  restriction endonuclease  39.33 
 
 
295 aa  72.8  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4906  hypothetical protein  35.77 
 
 
290 aa  72.4  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2246  hypothetical protein  43.18 
 
 
323 aa  72.4  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0492047 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3243  hypothetical protein  36.36 
 
 
180 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4818  hypothetical protein  35.77 
 
 
290 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4533  hypothetical protein  35.77 
 
 
290 aa  72.4  0.000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00606682  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1468  hypothetical protein  43.68 
 
 
304 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.978213  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0481  hypothetical protein  35.77 
 
 
297 aa  71.6  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1267  hypothetical protein  42.53 
 
 
304 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5799  HNH nuclease  37.27 
 
 
283 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.249192  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8704  restriction endonuclease  36.29 
 
 
318 aa  68.9  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0146  hypothetical protein  30.94 
 
 
279 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5076  HNH nuclease  32.43 
 
 
290 aa  68.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2459  restriction endonuclease-like protein  24.88 
 
 
318 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0175776 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4521  hypothetical protein  40.91 
 
 
328 aa  67.8  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4893  hypothetical protein  35.56 
 
 
259 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3983  hypothetical protein  44.32 
 
 
323 aa  66.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.612254 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4706  hypothetical protein  40.24 
 
 
311 aa  64.7  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0127144  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0825  hypothetical protein  35.43 
 
 
272 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.98901 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2314  HNH nuclease  33.33 
 
 
289 aa  64.7  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2980  hypothetical protein  35.11 
 
 
308 aa  63.5  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0911  restriction endonuclease  27.64 
 
 
313 aa  63.2  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3777  hypothetical protein  29.75 
 
 
299 aa  62.4  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.298649  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0191  hypothetical protein  33.59 
 
 
308 aa  61.6  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.314917 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1194  hypothetical protein  33.59 
 
 
308 aa  61.6  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3390  restriction endonuclease-like protein  28.81 
 
 
496 aa  61.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0757  hypothetical protein  34.13 
 
 
358 aa  60.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3867  restriction endonuclease-like  28.22 
 
 
309 aa  59.7  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6007  putative restriction endonuclease  40.51 
 
 
334 aa  60.1  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3143  TPR repeat-containing protein  33.63 
 
 
424 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.34299  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1314  restriction endonuclease-like protein  46.75 
 
 
313 aa  59.7  0.00000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.173564  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3245  hypothetical protein  32.61 
 
 
271 aa  59.7  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3723  hypothetical protein  32.77 
 
 
304 aa  59.3  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0625  hypothetical protein  31.9 
 
 
282 aa  59.3  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4688  restriction endonuclease  32.8 
 
 
319 aa  57  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0467865 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1547  restriction endonuclease  31.25 
 
 
303 aa  56.6  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.337245  normal  0.907295 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0822  HNH nuclease  28.69 
 
 
326 aa  55.8  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499026 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3262  hypothetical protein  32.17 
 
 
297 aa  55.5  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4880  hypothetical protein  31.16 
 
 
299 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0295  restriction endonuclease  29.13 
 
 
374 aa  54.3  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.810587  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0581  HNH nuclease  27.69 
 
 
323 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.351776  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3975  restriction endonuclease-like protein  29.84 
 
 
309 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3178  restriction endonuclease-like protein  31.67 
 
 
213 aa  53.1  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2373  restriction endonuclease-like protein  28.46 
 
 
333 aa  53.1  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000067766 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0008  HNH endonuclease  28.32 
 
 
249 aa  53.5  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  unclonable  0.000000000312042  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1252  restriction endonuclease  29.84 
 
 
306 aa  53.1  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0119722  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7809  hypothetical protein  30.95 
 
 
298 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0511642  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1364  HNH endonuclease family protein  26.61 
 
 
326 aa  50.4  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.163097  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1002  HNH nuclease  27.27 
 
 
326 aa  49.7  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2247  restriction endonuclease  39.24 
 
 
304 aa  48.5  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426721  normal  0.10352 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1849  hypothetical protein  29.27 
 
 
304 aa  48.5  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00822295  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4010  restriction endonuclease-like protein  26.61 
 
 
315 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6652  hypothetical protein  33.09 
 
 
307 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.9585  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3387  hypothetical protein  27.1 
 
 
262 aa  47.4  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0273  hypothetical protein  36.67 
 
 
416 aa  47  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.542742  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00960  hypothetical protein  39.73 
 
 
318 aa  45.8  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1724  hypothetical protein  24.69 
 
 
309 aa  45.8  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.589368  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3271  hypothetical protein  39.47 
 
 
231 aa  45.4  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0565  hypothetical protein  32.06 
 
 
322 aa  44.3  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0090  hypothetical protein  47.37 
 
 
59 aa  44.3  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3186  restriction endonuclease-like protein  28.57 
 
 
326 aa  43.5  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6708  hypothetical protein  31.52 
 
 
376 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.292072 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2553  hypothetical protein  22.58 
 
 
293 aa  43.1  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.120294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>