More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2569 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2569  pentapeptide repeat protein  100 
 
 
160 aa  315  2e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  34.87 
 
 
903 aa  91.3  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  33.1 
 
 
245 aa  77.8  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  35.42 
 
 
447 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  34.9 
 
 
900 aa  75.1  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  33.76 
 
 
447 aa  74.3  0.0000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 
309 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  39.52 
 
 
225 aa  70.5  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  30.82 
 
 
446 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  35.94 
 
 
727 aa  69.3  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  35.48 
 
 
278 aa  69.3  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  34.11 
 
 
189 aa  68.6  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  36.07 
 
 
567 aa  68.6  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  36.5 
 
 
456 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  29.09 
 
 
263 aa  68.6  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  35.34 
 
 
260 aa  67.8  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  36.36 
 
 
408 aa  67.4  0.00000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  33.11 
 
 
204 aa  66.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4336  pentapeptide repeat-containing protein  34.15 
 
 
187 aa  65.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.789922  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  31.82 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 
267 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  37.9 
 
 
266 aa  65.1  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  32.9 
 
 
441 aa  65.1  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.66 
 
 
14916 aa  65.1  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4093  pentapeptide repeat-containing protein  35.78 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864447  normal  0.810345 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  31.82 
 
 
745 aa  64.7  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  33.81 
 
 
174 aa  63.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  33.63 
 
 
734 aa  63.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  28.12 
 
 
381 aa  63.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  33.57 
 
 
286 aa  63.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2974  effector protein pipB2  31.5 
 
 
366 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.16662 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  34.81 
 
 
862 aa  63.5  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2921  effector protein pipB2  31.58 
 
 
366 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347087  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  31.85 
 
 
219 aa  62.8  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4550  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  37.86 
 
 
526 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154716  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  37.5 
 
 
176 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  34.06 
 
 
268 aa  62.8  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  32.58 
 
 
489 aa  62.8  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  37.5 
 
 
176 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2150  hypothetical protein  30.08 
 
 
313 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.248984 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0318  pentapeptide repeat-containing protein  28.26 
 
 
452 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  36 
 
 
517 aa  62  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  35.2 
 
 
213 aa  62  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  32.82 
 
 
336 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  32.82 
 
 
336 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4923  Serine/threonine protein kinase  31.39 
 
 
524 aa  61.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  30.97 
 
 
450 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  31.37 
 
 
401 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5010  pentapeptide repeat protein  32.37 
 
 
204 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  34.51 
 
 
216 aa  61.6  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4194  pentapeptide repeat protein  32.12 
 
 
223 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.562882 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2673  serine/threonine protein kinase  35.4 
 
 
533 aa  61.2  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  30.07 
 
 
312 aa  61.2  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3418  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 
256 aa  61.2  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  31.37 
 
 
401 aa  61.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3077  effector protein pipB2  30.71 
 
 
366 aa  60.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  35.11 
 
 
521 aa  60.8  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  34.09 
 
 
485 aa  60.8  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2955  effector protein pipB2  30.71 
 
 
366 aa  60.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000403936 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  35.59 
 
 
214 aa  60.8  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  31.3 
 
 
452 aa  60.5  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  34.93 
 
 
291 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  31.11 
 
 
416 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  33.05 
 
 
576 aa  60.5  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  34.93 
 
 
291 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  34.72 
 
 
333 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  35.48 
 
 
264 aa  60.1  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0316  pentapeptide repeat-containing protein  36.84 
 
 
384 aa  59.7  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  33.57 
 
 
300 aa  59.7  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  34.62 
 
 
215 aa  59.3  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  34.09 
 
 
453 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2064  serine/threonine protein kinase  34.48 
 
 
540 aa  59.3  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  28.06 
 
 
309 aa  58.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  33.58 
 
 
870 aa  58.9  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  29.6 
 
 
215 aa  58.5  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2891  effector protein pipB2  29.32 
 
 
350 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  37.72 
 
 
448 aa  58.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1544  RDD domain-containing protein  30.77 
 
 
706 aa  58.9  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  34.13 
 
 
386 aa  58.5  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  30.66 
 
 
311 aa  58.2  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0203  pentapeptide repeat protein  31.78 
 
 
886 aa  58.2  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.713128  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  36.79 
 
 
493 aa  57.8  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  36.84 
 
 
234 aa  57.8  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  34.13 
 
 
449 aa  57.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  32 
 
 
363 aa  57.8  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  34.19 
 
 
401 aa  57.8  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  34.19 
 
 
401 aa  57.8  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  37.72 
 
 
180 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3090  hypothetical protein  34.78 
 
 
362 aa  57.4  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0391882  normal  0.0374194 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2440  pentapeptide repeat protein  33.66 
 
 
830 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  35.78 
 
 
332 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2304  pentapeptide repeat protein  31.19 
 
 
234 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  27.61 
 
 
412 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8605  pentapeptide repeat protein  28.57 
 
 
354 aa  57  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101304  normal  0.331567 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  33.94 
 
 
273 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2355  pentapeptide repeat protein  31.19 
 
 
234 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.390943  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1060  pentapeptide repeat-containing protein  35.24 
 
 
157 aa  55.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0113174  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  32.06 
 
 
294 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 
340 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  30.77 
 
 
442 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>